Protein–RNA interactions for Protein: Q16740

CLPP, ATP-dependent Clp protease proteolytic subunit, mitochondrial, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 277 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLPPQ16740 MIER1-205ENST00000371014 1728 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CLPPQ16740 SHISA5-208ENST00000442747 2250 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CLPPQ16740 CDH15-201ENST00000289746 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CLPPQ16740 RHOT1-203ENST00000358365 3297 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CLPPQ16740 KCNQ2-204ENST00000359125 3253 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CLPPQ16740 TNRC18P2-201ENST00000417666 2714 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
CLPPQ16740 KLHL36-204ENST00000564996 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CLPPQ16740 SLC6A8-201ENST00000253122 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CLPPQ16740 TUBBP5-201ENST00000290377 1563 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CLPPQ16740 BNIP3P1-202ENST00000550043 1585 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
CLPPQ16740 TMEM222-210ENST00000608611 1511 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
CLPPQ16740 DPY19L2P4-202ENST00000497063 2018 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
CLPPQ16740 KIF1BP-214ENST00000638119 2537 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
CLPPQ16740 SPTBN4-212ENST00000598249 8070 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
CLPPQ16740 PXK-204ENST00000383716 3035 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
CLPPQ16740 TLE3-223ENST00000560939 3021 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
CLPPQ16740 KIAA1191-201ENST00000298569 2991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
CLPPQ16740 PLEKHG6-203ENST00000396988 2963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
CLPPQ16740 SLC40A1-201ENST00000261024 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
CLPPQ16740 GALNTL6-205ENST00000511251 2905 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
CLPPQ16740 CLIC5-202ENST00000339561 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
CLPPQ16740 SHANK1-201ENST00000293441 6643 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
CLPPQ16740 SMO-201ENST00000249373 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
CLPPQ16740 ING4-202ENST00000396807 1393 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
CLPPQ16740 KAZN-208ENST00000636203 6874 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
CLPPQ16740 CALHM2-202ENST00000369788 1843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
CLPPQ16740 STOML1-206ENST00000561656 1833 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
CLPPQ16740 ORAOV1-206ENST00000536870 2274 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
CLPPQ16740 PATZ1-203ENST00000351933 3638 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
CLPPQ16740 AC007920.1-201ENST00000356133 2674 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
CLPPQ16740 SALL3-201ENST00000536229 3997 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
CLPPQ16740 BEND4-202ENST00000504360 8692 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
CLPPQ16740 C16orf71-204ENST00000590191 2564 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
CLPPQ16740 PMS1-221ENST00000624204 3417 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
CLPPQ16740 PRPF31-201ENST00000321030 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
CLPPQ16740 S100A16-202ENST00000368704 1146 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
CLPPQ16740 IGHV3-7-201ENST00000390598 430 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.04
CLPPQ16740 NCBP2-203ENST00000422610 676 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
CLPPQ16740 RPL28-204ENST00000431533 590 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
CLPPQ16740 KRT43P-201ENST00000434019 910 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
CLPPQ16740 TARDBPP1-201ENST00000442013 1203 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
CLPPQ16740 USP40-206ENST00000443711 628 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
CLPPQ16740 NUTM2A-AS1-212ENST00000458739 733 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
CLPPQ16740 LCN10-203ENST00000474369 564 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
CLPPQ16740 PTPRG-AS1-205ENST00000475371 733 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
CLPPQ16740 LINC01336-201ENST00000503568 534 ntTSL 4 BASIC15.27■□□□□ 0.04
CLPPQ16740 MUTYH-237ENST00000531105 501 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
CLPPQ16740 ENPP7P5-201ENST00000541031 1031 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
CLPPQ16740 AP3S2-204ENST00000558011 738 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
CLPPQ16740 RPL28-206ENST00000558752 671 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
CLPPQ16740 AP005482.1-201ENST00000563722 1273 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
CLPPQ16740 TMEM170A-203ENST00000566980 547 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
CLPPQ16740 GADD45B-204ENST00000587345 765 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
CLPPQ16740 AC133539.2-201ENST00000604757 467 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
CLPPQ16740 LINC01115-203ENST00000606068 577 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
CLPPQ16740 Metazoa_SRP.80-201ENST00000619894 320 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
CLPPQ16740 SERF2-217ENST00000630046 862 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
CLPPQ16740 CCDC181-206ENST00000491570 1652 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
CLPPQ16740 CRLF2-203ENST00000400841 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
CLPPQ16740 KRT85-201ENST00000257901 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
CLPPQ16740 TOM1-210ENST00000449058 2389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
CLPPQ16740 HARS2-206ENST00000508522 1562 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
CLPPQ16740 THSD4-201ENST00000261862 3133 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
CLPPQ16740 MEI1-215ENST00000540833 2326 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
CLPPQ16740 SH2D3C-205ENST00000420366 2682 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
CLPPQ16740 PPM1H-201ENST00000228705 6353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
CLPPQ16740 RCOR2-201ENST00000301459 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
CLPPQ16740 PYCR1-201ENST00000329875 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
CLPPQ16740 AL163636.2-201ENST00000553909 1498 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
CLPPQ16740 PRAL-201ENST00000624952 3286 ntBASIC15.27■□□□□ 0.03
CLPPQ16740 NUCB1-202ENST00000407032 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
CLPPQ16740 PCM1-206ENST00000518537 2171 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CLPPQ16740 SLC18A1-203ENST00000381608 1419 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
CLPPQ16740 SIGLEC11-202ENST00000426971 2479 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CLPPQ16740 EML1-201ENST00000262233 4535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CLPPQ16740 MED20-201ENST00000265350 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CLPPQ16740 AMMECR1-201ENST00000262844 5504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CLPPQ16740 ITPKB-201ENST00000272117 5822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CLPPQ16740 GLUL-201ENST00000311223 4719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CLPPQ16740 IDH3G-203ENST00000370093 1662 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
CLPPQ16740 LMF2-201ENST00000216080 2658 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
CLPPQ16740 EIF3K-203ENST00000545173 1327 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
CLPPQ16740 TTLL10-202ENST00000379289 2259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
CLPPQ16740 CLYBL-203ENST00000376355 6771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
CLPPQ16740 GBGT1-204ENST00000372043 1935 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
CLPPQ16740 RETN-201ENST00000221515 520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CLPPQ16740 NPY-201ENST00000242152 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CLPPQ16740 NNAT-202ENST00000346199 1209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CLPPQ16740 KRTAP10-1-201ENST00000400375 1215 ntAPPRIS P1 BASIC15.26■□□□□ 0.03
CLPPQ16740 ECSIT-203ENST00000417981 970 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
CLPPQ16740 AC136604.1-201ENST00000418535 575 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
CLPPQ16740 AC112492.5-201ENST00000421897 457 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
CLPPQ16740 AC007274.1-201ENST00000439805 662 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
CLPPQ16740 ZMYND10-AS1-201ENST00000440013 250 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
CLPPQ16740 AC234783.1-201ENST00000441761 496 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
CLPPQ16740 RHOXF1P1-201ENST00000454625 772 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
CLPPQ16740 PHKG1P2-201ENST00000457537 863 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
CLPPQ16740 AL513217.1-202ENST00000458139 600 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
CLPPQ16740 IP6K1-203ENST00000460540 1260 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
CLPPQ16740 AC084864.1-201ENST00000496217 305 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
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