Protein–RNA interactions for Protein: Q13422

IKZF1, DNA-binding protein Ikaros, humanhuman

Predictions only

Length 519 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IKZF1Q13422 HSPA12B-201ENST00000254963 3151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
IKZF1Q13422 ACER2-201ENST00000340967 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
IKZF1Q13422 KRTCAP2-201ENST00000295682 552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
IKZF1Q13422 NPB-201ENST00000333383 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
IKZF1Q13422 ROMO1-201ENST00000336695 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
IKZF1Q13422 AMACR-204ENST00000382085 1195 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
IKZF1Q13422 SGO2-202ENST00000409203 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
IKZF1Q13422 AL354836.1-201ENST00000414042 681 ntTSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
IKZF1Q13422 FAM58CP-201ENST00000435741 640 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
IKZF1Q13422 TM4SF19-204ENST00000454715 1061 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
IKZF1Q13422 CROCCP3-203ENST00000589964 255 ntTSL 3 BASIC13.89□□□□□ -0.19
IKZF1Q13422 FOSB-211ENST00000592436 1057 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
IKZF1Q13422 CLPTM1L-216ENST00000630539 2032 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
IKZF1Q13422 TAOK3-201ENST00000392533 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
IKZF1Q13422 C2orf54-202ENST00000388934 1911 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
IKZF1Q13422 TRIM17-203ENST00000366697 2652 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
IKZF1Q13422 MAST1-201ENST00000251472 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
IKZF1Q13422 ANKMY2-201ENST00000306999 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
IKZF1Q13422 DYNC1LI1-204ENST00000432458 1827 ntTSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
IKZF1Q13422 CCDC85A-201ENST00000407595 3982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
IKZF1Q13422 C5orf66-206ENST00000624272 2479 ntTSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
IKZF1Q13422 TAPBPL-201ENST00000266556 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
IKZF1Q13422 FADS1-216ENST00000542506 1725 ntTSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
IKZF1Q13422 HSPA4L-204ENST00000508776 3020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
IKZF1Q13422 MZF1-201ENST00000215057 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
IKZF1Q13422 ATP6AP2-225ENST00000637482 1648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
IKZF1Q13422 ISLR-202ENST00000395118 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
IKZF1Q13422 BHMT2-205ENST00000521567 1537 ntTSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
IKZF1Q13422 PARVB-210ENST00000619710 1530 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
IKZF1Q13422 TAF6-201ENST00000344095 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
IKZF1Q13422 TIRAP-203ENST00000392680 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
IKZF1Q13422 DEGS2-201ENST00000305631 4352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
IKZF1Q13422 CORO6-201ENST00000345068 2603 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
IKZF1Q13422 RIMS3-201ENST00000372683 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
IKZF1Q13422 TUBB8-201ENST00000561967 1413 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
IKZF1Q13422 POR-201ENST00000394893 2532 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
IKZF1Q13422 GPAT2-202ENST00000434632 3061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
IKZF1Q13422 MEIS3-210ENST00000561096 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
IKZF1Q13422 PARD6G-201ENST00000353265 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
IKZF1Q13422 RASAL2-AS1-202ENST00000421505 2329 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
IKZF1Q13422 INO80-201ENST00000361937 6439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
IKZF1Q13422 CSDC2-201ENST00000306149 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
IKZF1Q13422 PROSER3-202ENST00000396908 2149 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
IKZF1Q13422 RHCE-201ENST00000294413 1591 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
IKZF1Q13422 BID-201ENST00000317361 2495 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
IKZF1Q13422 SPOCK3-202ENST00000357545 2936 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
IKZF1Q13422 CD83-201ENST00000379153 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
IKZF1Q13422 SLC39A1-203ENST00000368621 2398 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
IKZF1Q13422 SPSB2-203ENST00000519357 1496 ntTSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
