Protein–RNA interactions for Protein: Q16570

ACKR1, Atypical chemokine receptor 1, humanhuman

Predictions only

Length 336 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACKR1Q16570 RASD2-201ENST00000216127 3412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
ACKR1Q16570 CARMIL3-201ENST00000342740 4597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.3□□□□□ -0.12
ACKR1Q16570 AC022532.1-201ENST00000624563 1728 ntBASIC14.3□□□□□ -0.12
ACKR1Q16570 C9orf78-201ENST00000372447 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
ACKR1Q16570 MBD1-202ENST00000269471 2980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.3□□□□□ -0.12
ACKR1Q16570 MARK3-204ENST00000416682 2969 ntTSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
ACKR1Q16570 CIAPIN1-207ENST00000565961 1814 ntTSL 3 BASIC14.3□□□□□ -0.12
ACKR1Q16570 MAPK13-203ENST00000373766 6196 ntTSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
ACKR1Q16570 LRP10-201ENST00000359591 6886 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
ACKR1Q16570 RUSC1-205ENST00000368354 3114 ntTSL 2 BASIC14.3□□□□□ -0.12
ACKR1Q16570 TCTN1-202ENST00000397655 1879 ntTSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
ACKR1Q16570 LINC00266-1-201ENST00000279067 928 ntTSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
ACKR1Q16570 GPHB5-201ENST00000314140 393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
ACKR1Q16570 RPL21-203ENST00000319826 806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.3□□□□□ -0.12
ACKR1Q16570 AC241585.1-201ENST00000433527 519 ntBASIC14.3□□□□□ -0.12
ACKR1Q16570 MTFR1L-218ENST00000526894 733 ntTSL 4 BASIC14.3□□□□□ -0.12
ACKR1Q16570 CSRP2-202ENST00000546966 754 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.3□□□□□ -0.12
ACKR1Q16570 COQ9-214ENST00000567933 882 ntTSL 3 BASIC14.3□□□□□ -0.12
ACKR1Q16570 NAA38-207ENST00000576861 556 ntTSL 3 BASIC14.3□□□□□ -0.12
ACKR1Q16570 SECTM1-202ENST00000580437 1030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.3□□□□□ -0.12
ACKR1Q16570 DNM1-201ENST00000341179 3254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
ACKR1Q16570 TFR2-202ENST00000431692 2631 ntTSL 5 BASIC14.3□□□□□ -0.12
ACKR1Q16570 ZNF197-203ENST00000383744 1989 ntTSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
ACKR1Q16570 AKAP9-205ENST00000394564 1356 ntTSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
ACKR1Q16570 LLGL2-209ENST00000578363 1393 ntTSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
ACKR1Q16570 HLF-201ENST00000226067 5547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
ACKR1Q16570 AC067930.6-201ENST00000623257 4947 ntBASIC14.3□□□□□ -0.12
ACKR1Q16570 AHCY-201ENST00000217426 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
ACKR1Q16570 SERTAD1-201ENST00000357949 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
ACKR1Q16570 TOM1L2-209ENST00000540946 1420 ntTSL 2 BASIC14.3□□□□□ -0.12
ACKR1Q16570 FAM218A-201ENST00000513876 2175 ntAPPRIS P1 BASIC14.3□□□□□ -0.12
ACKR1Q16570 NBPF9-207ENST00000615421 5835 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.3□□□□□ -0.12
ACKR1Q16570 STAT5B-201ENST00000293328 5103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
ACKR1Q16570 NCKIPSD-201ENST00000294129 2989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
ACKR1Q16570 SSR4P1-203ENST00000599569 2260 ntBASIC14.3□□□□□ -0.12
ACKR1Q16570 SYDE1-204ENST00000600440 3058 ntTSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
ACKR1Q16570 MED26-201ENST00000263390 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
ACKR1Q16570 RCC2-202ENST00000375436 4087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
ACKR1Q16570 EPS15L1-207ENST00000594975 2489 ntTSL 2 BASIC14.3□□□□□ -0.12
ACKR1Q16570 AC092127.1-201ENST00000567093 3455 ntBASIC14.29□□□□□ -0.12
ACKR1Q16570 SPATA20-202ENST00000356488 2634 ntTSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
ACKR1Q16570 GATA4-206ENST00000528712 2614 ntTSL 2 BASIC14.29□□□□□ -0.12
ACKR1Q16570 PPFIBP2-201ENST00000299492 3557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
ACKR1Q16570 WIZ-206ENST00000599686 3644 ntTSL 5 BASIC14.29□□□□□ -0.12
ACKR1Q16570 CRAT-201ENST00000318080 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
ACKR1Q16570 SYT3-201ENST00000338916 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
ACKR1Q16570 KLHDC8A-201ENST00000367155 2928 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.29□□□□□ -0.12
ACKR1Q16570 FOXRED2-204ENST00000397224 4967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
