Protein–RNA interactions for Protein: Q16610

ECM1, Extracellular matrix protein 1, humanhuman

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Length 540 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ECM1Q16610 STIP1-201ENST00000305218 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
ECM1Q16610 MRPL49-201ENST00000279242 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
ECM1Q16610 FAM49B-201ENST00000401979 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
ECM1Q16610 PRICKLE1-211ENST00000639566 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
ECM1Q16610 ZNF286A-204ENST00000464847 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
ECM1Q16610 AHCY-201ENST00000217426 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
ECM1Q16610 GNG2-213ENST00000556766 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
ECM1Q16610 TCOF1-206ENST00000445265 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
ECM1Q16610 MCM4-201ENST00000262105 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
ECM1Q16610 ZNF197-203ENST00000383744 1989 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
ECM1Q16610 TGOLN2-205ENST00000409232 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
ECM1Q16610 PRKAG3-206ENST00000529249 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
ECM1Q16610 DPEP1-201ENST00000261615 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
ECM1Q16610 CEACAM16-201ENST00000405314 1583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
ECM1Q16610 CTSA-202ENST00000354880 1820 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
ECM1Q16610 DENND3-201ENST00000262585 5438 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
ECM1Q16610 C2CD4A-201ENST00000355522 3445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
ECM1Q16610 C3orf67-201ENST00000295966 2650 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
ECM1Q16610 RAD51-201ENST00000267868 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
ECM1Q16610 TSNARE1-201ENST00000307180 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
ECM1Q16610 APBB1-218ENST00000608655 1920 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
ECM1Q16610 SPIB-201ENST00000270632 1443 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
ECM1Q16610 ACE-204ENST00000428043 5120 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
ECM1Q16610 TBC1D22A-205ENST00000406733 2267 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
ECM1Q16610 CACNA1A-227ENST00000636549 6792 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
ECM1Q16610 MSC-AS1-208ENST00000522519 1537 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
ECM1Q16610 SLC18B1-202ENST00000367918 472 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
ECM1Q16610 ADM2-201ENST00000395737 535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
ECM1Q16610 LINC01067-201ENST00000432575 664 ntTSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
ECM1Q16610 BMP7-AS1-201ENST00000445956 436 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
ECM1Q16610 OARD1-208ENST00000469104 704 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
ECM1Q16610 AC019103.1-201ENST00000503095 272 ntTSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
ECM1Q16610 AC055854.1-201ENST00000523627 570 ntTSL 4 BASIC17.49■□□□□ 0.39
ECM1Q16610 SCN4B-204ENST00000529878 566 ntTSL 4 BASIC17.49■□□□□ 0.39
ECM1Q16610 TAPBPL-205ENST00000544021 772 ntTSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
ECM1Q16610 ZNF7-218ENST00000544249 2125 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
ECM1Q16610 AL096870.1-201ENST00000555591 930 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.49■□□□□ 0.39
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ECM1Q16610 ELOF1-205ENST00000589171 743 ntTSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
ECM1Q16610 UBL5-208ENST00000593087 320 ntTSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
ECM1Q16610 AC009118.2-201ENST00000613275 655 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
ECM1Q16610 OARD1-216ENST00000628419 1188 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
ECM1Q16610 HIST1H3D-202ENST00000635200 948 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
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ECM1Q16610 AP000866.1-201ENST00000499143 2886 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
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ECM1Q16610 TRNT1-201ENST00000251607 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
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ECM1Q16610 SGK2-206ENST00000423407 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
ECM1Q16610 TMEM132D-AS2-201ENST00000542578 1568 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
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ECM1Q16610 EPS8L2-218ENST00000530636 2469 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
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ECM1Q16610 SEMA4B-202ENST00000411539 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
ECM1Q16610 GAS2L3-201ENST00000266754 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
ECM1Q16610 KRT82-201ENST00000257974 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
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ECM1Q16610 TPD52L2-205ENST00000352482 2339 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
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ECM1Q16610 HSPB7-207ENST00000487046 844 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
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ECM1Q16610 GPX4-206ENST00000588919 803 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
ECM1Q16610 CHCHD2P3-201ENST00000603038 451 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
ECM1Q16610 FOLR3-204ENST00000611028 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
ECM1Q16610 IFI27-206ENST00000612813 725 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
ECM1Q16610 IFI27-213ENST00000620066 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
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ECM1Q16610 GOLIM4-201ENST00000309027 2100 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
ECM1Q16610 NDRG2-203ENST00000350792 2127 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
ECM1Q16610 MAGEA8-204ENST00000535454 2112 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
ECM1Q16610 M6PR-202ENST00000536844 2305 ntTSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
ECM1Q16610 RFC5-204ENST00000454402 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
ECM1Q16610 MCF2L-203ENST00000375604 6445 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
ECM1Q16610 CDK13-201ENST00000181839 7298 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
ECM1Q16610 PCDH1-203ENST00000394536 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
ECM1Q16610 EGLN3-201ENST00000250457 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
ECM1Q16610 MBD1-205ENST00000353909 2820 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
ECM1Q16610 FLT1-201ENST00000282397 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
ECM1Q16610 SNRPN-201ENST00000346403 1304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
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