Protein–RNA interactions for Protein: Q13938

CAPS, Calcyphosin, humanhuman

Predictions only

Length 189 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPSQ13938 PRMT2-202ENST00000334494 1334 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CAPSQ13938 SMAD4-201ENST00000342988 8769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CAPSQ13938 PDGFB-201ENST00000331163 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CAPSQ13938 MAP4K1-208ENST00000589130 2654 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CAPSQ13938 FAM57B-202ENST00000380495 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CAPSQ13938 RNF167-211ENST00000575111 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CAPSQ13938 AL121845.3-201ENST00000490623 3119 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CAPSQ13938 AMBP-201ENST00000265132 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CAPSQ13938 PHKA1-202ENST00000373539 4476 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CAPSQ13938 SALL3-202ENST00000537592 6555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CAPSQ13938 PITPNA-201ENST00000313486 3912 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CAPSQ13938 FAM76B-201ENST00000358780 3952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CAPSQ13938 ATP2B1-AS1-201ENST00000605386 3632 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
CAPSQ13938 VCX3B-202ENST00000381032 1171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CAPSQ13938 C1QBPP1-201ENST00000400117 770 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
CAPSQ13938 AL136988.1-201ENST00000414640 1029 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CAPSQ13938 AL157935.1-209ENST00000415141 1105 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CAPSQ13938 AC093151.3-201ENST00000425554 623 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CAPSQ13938 AL162726.2-201ENST00000438986 1017 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
CAPSQ13938 KDM4A-AS1-204ENST00000439057 686 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CAPSQ13938 KCNQ1DN-201ENST00000441418 1093 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CAPSQ13938 AC136475.2-201ENST00000526612 392 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CAPSQ13938 GABARAPL1-217ENST00000545887 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CAPSQ13938 ELOF1-206ENST00000590700 585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CAPSQ13938 AC107373.2-201ENST00000607735 490 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
CAPSQ13938 ABBA01031660.1-201ENST00000635219 756 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
CAPSQ13938 DFNA5-202ENST00000409775 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CAPSQ13938 PTPN5-201ENST00000358540 3135 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CAPSQ13938 ZSCAN32-205ENST00000439568 1746 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CAPSQ13938 CXorf38-202ENST00000378421 2380 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CAPSQ13938 SUCLA2-201ENST00000378654 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CAPSQ13938 PIGP-207ENST00000464265 3437 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CAPSQ13938 RAB40B-206ENST00000571995 3859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CAPSQ13938 PGAP2-205ENST00000396993 1566 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CAPSQ13938 TCAF2-203ENST00000425618 2448 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CAPSQ13938 RELT-201ENST00000064780 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
CAPSQ13938 SEPT9-202ENST00000423034 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
CAPSQ13938 FAM83C-201ENST00000374408 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
CAPSQ13938 ADD1-201ENST00000264758 4045 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CAPSQ13938 CDS1-201ENST00000295887 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CAPSQ13938 CIART-203ENST00000369095 1433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CAPSQ13938 CXADR-201ENST00000284878 6254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CAPSQ13938 ZNF500-201ENST00000219478 5880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CAPSQ13938 PBX3-207ENST00000447726 2789 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CAPSQ13938 EIF2B3-201ENST00000360403 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CAPSQ13938 PRRG1-203ENST00000463135 1663 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CAPSQ13938 DDX5-201ENST00000225792 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CAPSQ13938 BABAM1-201ENST00000359435 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CAPSQ13938 KRT9-202ENST00000588431 1493 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CAPSQ13938 APP-204ENST00000357903 3543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CAPSQ13938 RUFY2-205ENST00000454950 2613 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CAPSQ13938 DNAJC2-203ENST00000379263 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CAPSQ13938 STAU2-219ENST00000522509 2173 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CAPSQ13938 GAS7-213ENST00000580865 2417 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CAPSQ13938 GATAD2A-202ENST00000360315 5671 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CAPSQ13938 SSR4-204ENST00000370087 745 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CAPSQ13938 PPDPF-201ENST00000370177 627 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CAPSQ13938 SOCS2P1-201ENST00000417727 557 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
CAPSQ13938 ABHD11-AS1-201ENST00000427153 662 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CAPSQ13938 AC007389.4-201ENST00000454674 793 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
CAPSQ13938 AL513217.1-202ENST00000458139 600 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CAPSQ13938 GS1-24F4.2-201ENST00000500823 1110 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CAPSQ13938 LINC01336-201ENST00000503568 534 ntTSL 4 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CAPSQ13938 GAPDHP40-201ENST00000505218 1006 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
CAPSQ13938 LINC01089-209ENST00000542933 1220 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CAPSQ13938 TBCB-211ENST00000589996 724 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CAPSQ13938 SERPINA4-202ENST00000555095 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CAPSQ13938 SHOX2-202ENST00000425436 1513 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CAPSQ13938 PRSS50-201ENST00000460241 2960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CAPSQ13938 ODF3-201ENST00000325113 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CAPSQ13938 ARFGAP1-201ENST00000353546 2776 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CAPSQ13938 ZNF512B-201ENST00000369888 5919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CAPSQ13938 PHB-201ENST00000300408 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CAPSQ13938 CROCCP3-201ENST00000263511 5368 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CAPSQ13938 HERPUD1-201ENST00000300302 1862 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CAPSQ13938 BRINP1-202ENST00000373964 1641 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CAPSQ13938 PUS1-208ENST00000542167 2151 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CAPSQ13938 RHNO1-202ENST00000461997 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CAPSQ13938 RASGRP2-206ENST00000377494 2983 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CAPSQ13938 HNRNPF-204ENST00000443950 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CAPSQ13938 KLF10-201ENST00000285407 3097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CAPSQ13938 FGF11-201ENST00000293829 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CAPSQ13938 NOX5-204ENST00000455873 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CAPSQ13938 PTPRN2-205ENST00000409483 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CAPSQ13938 MELTF-201ENST00000296350 3963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CAPSQ13938 ZCCHC17-206ENST00000616393 1534 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CAPSQ13938 LINC00391-201ENST00000433569 1844 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CAPSQ13938 KRTAP10-2-201ENST00000391621 1149 ntAPPRIS P1 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CAPSQ13938 MXI1-205ENST00000393134 889 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CAPSQ13938 AL133481.1-201ENST00000438554 511 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CAPSQ13938 RAB3A-202ENST00000464076 1253 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CAPSQ13938 AC068228.2-201ENST00000522383 777 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CAPSQ13938 DRAP1-208ENST00000532933 751 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CAPSQ13938 AP006621.2-201ENST00000533938 284 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CAPSQ13938 ZNF7-218ENST00000544249 2125 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CAPSQ13938 SLC9A3-AS1-206ENST00000607005 435 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CAPSQ13938 NKX3-1-201ENST00000380871 3271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CAPSQ13938 SLC22A6-203ENST00000421062 1560 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CAPSQ13938 SNHG20-204ENST00000566583 1338 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CAPSQ13938 GSR-201ENST00000221130 3119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
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