Protein–RNA interactions for Protein: Q53S48

ALF, STON1-GTF2A1L readthrough, humanhuman

Predictions only

Length 1,182 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ALFQ53S48 PNLDC1-202ENST00000392167 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
ALFQ53S48 AC007541.1-201ENST00000570282 1469 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
ALFQ53S48 NR6A1-205ENST00000487099 7031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
ALFQ53S48 MAPKAP1-202ENST00000350766 3256 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
ALFQ53S48 TNIP1-202ENST00000389378 2935 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.18
ALFQ53S48 INPP5B-201ENST00000373021 3934 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
ALFQ53S48 SMARCA4-201ENST00000344626 5392 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
ALFQ53S48 MSI2-201ENST00000284073 6364 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
ALFQ53S48 HMOX2-205ENST00000458134 1797 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.18
ALFQ53S48 REPIN1-202ENST00000425389 2876 ntAPPRIS P3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
ALFQ53S48 HMGXB3-202ENST00000503427 5275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
ALFQ53S48 WARS-232ENST00000556645 2508 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
ALFQ53S48 ATG10-202ENST00000355178 1438 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
ALFQ53S48 VWA2-203ENST00000603594 2600 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
ALFQ53S48 MUTYH-209ENST00000448481 1706 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ALFQ53S48 PITPNM2-208ENST00000542749 6660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ALFQ53S48 OGFRL1-201ENST00000370435 8391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ALFQ53S48 GAS2L2-201ENST00000604063 2661 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
ALFQ53S48 SEMA4C-201ENST00000305476 3545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ALFQ53S48 CCL25-201ENST00000253451 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
ALFQ53S48 LCE3E-201ENST00000368789 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ALFQ53S48 PKIG-202ENST00000372886 1180 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
ALFQ53S48 NQO2-203ENST00000380441 1021 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
ALFQ53S48 CCL25-203ENST00000390669 924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ALFQ53S48 KRTAP6-3-201ENST00000391624 636 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
ALFQ53S48 AC021188.1-201ENST00000421534 740 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
ALFQ53S48 DUSP13-205ENST00000464872 684 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
ALFQ53S48 CD81-207ENST00000481687 890 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
ALFQ53S48 C8orf88-201ENST00000517562 894 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
ALFQ53S48 CHMP4A-204ENST00000530996 967 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
ALFQ53S48 FAM212B-207ENST00000534365 1217 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
ALFQ53S48 AC190387.1-201ENST00000551683 408 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
ALFQ53S48 TUBB3-203ENST00000553967 736 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
ALFQ53S48 AL096870.1-201ENST00000555591 930 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.2■□□□□ 0.18
ALFQ53S48 OIP5-AS1-209ENST00000561226 775 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
ALFQ53S48 LINC01703-202ENST00000602806 595 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
ALFQ53S48 AC016727.1-203ENST00000603199 540 ntTSL 4 BASIC16.2■□□□□ 0.18
ALFQ53S48 DUSP13-212ENST00000605915 1015 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
ALFQ53S48 CPA1-201ENST00000011292 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ALFQ53S48 PROZ-202ENST00000375547 1488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ALFQ53S48 DDX55-203ENST00000421670 1574 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ALFQ53S48 MFSD4B-201ENST00000368847 5958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ALFQ53S48 EPS8-201ENST00000281172 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ALFQ53S48 AC012507.2-203ENST00000415628 1765 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
ALFQ53S48 NIPA2-204ENST00000398014 3130 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
ALFQ53S48 TUBB3-206ENST00000554444 1978 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
ALFQ53S48 CACNA1G-205ENST00000360761 7497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ALFQ53S48 DACT1-202ENST00000395153 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
ALFQ53S48 HAUS3-204ENST00000506763 3166 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
ALFQ53S48 ATRNL1-201ENST00000355044 8479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ALFQ53S48 DEK-201ENST00000244776 1441 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
ALFQ53S48 CDPF1-204ENST00000404744 1541 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
ALFQ53S48 SPAG9-205ENST00000505279 4659 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ALFQ53S48 SETD1B-201ENST00000267197 5772 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
ALFQ53S48 PGBD2-201ENST00000329291 2136 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ALFQ53S48 TRA2A-202ENST00000392502 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
ALFQ53S48 ZSCAN2-214ENST00000546148 2242 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
ALFQ53S48 DISC1-209ENST00000439617 7059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
ALFQ53S48 UBE2D1-204ENST00000615793 2621 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
ALFQ53S48 PXK-204ENST00000383716 3035 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ALFQ53S48 HNRNPLL-212ENST00000608859 3035 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
ALFQ53S48 SMIM13-202ENST00000416247 4688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ALFQ53S48 SMARCD1-202ENST00000394963 3658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ALFQ53S48 ATP2C1-224ENST00000533801 3690 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ALFQ53S48 APLP1-202ENST00000537454 2266 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
ALFQ53S48 ILF3-AS1-201ENST00000591501 1983 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
ALFQ53S48 SPATS1-201ENST00000288390 1354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ALFQ53S48 AC007326.5-201ENST00000640084 1382 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
ALFQ53S48 CALY-202ENST00000368555 783 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
ALFQ53S48 ING1-204ENST00000375775 1074 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ALFQ53S48 IDH3B-202ENST00000380851 1230 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ALFQ53S48 OSM-203ENST00000403463 464 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
ALFQ53S48 PIN1P1-201ENST00000412108 996 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
ALFQ53S48 TOMM22P5-201ENST00000416399 439 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
ALFQ53S48 BMP7-AS1-201ENST00000445956 436 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
ALFQ53S48 AL109811.2-201ENST00000447600 487 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
ALFQ53S48 PRSS48-202ENST00000455694 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ALFQ53S48 HSPB7-207ENST00000487046 844 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ALFQ53S48 API5-211ENST00000534695 560 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
ALFQ53S48 AC004803.1-204ENST00000543290 512 ntTSL 4 BASIC16.19■□□□□ 0.18
ALFQ53S48 CMC2-214ENST00000565925 640 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
ALFQ53S48 AC026471.2-201ENST00000569782 655 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
ALFQ53S48 AC129507.1-201ENST00000570711 1013 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
ALFQ53S48 AC007216.4-201ENST00000574364 562 ntTSL 4 BASIC16.19■□□□□ 0.18
ALFQ53S48 AL391069.4-201ENST00000609583 481 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
ALFQ53S48 AL158212.4-201ENST00000624062 1286 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
ALFQ53S48 SURF4-209ENST00000618229 3200 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
ALFQ53S48 FEM1B-201ENST00000306917 7122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ALFQ53S48 BTC-201ENST00000395743 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ALFQ53S48 DCAF11-217ENST00000559115 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ALFQ53S48 ZBTB17-216ENST00000537142 2511 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
ALFQ53S48 ANP32A-203ENST00000465139 2440 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ALFQ53S48 PGRMC2-207ENST00000520121 3785 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ALFQ53S48 OTUD7A-201ENST00000307050 10770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ALFQ53S48 SYBU-219ENST00000528647 2995 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
ALFQ53S48 TUBA3E-201ENST00000312988 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ALFQ53S48 HFE2-205ENST00000497365 1419 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ALFQ53S48 KL-201ENST00000380099 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ALFQ53S48 DHX40-202ENST00000425628 2255 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
ALFQ53S48 DYNLL2-201ENST00000579991 6805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.1 ms