Protein–RNA interactions for Protein: Q14563

SEMA3A, Semaphorin-3A, humanhuman

Predictions only

Length 771 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEMA3AQ14563 AL162231.3-201ENST00000556278 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
SEMA3AQ14563 FAM92A-219ENST00000620645 1014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
SEMA3AQ14563 CLN3-255ENST00000637100 1284 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
SEMA3AQ14563 AL033527.5-202ENST00000641632 1098 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
SEMA3AQ14563 KRT82-201ENST00000257974 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SEMA3AQ14563 PPP1R37-201ENST00000221462 3163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
SEMA3AQ14563 FRMPD4-201ENST00000380682 8465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SEMA3AQ14563 CHRNG-202ENST00000389494 2262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
SEMA3AQ14563 PBX3-204ENST00000373489 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SEMA3AQ14563 TYSND1-202ENST00000335494 3397 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SEMA3AQ14563 AP003397.1-201ENST00000525706 1387 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SEMA3AQ14563 PRKAG3-206ENST00000529249 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
SEMA3AQ14563 KCNMA1-251ENST00000639090 4319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.1
SEMA3AQ14563 TMA16-201ENST00000358572 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
SEMA3AQ14563 FKBP8-201ENST00000222308 1710 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
SEMA3AQ14563 RAPSN-202ENST00000352508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
SEMA3AQ14563 CDIP1-206ENST00000563507 1463 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.1
SEMA3AQ14563 GRAMD4-203ENST00000408031 2834 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
SEMA3AQ14563 SREBF1-201ENST00000261646 4178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
SEMA3AQ14563 AC073264.3-201ENST00000636941 2577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.1
SEMA3AQ14563 TOM1-209ENST00000447733 2317 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.1
SEMA3AQ14563 RXRA-202ENST00000481739 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
SEMA3AQ14563 TMEM132D-AS2-201ENST00000542578 1568 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SEMA3AQ14563 PABPC4-201ENST00000372856 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SEMA3AQ14563 CES4A-207ENST00000540947 2284 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
SEMA3AQ14563 GRAMD4P3-201ENST00000621665 1669 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
SEMA3AQ14563 FYN-205ENST00000368682 3234 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
SEMA3AQ14563 ZFP41-201ENST00000330701 4797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
SEMA3AQ14563 ANKRD24-206ENST00000600132 4026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
SEMA3AQ14563 UCP2-201ENST00000310473 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SEMA3AQ14563 TSG101-204ENST00000536719 2101 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
SEMA3AQ14563 IDH3G-204ENST00000427365 1526 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
SEMA3AQ14563 HMGXB3-202ENST00000503427 5275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
SEMA3AQ14563 AAMP-201ENST00000248450 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SEMA3AQ14563 IL6ST-209ENST00000502326 3007 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
SEMA3AQ14563 MAP2K3-202ENST00000342679 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SEMA3AQ14563 M6PR-202ENST00000536844 2305 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
SEMA3AQ14563 NFIA-205ENST00000371189 1989 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
SEMA3AQ14563 TMEM5-205ENST00000537373 1966 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SEMA3AQ14563 CFLAR-205ENST00000342795 1613 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
SEMA3AQ14563 EIF4E-201ENST00000280892 1097 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SEMA3AQ14563 H3F3C-201ENST00000340398 1057 ntAPPRIS P1 BASIC15.7■□□□□ 0.1
SEMA3AQ14563 DBNDD2-205ENST00000372717 1207 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
SEMA3AQ14563 CCDC107-204ENST00000378409 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SEMA3AQ14563 C6orf52-202ENST00000379586 430 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
SEMA3AQ14563 BAD-202ENST00000394531 631 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
SEMA3AQ14563 AL136988.1-201ENST00000414640 1029 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
SEMA3AQ14563 RAD18-204ENST00000418463 563 ntTSL 4 BASIC15.7■□□□□ 0.1
SEMA3AQ14563 RAD18-205ENST00000421052 582 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