IKZF1Q13422 TNFRSF14-AS1-201ENST00000416860 3522 ntTSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
IKZF1Q13422 AL928654.2-201ENST00000551271 2279 ntTSL 3 BASIC13.88□□□□□ -0.19
IKZF1Q13422 MYOD1-201ENST00000250003 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
IKZF1Q13422 PRRT2-214ENST00000637064 2153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
IKZF1Q13422 RPTOR-202ENST00000544334 5734 ntTSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
IKZF1Q13422 NOS1AP-201ENST00000361897 4931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
IKZF1Q13422 FBXW9-201ENST00000393261 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
IKZF1Q13422 ZFAND6-222ENST00000613266 1729 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.88□□□□□ -0.19
IKZF1Q13422 LLGL2-201ENST00000167462 3480 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
IKZF1Q13422 CGREF1-201ENST00000260595 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
IKZF1Q13422 TMEM42-201ENST00000302392 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
IKZF1Q13422 SMN1-201ENST00000351205 900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
IKZF1Q13422 MRPL9-202ENST00000368830 1296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
IKZF1Q13422 HIST1H2BD-202ENST00000377777 496 ntAPPRIS P1 BASIC13.88□□□□□ -0.19
IKZF1Q13422 SMN2-201ENST00000380741 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
IKZF1Q13422 YBX2P1-201ENST00000394192 760 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
IKZF1Q13422 C2orf49-202ENST00000410049 854 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
IKZF1Q13422 PMS2P4-201ENST00000412466 1052 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
IKZF1Q13422 AC004832.2-201ENST00000426397 482 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
IKZF1Q13422 SPDYE2-202ENST00000432940 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
IKZF1Q13422 AL162431.1-201ENST00000434447 543 ntTSL 3 BASIC13.88□□□□□ -0.19
IKZF1Q13422 SPDYE2B-201ENST00000436228 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
IKZF1Q13422 AC140658.5-201ENST00000438532 169 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
IKZF1Q13422 CR559946.1-201ENST00000453835 531 ntTSL 4 BASIC13.88□□□□□ -0.19
IKZF1Q13422 SPDYE5-201ENST00000455862 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
IKZF1Q13422 AC112191.1-201ENST00000523689 701 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
IKZF1Q13422 MVB12A-211ENST00000529939 1091 ntTSL 3 BASIC13.88□□□□□ -0.19
IKZF1Q13422 TMEM258-204ENST00000537328 575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
IKZF1Q13422 AP000763.4-201ENST00000544674 752 ntTSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
IKZF1Q13422 TMEM97-205ENST00000583381 578 ntTSL 4 BASIC13.88□□□□□ -0.19
IKZF1Q13422 AC010327.4-202ENST00000591484 748 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
IKZF1Q13422 MTDHP5-201ENST00000598980 586 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
IKZF1Q13422 AL009183.1-201ENST00000603760 355 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
IKZF1Q13422 AC091812.2-201ENST00000619081 385 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
IKZF1Q13422 SMN2-216ENST00000638794 846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
IKZF1Q13422 MFN2-203ENST00000444836 4531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
IKZF1Q13422 NSUN5-202ENST00000310326 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
IKZF1Q13422 TMEM143-202ENST00000377431 1960 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
IKZF1Q13422 ZBTB37-203ENST00000367704 2323 ntTSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
IKZF1Q13422 HTR7-201ENST00000277874 3028 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
IKZF1Q13422 LMX1B-201ENST00000355497 5809 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
IKZF1Q13422 ITSN1-212ENST00000399367 5722 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
IKZF1Q13422 NCKIPSD-204ENST00000416649 2925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
IKZF1Q13422 KCNQ2-209ENST00000625514 2925 ntTSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
IKZF1Q13422 ZNF662-201ENST00000328199 3186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
IKZF1Q13422 SEPT9-228ENST00000590294 2816 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
IKZF1Q13422 AC010327.5-201ENST00000586923 3061 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
IKZF1Q13422 CBWD1-201ENST00000314367 1771 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
IKZF1Q13422 MED4-201ENST00000258648 2022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
IKZF1Q13422 HTR1B-201ENST00000369947 2021 ntAPPRIS P1 BASIC13.88□□□□□ -0.19
IKZF1Q13422 CRYM-AS1-201ENST00000338573 1661 ntTSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.5 ms