Protein–RNA interactions for Protein: Q17RM4

CCDC142, Coiled-coil domain-containing protein 142, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC142Q17RM4 SLC2A10-201ENST00000359271 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
CCDC142Q17RM4 DBNDD1-202ENST00000304733 2081 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
CCDC142Q17RM4 SF3A2-201ENST00000221494 1963 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
CCDC142Q17RM4 SLC34A1-204ENST00000512593 1912 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
CCDC142Q17RM4 ASB10-201ENST00000275838 1820 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
CCDC142Q17RM4 C9orf78-201ENST00000372447 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
CCDC142Q17RM4 TMEM150A-203ENST00000409668 1776 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
CCDC142Q17RM4 LMNA-203ENST00000368297 1679 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
CCDC142Q17RM4 GOLM1-203ENST00000388712 3046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
CCDC142Q17RM4 DUSP8-202ENST00000397374 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
CCDC142Q17RM4 SALL3-206ENST00000616649 2958 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
CCDC142Q17RM4 SLC3A2-208ENST00000536981 1486 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
CCDC142Q17RM4 RIBC2-202ENST00000614167 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
CCDC142Q17RM4 RBPMS-204ENST00000397323 2941 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
CCDC142Q17RM4 BRF1-206ENST00000446501 2858 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
CCDC142Q17RM4 PCDHB6-202ENST00000622991 2608 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
CCDC142Q17RM4 ACTA1-201ENST00000366683 1122 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
CCDC142Q17RM4 NDUFB8-202ENST00000370320 684 ntTSL 3 BASIC16.82■□□□□ 0.28
CCDC142Q17RM4 TRIM74-202ENST00000395244 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
CCDC142Q17RM4 BMP7-AS1-201ENST00000445956 436 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
CCDC142Q17RM4 TRIM73-204ENST00000447409 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
CCDC142Q17RM4 PDCD6-202ENST00000505221 672 ntTSL 3 BASIC16.82■□□□□ 0.28
CCDC142Q17RM4 C5orf66-202ENST00000507641 547 ntTSL 3 BASIC16.82■□□□□ 0.28
CCDC142Q17RM4 RBM7-207ENST00000544582 692 ntTSL 3 BASIC16.82■□□□□ 0.28
CCDC142Q17RM4 SLC8B1-206ENST00000549069 1058 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
CCDC142Q17RM4 AL391069.4-201ENST00000609583 481 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
CCDC142Q17RM4 BARD1-209ENST00000613192 703 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
CCDC142Q17RM4 DBI-211ENST00000627093 554 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
CCDC142Q17RM4 ADARB2-203ENST00000381312 8421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
CCDC142Q17RM4 ATP6AP2-217ENST00000636580 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
CCDC142Q17RM4 PLTP-205ENST00000477313 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
CCDC142Q17RM4 YY1-201ENST00000262238 6697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
CCDC142Q17RM4 AL158154.2-201ENST00000585776 2208 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
CCDC142Q17RM4 PCBP4-205ENST00000461554 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
CCDC142Q17RM4 PPP1R21-202ENST00000294952 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
CCDC142Q17RM4 ADGRA1-203ENST00000607359 6004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
CCDC142Q17RM4 MBD1-202ENST00000269471 2980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
CCDC142Q17RM4 SLC12A5-209ENST00000616201 2955 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
CCDC142Q17RM4 MGAT1-201ENST00000307826 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
CCDC142Q17RM4 PEX6-202ENST00000304611 3478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
CCDC142Q17RM4 AC096667.1-201ENST00000640078 3465 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
CCDC142Q17RM4 C5orf24-202ENST00000394976 5065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
CCDC142Q17RM4 CCT7-216ENST00000540468 1674 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
CCDC142Q17RM4 AC009802.1-201ENST00000637973 1609 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
CCDC142Q17RM4 C19orf48-201ENST00000345523 1503 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
CCDC142Q17RM4 POMK-203ENST00000614426 1527 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.81■□□□□ 0.28
CCDC142Q17RM4 GBA2-203ENST00000378103 3611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
CCDC142Q17RM4 OXA1L-203ENST00000412791 1440 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
CCDC142Q17RM4 DDC-202ENST00000380984 1366 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
CCDC142Q17RM4 DNAJA4-206ENST00000446172 1399 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
