Protein–RNA interactions for Protein: Q16822

PCK2, Phosphoenolpyruvate carboxykinase [GTP], mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 640 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCK2Q16822 PAGE5-201ENST00000289619 741 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
PCK2Q16822 OR52W1-201ENST00000311352 1114 ntAPPRIS P1 BASIC13.95□□□□□ -0.18
PCK2Q16822 CD37-201ENST00000323906 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
PCK2Q16822 LRRC28-202ENST00000331450 752 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
PCK2Q16822 C9orf116-202ENST00000371789 1278 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
PCK2Q16822 RNF186-201ENST00000375121 1250 ntAPPRIS P1 BASIC13.95□□□□□ -0.18
PCK2Q16822 TMEM239-202ENST00000380585 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
PCK2Q16822 TSSC4-202ENST00000380992 992 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
PCK2Q16822 NKIRAS1-204ENST00000416026 795 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC13.95□□□□□ -0.18
PCK2Q16822 AL359764.1-201ENST00000444330 504 ntTSL 3 BASIC13.95□□□□□ -0.18
PCK2Q16822 SERF1A-207ENST00000512649 846 ntTSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
PCK2Q16822 GATD1-206ENST00000526325 756 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
PCK2Q16822 AC116021.1-201ENST00000530049 653 ntTSL 3 BASIC13.95□□□□□ -0.18
PCK2Q16822 ALG1L8P-201ENST00000533887 760 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
PCK2Q16822 DCTPP1-203ENST00000567983 801 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
PCK2Q16822 AC022167.4-201ENST00000570290 498 ntTSL 3 BASIC13.95□□□□□ -0.18
PCK2Q16822 ARHGDIA-208ENST00000581876 709 ntTSL 3 BASIC13.95□□□□□ -0.18
PCK2Q16822 AC010503.2-201ENST00000599292 296 ntTSL 3 BASIC13.95□□□□□ -0.18
PCK2Q16822 GOLGA2-215ENST00000639983 1038 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
PCK2Q16822 AL136379.1-201ENST00000623471 2642 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
PCK2Q16822 CROCC-201ENST00000375541 6656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
PCK2Q16822 SPSB1-202ENST00000357898 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
PCK2Q16822 CALR-201ENST00000316448 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
PCK2Q16822 NUP88-207ENST00000573584 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
PCK2Q16822 FUT7-201ENST00000314412 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
PCK2Q16822 TNXB-209ENST00000613214 6842 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
PCK2Q16822 SEMA4C-201ENST00000305476 3545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
PCK2Q16822 CREB3L2-204ENST00000456390 2360 ntTSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
PCK2Q16822 AL353997.2-201ENST00000579352 4955 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
PCK2Q16822 PPP1R37-201ENST00000221462 3163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
PCK2Q16822 GLMP-213ENST00000612353 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
PCK2Q16822 GLMP-215ENST00000622703 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
PCK2Q16822 PXN-201ENST00000228307 3785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
PCK2Q16822 M6PR-202ENST00000536844 2305 ntTSL 3 BASIC13.95□□□□□ -0.18
PCK2Q16822 NIPAL4-201ENST00000311946 3274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
PCK2Q16822 MARCH2-208ENST00000602117 1667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
PCK2Q16822 AKAP12-201ENST00000253332 6597 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
PCK2Q16822 EIF2AK4-208ENST00000559624 3548 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
PCK2Q16822 TMEM225B-202ENST00000431679 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
PCK2Q16822 DDX1-201ENST00000233084 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
PCK2Q16822 UBE2J1-201ENST00000435041 4290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
PCK2Q16822 NFE2L2-201ENST00000397062 2853 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
PCK2Q16822 AC092718.8-201ENST00000640345 2892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
PCK2Q16822 PCGF2-206ENST00000618941 1499 ntTSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
PCK2Q16822 IL6ST-209ENST00000502326 3007 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
PCK2Q16822 C18orf25-203ENST00000615052 5462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
PCK2Q16822 PDGFRL-203ENST00000541323 1905 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
PCK2Q16822 TAOK3-201ENST00000392533 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
PCK2Q16822 MAD1L1-203ENST00000402746 2355 ntTSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
PCK2Q16822 FOLH1-202ENST00000340334 2697 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