ACKR1Q16570 DISC1-209ENST00000439617 7059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.29□□□□□ -0.12
ACKR1Q16570 PCBP4-205ENST00000461554 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
ACKR1Q16570 TOPAZ1-201ENST00000309765 5334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.29□□□□□ -0.12
ACKR1Q16570 GNB4-201ENST00000232564 6434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
ACKR1Q16570 RFX1-201ENST00000254325 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
ACKR1Q16570 SLC20A1-201ENST00000272542 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
ACKR1Q16570 TBC1D22A-205ENST00000406733 2267 ntTSL 2 BASIC14.29□□□□□ -0.12
ACKR1Q16570 MGME1-203ENST00000377710 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
ACKR1Q16570 AC136621.1-201ENST00000624017 2304 ntBASIC14.29□□□□□ -0.12
ACKR1Q16570 PDK2-201ENST00000007708 2384 ntTSL 2 BASIC14.29□□□□□ -0.12
ACKR1Q16570 DDT-201ENST00000350608 671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
ACKR1Q16570 CD81-202ENST00000381036 880 ntTSL 3 BASIC14.29□□□□□ -0.12
ACKR1Q16570 FLG-AS1-204ENST00000420707 906 ntTSL 5 BASIC14.29□□□□□ -0.12
ACKR1Q16570 AC091729.1-201ENST00000449721 869 ntTSL 3 BASIC14.29□□□□□ -0.12
ACKR1Q16570 SNX21-206ENST00000462307 1043 ntTSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
ACKR1Q16570 AC008750.1-201ENST00000532473 492 ntTSL 3 BASIC14.29□□□□□ -0.12
ACKR1Q16570 PUDP-206ENST00000540122 825 ntTSL 2 BASIC14.29□□□□□ -0.12
ACKR1Q16570 PPP1R14B-203ENST00000542235 920 ntTSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
ACKR1Q16570 AL391261.2-201ENST00000554907 773 ntTSL 2 BASIC14.29□□□□□ -0.12
ACKR1Q16570 AC027307.3-201ENST00000594262 1100 ntBASIC14.29□□□□□ -0.12
ACKR1Q16570 COQ4-205ENST00000609948 956 ntTSL 2 BASIC14.29□□□□□ -0.12
ACKR1Q16570 AC005391.1-201ENST00000613285 341 ntTSL 3 BASIC14.29□□□□□ -0.12
ACKR1Q16570 TNXB-209ENST00000613214 6842 ntTSL 5 BASIC14.29□□□□□ -0.12
ACKR1Q16570 ZFAND5-205ENST00000376962 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
ACKR1Q16570 CCNA2-202ENST00000618014 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
ACKR1Q16570 FAM131A-203ENST00000383847 1483 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.29□□□□□ -0.12
ACKR1Q16570 ABCB9-216ENST00000542678 6051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
ACKR1Q16570 BICD2-202ENST00000375512 4636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
ACKR1Q16570 TC2N-201ENST00000340892 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
ACKR1Q16570 PAX6-276ENST00000640684 1557 ntTSL 5 BASIC14.29□□□□□ -0.12
ACKR1Q16570 KRT27-201ENST00000301656 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
ACKR1Q16570 AMT-233ENST00000636522 1620 ntTSL 2 BASIC14.29□□□□□ -0.12
ACKR1Q16570 KRT8-215ENST00000552150 1687 ntTSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
ACKR1Q16570 CXCL6-201ENST00000226317 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
ACKR1Q16570 FAM53B-202ENST00000337318 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
ACKR1Q16570 ACSM2A-203ENST00000417235 1835 ntTSL 2 BASIC14.29□□□□□ -0.12
ACKR1Q16570 NEFL-203ENST00000619417 1879 ntTSL 5 BASIC14.29□□□□□ -0.12
ACKR1Q16570 ABCC5-203ENST00000382494 1923 ntTSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
ACKR1Q16570 ULK4-203ENST00000420927 1904 ntTSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
ACKR1Q16570 PLEKHA8-205ENST00000449726 7835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
ACKR1Q16570 METTL25-201ENST00000248306 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
ACKR1Q16570 CRY2-201ENST00000417225 2053 ntTSL 2 BASIC14.29□□□□□ -0.12
ACKR1Q16570 AP000704.1-201ENST00000637940 2182 ntTSL 5 BASIC14.29□□□□□ -0.12
ACKR1Q16570 RB1CC1-202ENST00000435644 6614 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
ACKR1Q16570 TOMM70-201ENST00000284320 4409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
ACKR1Q16570 AC091100.1-201ENST00000558424 2354 ntTSL 2 BASIC14.29□□□□□ -0.12
ACKR1Q16570 FLII-221ENST00000578558 2377 ntTSL 5 BASIC14.29□□□□□ -0.12
ACKR1Q16570 PPT1-215ENST00000641471 2368 ntBASIC14.29□□□□□ -0.12
ACKR1Q16570 ORAOV1-201ENST00000279147 2478 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
ACKR1Q16570 IMPDH1-202ENST00000348127 2479 ntTSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
ACKR1Q16570 TRIM13-204ENST00000420995 2607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
ACKR1Q16570 TLE3-202ENST00000440567 2657 ntTSL 2 BASIC14.28□□□□□ -0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.5 ms