Protein–RNA interactions for Protein: Q15836

VAMP3, Vesicle-associated membrane protein 3, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VAMP3Q15836 KCNMA1-210ENST00000404771 4014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
VAMP3Q15836 RHOH-220ENST00000615083 2156 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC11.26□□□□□ -0.61
VAMP3Q15836 ADGRA1-201ENST00000392606 3438 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
VAMP3Q15836 BEND7-201ENST00000341083 2239 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.26□□□□□ -0.61
VAMP3Q15836 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
VAMP3Q15836 NT5C1A-201ENST00000235628 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
VAMP3Q15836 FAM98C-201ENST00000252530 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
VAMP3Q15836 TMEM88-201ENST00000301599 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
VAMP3Q15836 C10orf76-201ENST00000311122 724 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
VAMP3Q15836 AC068473.1-201ENST00000317008 1111 ntTSL 2 BASIC11.26□□□□□ -0.61
VAMP3Q15836 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
VAMP3Q15836 EMC6-202ENST00000397133 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.26□□□□□ -0.61
VAMP3Q15836 KRT18P23-201ENST00000435622 1283 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
VAMP3Q15836 MEAF6-205ENST00000448519 666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
VAMP3Q15836 LINC01881-205ENST00000456398 1235 ntTSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
VAMP3Q15836 AP002982.1-201ENST00000492365 877 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
VAMP3Q15836 MYL6-209ENST00000548293 753 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.26□□□□□ -0.61
VAMP3Q15836 MIR3180-4-201ENST00000582223 153 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
VAMP3Q15836 TNNI3-207ENST00000588882 669 ntTSL 2 BASIC11.26□□□□□ -0.61
VAMP3Q15836 CORO1B-210ENST00000627576 960 ntTSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
VAMP3Q15836 KRT42P-202ENST00000438131 2895 ntTSL 2 BASIC11.26□□□□□ -0.61
VAMP3Q15836 STAR-201ENST00000276449 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
VAMP3Q15836 KRT4-204ENST00000551956 2576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
VAMP3Q15836 FAM118A-202ENST00000405673 1612 ntTSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
VAMP3Q15836 HOXD12-202ENST00000406506 1318 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.26□□□□□ -0.61
VAMP3Q15836 AC015712.2-201ENST00000560351 3688 ntTSL 2 BASIC11.26□□□□□ -0.61
VAMP3Q15836 NUMA1-234ENST00000620566 7012 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
VAMP3Q15836 CSF1-203ENST00000369801 1364 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
VAMP3Q15836 IMP4-201ENST00000259239 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
VAMP3Q15836 SLC47A1-203ENST00000436810 1719 ntTSL 2 BASIC11.26□□□□□ -0.61
VAMP3Q15836 DCAKD-208ENST00000614054 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.26□□□□□ -0.61
VAMP3Q15836 MBD1-205ENST00000353909 2820 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
VAMP3Q15836 LINC01257-201ENST00000376678 2473 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
VAMP3Q15836 AP000845.1-201ENST00000581677 2131 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
VAMP3Q15836 RNF167-211ENST00000575111 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
VAMP3Q15836 PTGER3-209ENST00000460330 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
VAMP3Q15836 RGS8-204ENST00000483095 1432 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.26□□□□□ -0.61
VAMP3Q15836 MCHR1-201ENST00000249016 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
VAMP3Q15836 HDAC9-208ENST00000417496 2524 ntTSL 2 BASIC11.26□□□□□ -0.61
VAMP3Q15836 KIAA1549-202ENST00000440172 12379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
VAMP3Q15836 USP33-202ENST00000370792 2917 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
VAMP3Q15836 PAPLN-203ENST00000554301 4090 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.25□□□□□ -0.61
VAMP3Q15836 AL356258.1-201ENST00000605929 2246 ntTSL 2 BASIC11.25□□□□□ -0.61
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VAMP3Q15836 C4orf33-201ENST00000281146 6170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
VAMP3Q15836 PDE2A-201ENST00000334456 4315 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
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VAMP3Q15836 TKT-203ENST00000423525 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
VAMP3Q15836 PCF11-201ENST00000298281 7677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
VAMP3Q15836 RFFL-201ENST00000315249 7293 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.25□□□□□ -0.61
VAMP3Q15836 CNOT3-201ENST00000221232 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
VAMP3Q15836 STXBP5L-201ENST00000273666 9496 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
VAMP3Q15836 AL365205.1-204ENST00000359201 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
VAMP3Q15836 ZNF318-201ENST00000361428 8006 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
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VAMP3Q15836 CMTM7-202ENST00000349718 1214 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
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VAMP3Q15836 MKX-201ENST00000375790 3846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
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VAMP3Q15836 ZNF514-201ENST00000295208 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
VAMP3Q15836 CAPN14-202ENST00000403897 2197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.25□□□□□ -0.61
VAMP3Q15836 PLD2-201ENST00000263088 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
VAMP3Q15836 FHOD1-201ENST00000258201 3990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
VAMP3Q15836 SGSM1-201ENST00000400358 6643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
VAMP3Q15836 JAM2-202ENST00000400532 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
VAMP3Q15836 AC007663.2-201ENST00000506039 2228 ntTSL 2 BASIC11.25□□□□□ -0.61
VAMP3Q15836 FOXRED1-213ENST00000532125 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.25□□□□□ -0.61
VAMP3Q15836 NDRG4-202ENST00000356752 1375 ntTSL 2 BASIC11.25□□□□□ -0.61
VAMP3Q15836 AMER1-202ENST00000374869 3688 ntTSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
VAMP3Q15836 LAMA4-207ENST00000424408 5983 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
VAMP3Q15836 AC015712.2-202ENST00000560068 3213 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
VAMP3Q15836 AL365181.3-201ENST00000605886 3222 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
VAMP3Q15836 VPS9D1-202ENST00000561976 2791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
VAMP3Q15836 BX537318.2-201ENST00000624893 4162 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
VAMP3Q15836 ADAMTSL1-207ENST00000380566 2321 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
VAMP3Q15836 SHANK2-211ENST00000449833 8850 ntTSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
VAMP3Q15836 AKAP1-201ENST00000314126 2380 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
VAMP3Q15836 UNC119-202ENST00000335765 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
VAMP3Q15836 GAL3ST4-202ENST00000411994 1404 ntTSL 2 BASIC11.25□□□□□ -0.61
VAMP3Q15836 MIR9-3HG-201ENST00000536780 4778 ntTSL 3 BASIC11.25□□□□□ -0.61
VAMP3Q15836 CACNA2D2-202ENST00000360963 5272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
VAMP3Q15836 B4GALT3-201ENST00000319769 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
VAMP3Q15836 AL353608.3-202ENST00000429953 4384 ntTSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
VAMP3Q15836 NXNL2-202ENST00000375855 1457 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
VAMP3Q15836 HOXA7-201ENST00000242159 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
VAMP3Q15836 PEX13-204ENST00000444100 1533 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
VAMP3Q15836 LINC01792-201ENST00000452787 2050 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
VAMP3Q15836 NUP133-201ENST00000261396 5207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
VAMP3Q15836 FCER2-201ENST00000346664 1596 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
VAMP3Q15836 COLEC11-206ENST00000403096 1557 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
VAMP3Q15836 IFITM10-201ENST00000340134 3706 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.24□□□□□ -0.61
VAMP3Q15836 PCMTD2-204ENST00000369758 3212 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
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