PCK2Q16822 LINC01565-201ENST00000356020 2697 ntTSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
PCK2Q16822 CNKSR1-214ENST00000531191 2673 ntTSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
PCK2Q16822 CTDSP1-201ENST00000273062 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
PCK2Q16822 GPHB5-201ENST00000314140 393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
PCK2Q16822 CD82-202ENST00000342935 967 ntTSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
PCK2Q16822 YY1AP1-211ENST00000368340 2927 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
PCK2Q16822 MRNIP-202ENST00000376931 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
PCK2Q16822 PRKACG-201ENST00000377276 1585 ntAPPRIS P1 BASIC13.94□□□□□ -0.18
PCK2Q16822 FO393414.2-201ENST00000405153 598 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
PCK2Q16822 AL353705.2-201ENST00000428243 662 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
PCK2Q16822 PLAGL1-208ENST00000437412 2640 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
PCK2Q16822 DNAJB3-201ENST00000446806 729 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
PCK2Q16822 TMEM44-AS1-203ENST00000453671 1119 ntTSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
PCK2Q16822 AL022341.1-201ENST00000455294 389 ntTSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
PCK2Q16822 FXR1-221ENST00000491674 365 ntTSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
PCK2Q16822 C3orf67-212ENST00000491845 832 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
PCK2Q16822 TNIP1-219ENST00000524280 1716 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
PCK2Q16822 AC103736.1-203ENST00000524565 872 ntTSL 3 BASIC13.94□□□□□ -0.18
PCK2Q16822 PAK1-210ENST00000528203 1878 ntTSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
PCK2Q16822 CYP2R1-207ENST00000532378 1746 ntTSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
PCK2Q16822 TXNDC2-204ENST00000536353 1703 ntTSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
PCK2Q16822 TNFRSF13B-203ENST00000579315 600 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.94□□□□□ -0.18
PCK2Q16822 TWSG1-202ENST00000581641 1119 ntTSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
PCK2Q16822 AC007193.2-201ENST00000596807 472 ntTSL 3 BASIC13.94□□□□□ -0.18
PCK2Q16822 POFUT2-214ENST00000615172 2472 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
PCK2Q16822 HAUS2-211ENST00000639412 375 ntTSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
PCK2Q16822 TMED7-TICAM2-202ENST00000333314 3453 ntTSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
PCK2Q16822 PAX6-203ENST00000379109 3182 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
PCK2Q16822 TNRC18P2-201ENST00000417666 2714 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
PCK2Q16822 PODNL1-204ENST00000538517 2744 ntTSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
PCK2Q16822 LINC01267-201ENST00000502417 2284 ntTSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
PCK2Q16822 GJB6-202ENST00000356192 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
PCK2Q16822 ABTB1-202ENST00000453791 1961 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
PCK2Q16822 PMP22-209ENST00000612492 1822 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.94□□□□□ -0.18
PCK2Q16822 ZXDC-202ENST00000389709 3405 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
PCK2Q16822 SGSH-203ENST00000570923 1546 ntTSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
PCK2Q16822 GRK5-202ENST00000392870 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
PCK2Q16822 AP000439.3-201ENST00000545202 2376 ntTSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
PCK2Q16822 CNDP1-201ENST00000358821 2215 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
PCK2Q16822 EIF4G1-206ENST00000392537 5229 ntTSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
PCK2Q16822 GRIN3A-201ENST00000361820 7770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
PCK2Q16822 TVP23C-203ENST00000428082 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
PCK2Q16822 LSMEM2-201ENST00000316436 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
PCK2Q16822 FDPS-201ENST00000356657 1478 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
PCK2Q16822 RAPSN-203ENST00000524487 1462 ntTSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
PCK2Q16822 STAU2-219ENST00000522509 2173 ntTSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
PCK2Q16822 TMED1-201ENST00000214869 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
PCK2Q16822 DHRS4L2-205ENST00000543805 1334 ntTSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
PCK2Q16822 GPR161-202ENST00000367835 2400 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
PCK2Q16822 NIPAL3-204ENST00000374399 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.4 ms