SEMA3AQ14563 TREML5P-201ENST00000421694 576 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
SEMA3AQ14563 NCBP2-203ENST00000422610 676 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
SEMA3AQ14563 RNASE10-202ENST00000430083 1172 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
SEMA3AQ14563 KRT18P64-201ENST00000434946 1219 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
SEMA3AQ14563 TMEM120A-203ENST00000439537 1161 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SEMA3AQ14563 AC091133.3-201ENST00000504865 432 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
SEMA3AQ14563 PDCD6-202ENST00000505221 672 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
SEMA3AQ14563 CNOT8-210ENST00000519404 945 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
SEMA3AQ14563 RPL10P19-202ENST00000520582 722 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
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SEMA3AQ14563 CNOT8-218ENST00000521583 1151 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SEMA3AQ14563 AL139349.1-201ENST00000530479 577 ntTSL 4 BASIC15.7■□□□□ 0.1
SEMA3AQ14563 NRK-203ENST00000536164 908 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SEMA3AQ14563 BAD-207ENST00000544785 525 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
SEMA3AQ14563 AC108449.3-201ENST00000560714 585 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
SEMA3AQ14563 AC140878.1-201ENST00000565277 250 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
SEMA3AQ14563 AC087741.1-202ENST00000573346 801 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
SEMA3AQ14563 CD300LG-205ENST00000586233 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SEMA3AQ14563 AC025048.3-201ENST00000590609 569 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
SEMA3AQ14563 GRIFIN-202ENST00000614228 461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
SEMA3AQ14563 AC005702.4-201ENST00000618393 416 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
SEMA3AQ14563 AC073592.8-201ENST00000624126 511 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
SEMA3AQ14563 AC138035.3-201ENST00000622706 2791 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
SEMA3AQ14563 CCDC8-201ENST00000307522 3213 ntAPPRIS P1 BASIC15.7■□□□□ 0.1
SEMA3AQ14563 GHDC-203ENST00000428494 2518 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
SEMA3AQ14563 BRF1-203ENST00000379937 3314 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SEMA3AQ14563 WDR45-240ENST00000635003 1376 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
SEMA3AQ14563 TRPC6-206ENST00000532133 2648 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
SEMA3AQ14563 HDHD3-202ENST00000374180 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SEMA3AQ14563 RAPSN-203ENST00000524487 1462 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
SEMA3AQ14563 AL162457.1-201ENST00000317652 2000 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
SEMA3AQ14563 AC104407.1-201ENST00000511017 1568 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
SEMA3AQ14563 KCNC2-207ENST00000548513 3026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SEMA3AQ14563 KLK3-202ENST00000360617 1664 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SEMA3AQ14563 HERPUD1-201ENST00000300302 1862 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
SEMA3AQ14563 STK33-217ENST00000534493 1895 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
SEMA3AQ14563 C18orf15-201ENST00000623680 2534 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
SEMA3AQ14563 PLTP-205ENST00000477313 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
SEMA3AQ14563 JAKMIP1-204ENST00000409831 2371 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
SEMA3AQ14563 MCF2L-232ENST00000535094 3752 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
SEMA3AQ14563 SGK3-211ENST00000522398 3106 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
SEMA3AQ14563 MON1B-203ENST00000545553 1814 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
SEMA3AQ14563 TSNARE1-201ENST00000307180 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
SEMA3AQ14563 ATP6V0A1-204ENST00000537728 2774 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
SEMA3AQ14563 RTN4RL1-201ENST00000331238 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
SEMA3AQ14563 ZNF208-205ENST00000601773 2027 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
SEMA3AQ14563 MIEF2-203ENST00000395704 2879 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
SEMA3AQ14563 DGAT1-206ENST00000528718 3711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
SEMA3AQ14563 SELENOM-202ENST00000402395 1054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
SEMA3AQ14563 CAMKMT-204ENST00000407131 652 ntTSL 3 BASIC15.69■□□□□ 0.1
SEMA3AQ14563 AC107890.1-201ENST00000422478 521 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
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