Protein–RNA interactions for Protein: Q15532

SS18, Protein SSXT, humanhuman

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Length 418 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SS18Q15532 ZNF398-203ENST00000483892 2121 ntTSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.65
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SS18Q15532 PIGT-201ENST00000279035 1880 ntTSL 2 BASIC10.96□□□□□ -0.65
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SS18Q15532 RIC8B-213ENST00000638198 1611 ntTSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.65
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SS18Q15532 LINC02167-203ENST00000566900 1489 ntTSL 2 BASIC10.96□□□□□ -0.65
SS18Q15532 KCNC1-201ENST00000265969 4295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.65
SS18Q15532 WASH6P-202ENST00000359512 1437 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
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SS18Q15532 PTH2-201ENST00000270631 459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
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SS18Q15532 FLYWCH2-203ENST00000572006 754 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.95□□□□□ -0.66
SS18Q15532 AC116407.3-201ENST00000623905 1129 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
SS18Q15532 TSPY4-205ENST00000640033 663 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
SS18Q15532 DBNDD1-202ENST00000304733 2081 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
SS18Q15532 TNNI1-207ENST00000622580 6142 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
SS18Q15532 E2F7-202ENST00000416496 5297 ntTSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
SS18Q15532 CLPTM1L-216ENST00000630539 2032 ntTSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
SS18Q15532 OCRL-202ENST00000371113 5162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
SS18Q15532 GLUL-202ENST00000331872 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
SS18Q15532 HNF1B-207ENST00000621123 1971 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
SS18Q15532 FAM9C-205ENST00000542843 5858 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
SS18Q15532 KIAA1755-206ENST00000496900 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.95□□□□□ -0.66
SS18Q15532 DENND3-211ENST00000519811 5482 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
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