Protein–RNA interactions for Protein: Q13536

C1orf61, Protein CROC-4, humanhuman

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Length 156 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C1orf61Q13536 FHL1-207ENST00000394155 2706 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
C1orf61Q13536 UBQLN1-201ENST00000257468 2299 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
C1orf61Q13536 FAM172A-204ENST00000505869 1387 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
C1orf61Q13536 AP003397.1-201ENST00000525706 1387 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
C1orf61Q13536 TNFRSF13C-201ENST00000291232 3944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
C1orf61Q13536 FAM92B-201ENST00000539556 1898 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
C1orf61Q13536 CLDND1-222ENST00000510545 2124 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
C1orf61Q13536 PRKCSH-217ENST00000592741 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
C1orf61Q13536 PDE2A-226ENST00000544570 3119 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
C1orf61Q13536 INTS14-209ENST00000567744 2419 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
C1orf61Q13536 EID3-201ENST00000527879 1467 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
C1orf61Q13536 C14orf93-202ENST00000341470 2221 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
C1orf61Q13536 CHRNE-201ENST00000293780 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
C1orf61Q13536 WASHC2C-202ENST00000359860 4471 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
C1orf61Q13536 NRXN2-202ENST00000301894 3535 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
C1orf61Q13536 NSUN5-203ENST00000428206 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
C1orf61Q13536 GCK-209ENST00000616242 2260 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
C1orf61Q13536 CTSB-201ENST00000345125 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
C1orf61Q13536 GFAP-233ENST00000639277 1783 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
C1orf61Q13536 SLC22A6-204ENST00000458333 1521 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
C1orf61Q13536 PDIA3P1-201ENST00000471856 1510 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
C1orf61Q13536 LGALS2-201ENST00000215886 591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
C1orf61Q13536 APOA1-204ENST00000375323 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
C1orf61Q13536 DGCR6-202ENST00000413981 1039 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
C1orf61Q13536 ZNF815P-202ENST00000422825 805 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
C1orf61Q13536 AP000345.1-201ENST00000454863 569 ntTSL 4 BASIC15.35■□□□□ 0.05
C1orf61Q13536 BNIP3P42-201ENST00000454982 569 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
C1orf61Q13536 CTBP2P5-201ENST00000454986 1264 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
C1orf61Q13536 C19orf24-202ENST00000469144 668 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
C1orf61Q13536 KRT18P43-201ENST00000469825 1281 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
C1orf61Q13536 PLEKHA7-214ENST00000532079 565 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
C1orf61Q13536 ENPP7P5-201ENST00000541031 1031 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
C1orf61Q13536 EMC4-203ENST00000557879 1009 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
C1orf61Q13536 TMEM101-204ENST00000587529 965 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
C1orf61Q13536 SMCO4-206ENST00000596676 180 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
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C1orf61Q13536 APOBEC3H-206ENST00000613677 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
C1orf61Q13536 AC011447.5-201ENST00000616168 564 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
C1orf61Q13536 MAP4-202ENST00000360240 5142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
C1orf61Q13536 MLLT10-203ENST00000377072 5126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
C1orf61Q13536 STAT5A-207ENST00000546010 3086 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
C1orf61Q13536 MON1B-203ENST00000545553 1814 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
C1orf61Q13536 SUV39H1-202ENST00000376687 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
C1orf61Q13536 MYB-203ENST00000341911 3672 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
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C1orf61Q13536 SYT1-201ENST00000261205 4808 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
C1orf61Q13536 PDK1-203ENST00000410055 2990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
C1orf61Q13536 APP-204ENST00000357903 3543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
C1orf61Q13536 RGL2-247ENST00000497454 3278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
C1orf61Q13536 SLC22A1-202ENST00000366963 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
C1orf61Q13536 TAP2-202ENST00000374899 2497 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
C1orf61Q13536 FDFT1-202ENST00000443614 1393 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
C1orf61Q13536 HMGXB3-202ENST00000503427 5275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
C1orf61Q13536 TP73-209ENST00000603362 1668 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
C1orf61Q13536 F3-201ENST00000334047 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
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C1orf61Q13536 TBP-206ENST00000540980 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
C1orf61Q13536 SUSD4-202ENST00000343846 3480 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
C1orf61Q13536 RAB38-201ENST00000243662 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
C1orf61Q13536 USE1-206ENST00000595101 1776 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
C1orf61Q13536 TP73-204ENST00000378280 2062 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
C1orf61Q13536 ZNF805-201ENST00000354309 2396 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
C1orf61Q13536 GALNT14-202ENST00000349752 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
C1orf61Q13536 RUSC1-201ENST00000292254 2163 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
C1orf61Q13536 KCNJ12-201ENST00000331718 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
C1orf61Q13536 RTN1-201ENST00000267484 3435 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
C1orf61Q13536 ATXN2-201ENST00000377617 4702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
C1orf61Q13536 COL4A1-204ENST00000543140 2547 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
C1orf61Q13536 SLC4A3-204ENST00000373760 4134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
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C1orf61Q13536 RHCE-205ENST00000349438 1235 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
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C1orf61Q13536 LINC00116-202ENST00000426713 461 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
C1orf61Q13536 GNB3-202ENST00000435982 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
C1orf61Q13536 AL121845.2-201ENST00000467211 252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
C1orf61Q13536 CCKBR-202ENST00000525014 792 ntTSL 4 BASIC15.34■□□□□ 0.05
C1orf61Q13536 AC068587.3-201ENST00000526613 355 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
C1orf61Q13536 EHF-205ENST00000527935 557 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
C1orf61Q13536 PTP4A1P2-201ENST00000546033 454 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
C1orf61Q13536 LINC01220-201ENST00000558575 715 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
C1orf61Q13536 CMC2-214ENST00000565925 640 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
C1orf61Q13536 CLUHP6-201ENST00000580789 941 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
C1orf61Q13536 AC135178.3-201ENST00000583963 531 ntTSL 4 BASIC15.34■□□□□ 0.05
C1orf61Q13536 ZNF180-204ENST00000586637 1023 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
C1orf61Q13536 AC012615.4-201ENST00000586694 607 ntTSL 4 BASIC15.34■□□□□ 0.05
C1orf61Q13536 AL022328.1-201ENST00000610050 478 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
C1orf61Q13536 AC006449.3-201ENST00000620144 563 ntTSL 4 BASIC15.34■□□□□ 0.05
C1orf61Q13536 AC011477.6-201ENST00000604980 1927 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
C1orf61Q13536 BX088651.4-201ENST00000435586 2579 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
C1orf61Q13536 ELN-221ENST00000445912 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
C1orf61Q13536 KCP-208ENST00000620378 4515 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
C1orf61Q13536 DLGAP4-205ENST00000401952 4881 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
C1orf61Q13536 AC009802.1-201ENST00000637973 1609 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
C1orf61Q13536 MSTO2P-201ENST00000314835 1709 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
C1orf61Q13536 VGLL2-202ENST00000352536 1709 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
C1orf61Q13536 BATF2-201ENST00000301887 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
C1orf61Q13536 SP140L-204ENST00000444636 1781 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
C1orf61Q13536 TDRD6-201ENST00000316081 6817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
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