CCDC142Q17RM4 IDH3G-212ENST00000619865 1339 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
CCDC142Q17RM4 TJP2-202ENST00000377245 4611 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
CCDC142Q17RM4 RAI1-207ENST00000640861 5172 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
CCDC142Q17RM4 VCX2-201ENST00000317103 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
CCDC142Q17RM4 PKIG-202ENST00000372886 1180 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
CCDC142Q17RM4 TRAPPC3-203ENST00000373163 951 ntTSL 3 BASIC16.81■□□□□ 0.28
CCDC142Q17RM4 SDHB-201ENST00000375499 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
CCDC142Q17RM4 AC136604.1-201ENST00000418535 575 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
CCDC142Q17RM4 PABPN1L-202ENST00000419291 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
CCDC142Q17RM4 DFFBP1-201ENST00000433250 979 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
CCDC142Q17RM4 RN7SL692P-201ENST00000464677 288 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
CCDC142Q17RM4 PRKAG2-AS1-202ENST00000467458 1064 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
CCDC142Q17RM4 AP002008.1-201ENST00000530283 1155 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
CCDC142Q17RM4 AC233702.7-201ENST00000536958 924 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
CCDC142Q17RM4 NDUFA4L2-206ENST00000556732 883 ntTSL 3 BASIC16.81■□□□□ 0.28
CCDC142Q17RM4 AL596325.1-201ENST00000563991 1082 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
CCDC142Q17RM4 TP53TG3HP-202ENST00000569755 579 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
CCDC142Q17RM4 MIR4313-201ENST00000580760 101 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
CCDC142Q17RM4 CECR7-204ENST00000609932 568 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
CCDC142Q17RM4 VCX-203ENST00000620630 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
CCDC142Q17RM4 AKTIP-202ENST00000394657 2426 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
CCDC142Q17RM4 IFT140-201ENST00000361339 2987 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
CCDC142Q17RM4 ARHGEF1-204ENST00000378152 2986 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
CCDC142Q17RM4 HOXD3-202ENST00000410016 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
CCDC142Q17RM4 HMOX2-205ENST00000458134 1797 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
CCDC142Q17RM4 ADAMTSL4-204ENST00000369041 2908 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
CCDC142Q17RM4 SNAP47-AS1-201ENST00000413347 1708 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
CCDC142Q17RM4 LRIT1-201ENST00000372105 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
CCDC142Q17RM4 CRAT-201ENST00000318080 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
CCDC142Q17RM4 PRRT2-214ENST00000637064 2153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
CCDC142Q17RM4 PRKAR2B-201ENST00000265717 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
CCDC142Q17RM4 BANK1-207ENST00000508653 2115 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
CCDC142Q17RM4 TSC2-207ENST00000439673 5287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
CCDC142Q17RM4 SERPINF2-203ENST00000450523 1462 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
CCDC142Q17RM4 RASD2-201ENST00000216127 3412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CCDC142Q17RM4 CDK19-202ENST00000368911 6246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CCDC142Q17RM4 SLC9A6-203ENST00000370701 4755 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CCDC142Q17RM4 CLEC18A-203ENST00000449317 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
CCDC142Q17RM4 CCDC136-212ENST00000487361 2268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
CCDC142Q17RM4 STUM-201ENST00000366788 7705 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
CCDC142Q17RM4 ADD1-205ENST00000398125 4079 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
CCDC142Q17RM4 GHDC-201ENST00000301671 2650 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
CCDC142Q17RM4 GIMAP1-201ENST00000307194 4420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CCDC142Q17RM4 TM4SF19-201ENST00000273695 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CCDC142Q17RM4 AP001056.1-201ENST00000411956 821 ntTSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
CCDC142Q17RM4 HSPB7-207ENST00000487046 844 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CCDC142Q17RM4 RCHY1-210ENST00000513257 759 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CCDC142Q17RM4 AC009902.2-201ENST00000518880 620 ntTSL 4 BASIC16.8■□□□□ 0.28
CCDC142Q17RM4 LACTB2-203ENST00000522447 1034 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
CCDC142Q17RM4 YEATS4-202ENST00000548020 1100 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
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