Protein–RNA interactions for Protein: Q13618

CUL3, Cullin-3, humanhuman

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Length 768 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CUL3Q13618 VMO1-203ENST00000416307 712 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CUL3Q13618 AC092474.2-201ENST00000424288 719 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
CUL3Q13618 AC131097.3-202ENST00000439270 331 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CUL3Q13618 MDH2-205ENST00000461263 648 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CUL3Q13618 GSTK1-207ENST00000479303 1185 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CUL3Q13618 EFCAB1-209ENST00000523092 648 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CUL3Q13618 MAL2-202ENST00000531508 892 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CUL3Q13618 AF131215.3-201ENST00000532453 639 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CUL3Q13618 HOXD8-204ENST00000544999 1235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CUL3Q13618 TMEM97-205ENST00000583381 578 ntTSL 4 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CUL3Q13618 METTL23-202ENST00000586200 465 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CUL3Q13618 PIN1-206ENST00000587625 878 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CUL3Q13618 METTL23-212ENST00000590964 1006 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CUL3Q13618 AL590999.1-203ENST00000606829 542 ntTSL 4 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CUL3Q13618 AC027601.4-201ENST00000611259 610 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
CUL3Q13618 FAM197Y3-203ENST00000618346 717 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
CUL3Q13618 CDC42EP4-209ENST00000630622 240 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CUL3Q13618 MLLT10-201ENST00000307729 5032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CUL3Q13618 ATXN10-202ENST00000381061 3135 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CUL3Q13618 SIGLEC6-205ENST00000425629 1852 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CUL3Q13618 PHF10-205ENST00000612128 4395 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CUL3Q13618 TFB2M-201ENST00000366514 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CUL3Q13618 TMEM51-202ENST00000376014 1843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CUL3Q13618 C12orf49-201ENST00000261318 8404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CUL3Q13618 NCK2-203ENST00000393349 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CUL3Q13618 OPA1-203ENST00000361715 6384 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CUL3Q13618 KNSTRN-201ENST00000249776 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CUL3Q13618 ZNF785-202ENST00000470110 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CUL3Q13618 RASD2-201ENST00000216127 3412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CUL3Q13618 IGFBP5-201ENST00000233813 6215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CUL3Q13618 B4GALNT3-201ENST00000266383 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CUL3Q13618 NACC1-201ENST00000292431 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CUL3Q13618 SDCBP-201ENST00000260130 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CUL3Q13618 GULP1-209ENST00000410051 1595 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CUL3Q13618 MROH1-207ENST00000528919 5234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CUL3Q13618 CABP4-201ENST00000325656 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CUL3Q13618 AL162457.1-201ENST00000317652 2000 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CUL3Q13618 ZNF208-205ENST00000601773 2027 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CUL3Q13618 LFNG-202ENST00000338732 1968 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CUL3Q13618 MECR-202ENST00000373791 2416 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CUL3Q13618 ZNF800-201ENST00000265827 4203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CUL3Q13618 AC087481.3-201ENST00000602886 1894 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
CUL3Q13618 GLMP-214ENST00000614643 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CUL3Q13618 CRB2-201ENST00000359999 3659 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CUL3Q13618 ARHGAP23-221ENST00000620417 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CUL3Q13618 BUB3-201ENST00000368858 1361 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CUL3Q13618 TTC28-AS1-207ENST00000428584 5859 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CUL3Q13618 LONP1-202ENST00000540670 3002 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CUL3Q13618 AC023024.1-201ENST00000558838 2590 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CUL3Q13618 PIP5K1A-202ENST00000368888 2134 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CUL3Q13618 KCNIP2-208ENST00000370046 923 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CUL3Q13618 CST3-201ENST00000376925 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CUL3Q13618 AC013270.1-201ENST00000425578 440 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CUL3Q13618 RNA5SP416-201ENST00000516838 111 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
CUL3Q13618 SLC25A1P1-201ENST00000528351 927 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
CUL3Q13618 AC135050.2-203ENST00000529564 725 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CUL3Q13618 TPD52L1-211ENST00000532429 1022 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CUL3Q13618 AC018845.2-201ENST00000568326 409 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
CUL3Q13618 SPATA33-208ENST00000568929 1264 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CUL3Q13618 FLYWCH2-203ENST00000572006 754 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CUL3Q13618 AC004597.1-201ENST00000595525 561 ntTSL 4 BASIC15.78■□□□□ 0.12
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CUL3Q13618 ENOSF1-202ENST00000340116 1658 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CUL3Q13618 TRPM2-208ENST00000621064 1669 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CUL3Q13618 UNG-201ENST00000242576 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CUL3Q13618 TIRAP-203ENST00000392680 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CUL3Q13618 GFAP-225ENST00000638281 2099 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CUL3Q13618 ADORA1-201ENST00000309502 2896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CUL3Q13618 ATG4B-206ENST00000405546 3294 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CUL3Q13618 FBXO45-202ENST00000440469 3689 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CUL3Q13618 API5-202ENST00000420461 2009 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CUL3Q13618 KLHL26-201ENST00000300976 4407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CUL3Q13618 BLMH-201ENST00000261714 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CUL3Q13618 SLC22A6-203ENST00000421062 1560 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CUL3Q13618 TSEN2-205ENST00000444864 2697 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CUL3Q13618 CDH20-203ENST00000538374 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CUL3Q13618 HOXB4-201ENST00000332503 3757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CUL3Q13618 SPDEF-202ENST00000544425 1866 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CUL3Q13618 IL3RA-202ENST00000381469 1476 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CUL3Q13618 TSPAN12-202ENST00000415871 1495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CUL3Q13618 CUL7-203ENST00000535468 5504 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CUL3Q13618 DYNC1LI1-204ENST00000432458 1827 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CUL3Q13618 LPAR1-203ENST00000374431 3637 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CUL3Q13618 RGS3-201ENST00000317613 2542 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CUL3Q13618 WIZ-207ENST00000599910 4609 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CUL3Q13618 SLC25A38-201ENST00000273158 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CUL3Q13618 TATDN3-214ENST00000532324 1381 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CUL3Q13618 IQCF3-205ENST00000456080 1685 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CUL3Q13618 HYAL3-207ENST00000621157 1696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CUL3Q13618 CCNA1-203ENST00000625767 1699 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CUL3Q13618 AL138694.1-201ENST00000637731 1689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CUL3Q13618 PAX8-AS1-204ENST00000436293 2687 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CUL3Q13618 LPO-210ENST00000582328 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CUL3Q13618 ZFPM2-206ENST00000520492 3960 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CUL3Q13618 REM2-202ENST00000536884 1331 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CUL3Q13618 CLN3-216ENST00000565316 1318 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CUL3Q13618 GTF2I-212ENST00000573035 4548 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CUL3Q13618 GPR137C-201ENST00000321662 3888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CUL3Q13618 PIDD1-202ENST00000411829 2886 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CUL3Q13618 MUC1-204ENST00000343256 648 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
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