Protein–RNA interactions for Protein: Q16849

PTPRN, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase-like N, humanhuman

Predictions only

Length 979 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRNQ16849 U91328.1-201ENST00000437528 223 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
PTPRNQ16849 ATP5G2P4-201ENST00000442175 420 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
PTPRNQ16849 AC073130.2-202ENST00000444244 842 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
PTPRNQ16849 KRT17P7-201ENST00000451704 1104 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
PTPRNQ16849 AL158825.2-201ENST00000455336 670 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
PTPRNQ16849 RN7SL752P-201ENST00000463779 287 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
PTPRNQ16849 RAB9A-202ENST00000464506 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PTPRNQ16849 MRNIP-212ENST00000520698 902 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
PTPRNQ16849 PNOC-204ENST00000522209 1007 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
PTPRNQ16849 TMEM218-210ENST00000529609 734 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
PTPRNQ16849 AC009163.1-201ENST00000530512 573 ntTSL 4 BASIC16.15■□□□□ 0.18
PTPRNQ16849 TMEM205-208ENST00000587948 688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
PTPRNQ16849 TMEM205-211ENST00000589555 788 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
PTPRNQ16849 AC239798.4-201ENST00000609879 700 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
PTPRNQ16849 SERF2-217ENST00000630046 862 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
PTPRNQ16849 TNKS1BP1-207ENST00000532437 5952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PTPRNQ16849 PAUPAR-201ENST00000630360 2965 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
PTPRNQ16849 C7orf31-201ENST00000283905 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PTPRNQ16849 UNG-201ENST00000242576 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PTPRNQ16849 KDM4B-203ENST00000536461 5027 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PTPRNQ16849 HIST1H2AC-203ENST00000602637 1462 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
PTPRNQ16849 CD34-202ENST00000356522 2874 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PTPRNQ16849 IGHA1-202ENST00000641837 1310 ntAPPRIS P5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
PTPRNQ16849 BMP2K-201ENST00000335016 3804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
PTPRNQ16849 MINDY1-201ENST00000312210 2400 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
PTPRNQ16849 LFNG-205ENST00000402506 2268 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
PTPRNQ16849 MMP2-201ENST00000219070 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PTPRNQ16849 ZNF789-201ENST00000331410 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
PTPRNQ16849 VASP-201ENST00000245932 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
PTPRNQ16849 IDH3B-201ENST00000380843 1545 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
PTPRNQ16849 PELP1-208ENST00000572293 5272 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PTPRNQ16849 EFEMP1-202ENST00000394555 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PTPRNQ16849 DCP1B-202ENST00000535873 2231 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
PTPRNQ16849 BAIAP2-219ENST00000575245 2229 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
PTPRNQ16849 PARVB-204ENST00000406477 1569 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PTPRNQ16849 TIMM44-201ENST00000270538 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PTPRNQ16849 DENR-201ENST00000280557 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PTPRNQ16849 BATF2-201ENST00000301887 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PTPRNQ16849 SCAND1-201ENST00000305978 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PTPRNQ16849 BANF1-201ENST00000312175 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PTPRNQ16849 LRRC30-201ENST00000383467 923 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
PTPRNQ16849 EEF1B2-202ENST00000392221 880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
PTPRNQ16849 TNFRSF14-202ENST00000409119 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
PTPRNQ16849 AL445931.1-201ENST00000412181 2112 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
PTPRNQ16849 ITPR1-AS1-201ENST00000412804 858 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
PTPRNQ16849 AC020915.1-202ENST00000427361 922 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
PTPRNQ16849 DICER1-AS1-202ENST00000439819 810 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
PTPRNQ16849 MOGAT3-203ENST00000440203 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
PTPRNQ16849 PHKG1P2-201ENST00000457537 863 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
PTPRNQ16849 AC147067.1-201ENST00000466692 579 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
PTPRNQ16849 LINC02447-202ENST00000501888 2146 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
PTPRNQ16849 MTND2P7-201ENST00000521337 640 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
PTPRNQ16849 IL32-215ENST00000529550 772 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
PTPRNQ16849 LINC02356-202ENST00000552663 314 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
PTPRNQ16849 AC132938.2-201ENST00000579188 680 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
PTPRNQ16849 COL26A1-203ENST00000613501 2970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PTPRNQ16849 AL158212.4-201ENST00000624062 1286 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
PTPRNQ16849 AL591163.1-201ENST00000641757 987 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
PTPRNQ16849 PURB-201ENST00000395699 9069 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
PTPRNQ16849 POR-218ENST00000461988 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PTPRNQ16849 PDE1C-201ENST00000321453 2898 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
PTPRNQ16849 CCT6A-201ENST00000275603 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PTPRNQ16849 NETO2-202ENST00000562435 7481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PTPRNQ16849 ERP29-203ENST00000546477 1698 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
PTPRNQ16849 PRKD2-216ENST00000601806 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
PTPRNQ16849 CRK-202ENST00000398970 3675 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PTPRNQ16849 COQ8B-202ENST00000324464 2443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PTPRNQ16849 AC012485.3-201ENST00000637634 2424 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
PTPRNQ16849 NDRG2-211ENST00000397858 2054 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
PTPRNQ16849 LTBR-201ENST00000228918 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PTPRNQ16849 GPR89B-201ENST00000314163 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PTPRNQ16849 TJP1-201ENST00000346128 7950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PTPRNQ16849 HPCAL1-207ENST00000620771 1941 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PTPRNQ16849 GCLM-201ENST00000370238 4857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PTPRNQ16849 CLCNKB-201ENST00000375667 2129 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PTPRNQ16849 CRAMP1-201ENST00000293925 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PTPRNQ16849 PIGP-207ENST00000464265 3437 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PTPRNQ16849 CYP2U1-201ENST00000332884 4944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PTPRNQ16849 C9orf78-201ENST00000372447 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PTPRNQ16849 ZNF574-202ENST00000359044 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PTPRNQ16849 TNIP1-202ENST00000389378 2935 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PTPRNQ16849 DEK-201ENST00000244776 1441 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PTPRNQ16849 MYRIP-202ENST00000396217 4877 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PTPRNQ16849 CAAP1-201ENST00000333916 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PTPRNQ16849 AC132872.4-202ENST00000622924 2756 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
PTPRNQ16849 GATA6-201ENST00000269216 3770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PTPRNQ16849 PHTF1-205ENST00000393357 3244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PTPRNQ16849 TOMM40-207ENST00000592434 3415 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PTPRNQ16849 TFF2-201ENST00000291526 737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PTPRNQ16849 ISCA1-201ENST00000311534 813 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PTPRNQ16849 SPATC1L-202ENST00000330205 1182 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PTPRNQ16849 PQLC3-202ENST00000402361 696 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PTPRNQ16849 AL161638.1-201ENST00000420354 481 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PTPRNQ16849 KRT18P64-201ENST00000434946 1219 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
PTPRNQ16849 HMGB2-203ENST00000446922 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PTPRNQ16849 AC124944.1-201ENST00000448113 625 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PTPRNQ16849 LINC01184-209ENST00000514573 609 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PTPRNQ16849 CSF1R-209ENST00000543093 921 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PTPRNQ16849 LINC02281-201ENST00000549013 375 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PTPRNQ16849 AC016727.1-204ENST00000578974 420 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.1 ms