Protein–RNA interactions for Protein: Q16586

SGCA, Alpha-sarcoglycan, humanhuman

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Length 387 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGCAQ16586 AL669831.5-201ENST00000434264 844 ntTSL 5 BASIC14.17□□□□□ -0.14
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SGCAQ16586 LINC00899-202ENST00000444890 493 ntTSL 3 BASIC14.17□□□□□ -0.14
SGCAQ16586 AL139010.1-201ENST00000454878 894 ntBASIC14.17□□□□□ -0.14
SGCAQ16586 STT3A-AS1-201ENST00000530526 429 ntTSL 3 BASIC14.17□□□□□ -0.14
SGCAQ16586 AC018653.3-201ENST00000544657 749 ntTSL 3 BASIC14.17□□□□□ -0.14
SGCAQ16586 TNNT1-211ENST00000588426 683 ntTSL 5 BASIC14.17□□□□□ -0.14
SGCAQ16586 AC098484.3-202ENST00000603943 1011 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.17□□□□□ -0.14
SGCAQ16586 AC026979.3-201ENST00000607315 403 ntBASIC14.17□□□□□ -0.14
SGCAQ16586 AC003101.2-201ENST00000612557 442 ntBASIC14.17□□□□□ -0.14
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SGCAQ16586 AIFM2-204ENST00000613322 3247 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.17□□□□□ -0.14
SGCAQ16586 TACR2-203ENST00000619173 1713 ntTSL 5 BASIC14.17□□□□□ -0.14
SGCAQ16586 CGREF1-205ENST00000404694 1376 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.17□□□□□ -0.14
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SGCAQ16586 ITSN2-203ENST00000406921 4563 ntTSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
SGCAQ16586 WBP4-201ENST00000379487 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
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SGCAQ16586 AC011477.6-201ENST00000604980 1927 ntBASIC14.17□□□□□ -0.14
SGCAQ16586 SLC4A3-202ENST00000317151 4069 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.17□□□□□ -0.14
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SGCAQ16586 SPATA6-204ENST00000396199 4964 ntTSL 2 BASIC14.17□□□□□ -0.14
SGCAQ16586 AP4B1-204ENST00000369569 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
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SGCAQ16586 RASA4B-202ENST00000465829 2931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
SGCAQ16586 PAQR6-204ENST00000356983 2143 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.17□□□□□ -0.14
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SGCAQ16586 TMEM40-202ENST00000314124 2308 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.16□□□□□ -0.14
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SGCAQ16586 CLEC18C-202ENST00000536907 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.16□□□□□ -0.14
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SGCAQ16586 C12orf49-201ENST00000261318 8404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
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SGCAQ16586 TMEM205-201ENST00000354882 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
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SGCAQ16586 FES-204ENST00000414248 2327 ntTSL 2 BASIC14.15□□□□□ -0.14
SGCAQ16586 TPD52L2-210ENST00000615907 2310 ntTSL 4 BASIC14.15□□□□□ -0.14
SGCAQ16586 ZFPM2-201ENST00000407775 4700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
SGCAQ16586 PPM1B-204ENST00000378551 3877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
SGCAQ16586 B3GAT1-201ENST00000312527 3652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
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SGCAQ16586 CD68-201ENST00000250092 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
SGCAQ16586 SPTLC2-201ENST00000216484 8170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
SGCAQ16586 FADS1-201ENST00000350997 4525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
SGCAQ16586 EEF1A1-202ENST00000316292 4441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
SGCAQ16586 FAM131A-203ENST00000383847 1483 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.15□□□□□ -0.14
SGCAQ16586 MECR-201ENST00000263702 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
SGCAQ16586 YIF1B-201ENST00000329420 964 ntTSL 3 BASIC14.15□□□□□ -0.14
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