Protein–RNA interactions for Protein: Q15843

NEDD8, NEDD8, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEDD8Q15843 MYRF-203ENST00000389602 2052 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
NEDD8Q15843 RILPL1-202ENST00000376874 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
NEDD8Q15843 ADCY1-202ENST00000432715 1693 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
NEDD8Q15843 VIPAS39-202ENST00000343765 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
NEDD8Q15843 DRC3-203ENST00000399187 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
NEDD8Q15843 PTCRA-201ENST00000304672 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
NEDD8Q15843 TCTEX1D2-201ENST00000325318 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
NEDD8Q15843 FUOM-202ENST00000368551 628 ntTSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
NEDD8Q15843 AC093901.1-201ENST00000414886 778 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
NEDD8Q15843 PTCRA-202ENST00000441198 1005 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
NEDD8Q15843 MOBP-208ENST00000441980 830 ntAPPRIS P4 TSL 4 BASIC14.5□□□□□ -0.09
NEDD8Q15843 PTCRA-203ENST00000446507 759 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
NEDD8Q15843 ERCC5-207ENST00000535557 1125 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
NEDD8Q15843 LINC01023-201ENST00000606054 436 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
NEDD8Q15843 AC114488.2-214ENST00000609033 813 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
NEDD8Q15843 SBDS-205ENST00000617799 953 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
NEDD8Q15843 HNF1B-206ENST00000620125 1103 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
NEDD8Q15843 ASAH1-255ENST00000637638 699 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
NEDD8Q15843 AFAP1-204ENST00000420658 7768 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
NEDD8Q15843 CMTR2-201ENST00000338099 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
NEDD8Q15843 C1QTNF6-202ENST00000397110 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
NEDD8Q15843 TKT-201ENST00000296289 1931 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
NEDD8Q15843 HPSE-206ENST00000512196 1571 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
NEDD8Q15843 REPS1-221ENST00000626459 3665 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
NEDD8Q15843 ZSWIM8-221ENST00000604729 6075 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
NEDD8Q15843 RAPH1-202ENST00000319170 9808 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
NEDD8Q15843 SLC2A9-202ENST00000309065 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
NEDD8Q15843 RBFOX3-212ENST00000584778 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
NEDD8Q15843 FRMD8-202ENST00000355991 3514 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
NEDD8Q15843 GTF2H2C-201ENST00000380729 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
NEDD8Q15843 FGFR3-201ENST00000260795 4132 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
NEDD8Q15843 PHF8-202ENST00000338154 6062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
NEDD8Q15843 KCTD10-208ENST00000540089 3096 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
NEDD8Q15843 PORCN-201ENST00000326194 1755 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
NEDD8Q15843 TRIML1-201ENST00000332517 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
NEDD8Q15843 VSIR-201ENST00000394957 4689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
NEDD8Q15843 RADIL-201ENST00000399583 3689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
NEDD8Q15843 HDAC8-209ENST00000373589 1740 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
NEDD8Q15843 SAR1A-204ENST00000373241 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
NEDD8Q15843 LRRC41-201ENST00000343304 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
NEDD8Q15843 UGT3A1-204ENST00000507113 1650 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
NEDD8Q15843 IKZF1-218ENST00000615491 5637 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
NEDD8Q15843 GABARAPL1-218ENST00000546017 2294 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
NEDD8Q15843 PAX6-202ENST00000379107 2579 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
NEDD8Q15843 PPIL2-202ENST00000398831 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
NEDD8Q15843 TRIM65-201ENST00000269383 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
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NEDD8Q15843 ALKBH5-203ENST00000541285 1605 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
NEDD8Q15843 ADAM11-201ENST00000200557 4571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
NEDD8Q15843 PDCL3-201ENST00000264254 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
NEDD8Q15843 JPH3-201ENST00000284262 3985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
NEDD8Q15843 ADGRG2-207ENST00000379869 4768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
NEDD8Q15843 GPR6-201ENST00000275169 1089 ntAPPRIS P1 BASIC14.49□□□□□ -0.09
NEDD8Q15843 CD7-201ENST00000312648 1281 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
NEDD8Q15843 C1QC-202ENST00000374639 1183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
NEDD8Q15843 MIR718-201ENST00000390190 70 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
NEDD8Q15843 RHOG-202ENST00000396978 1066 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
NEDD8Q15843 SERTAD4-AS1-201ENST00000437764 726 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
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NEDD8Q15843 PMF1-BGLAP-203ENST00000490491 1007 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
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NEDD8Q15843 REXO2-220ENST00000611665 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
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NEDD8Q15843 AMOTL2-201ENST00000249883 4488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
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NEDD8Q15843 EXTL1-201ENST00000374280 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
NEDD8Q15843 ROCK1-201ENST00000399799 9484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
NEDD8Q15843 CYB5R3-205ENST00000407623 2153 ntTSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
NEDD8Q15843 ITGAM-202ENST00000544665 4718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
NEDD8Q15843 CMPK1-203ENST00000371873 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
NEDD8Q15843 RUSC1-204ENST00000368352 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
NEDD8Q15843 PTBP1-221ENST00000635647 3691 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
NEDD8Q15843 UMODL1-AS1-201ENST00000329015 2141 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
NEDD8Q15843 SNX14-203ENST00000369627 3111 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
NEDD8Q15843 POLL-205ENST00000370169 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
NEDD8Q15843 AFDN-205ENST00000392108 6812 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
NEDD8Q15843 CGN-201ENST00000271636 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
NEDD8Q15843 SREBF1-202ENST00000355815 4253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
NEDD8Q15843 AL365205.1-204ENST00000359201 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
NEDD8Q15843 CYP20A1-203ENST00000429815 1812 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
NEDD8Q15843 ARHGAP27-203ENST00000428638 4242 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
NEDD8Q15843 LRRC8D-201ENST00000337338 3950 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
NEDD8Q15843 C8orf46-215ENST00000522977 1347 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
NEDD8Q15843 GRIN1-203ENST00000371550 3940 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
NEDD8Q15843 SWAP70-201ENST00000318950 4882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
NEDD8Q15843 BCAR1-205ENST00000420641 2725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
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