Protein–RNA interactions for Protein: Q12908

SLC10A2, Ileal sodium/bile acid cotransporter, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 348 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC10A2Q12908 DUS2-202ENST00000432752 1864 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SLC10A2Q12908 C16orf54-201ENST00000329410 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SLC10A2Q12908 SUFU-202ENST00000369902 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SLC10A2Q12908 CBX8-201ENST00000269385 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SLC10A2Q12908 GPS1-227ENST00000623761 1943 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SLC10A2Q12908 SCART1-206ENST00000640237 4351 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SLC10A2Q12908 ASAH1-210ENST00000520781 2245 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SLC10A2Q12908 DXO-203ENST00000375356 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SLC10A2Q12908 AC005622.1-202ENST00000637093 1543 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SLC10A2Q12908 PRRG1-203ENST00000463135 1663 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SLC10A2Q12908 RCL1-204ENST00000381750 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SLC10A2Q12908 SHANK2-204ENST00000409530 2123 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SLC10A2Q12908 SPAG6-201ENST00000313311 2421 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SLC10A2Q12908 ZNF76-202ENST00000339411 2447 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SLC10A2Q12908 EPHA8-201ENST00000166244 4943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SLC10A2Q12908 TRIM7-203ENST00000393315 2851 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SLC10A2Q12908 CDH7-203ENST00000536984 3766 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SLC10A2Q12908 CACNA1B-205ENST00000371363 9758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SLC10A2Q12908 SPATA21-201ENST00000335496 2015 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SLC10A2Q12908 VGLL2-202ENST00000352536 1709 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SLC10A2Q12908 OR5C1-201ENST00000373680 963 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SLC10A2Q12908 OCIAD1-202ENST00000381473 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SLC10A2Q12908 ADD2-208ENST00000430656 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SLC10A2Q12908 RPL13P2-201ENST00000440687 659 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
SLC10A2Q12908 USP40-206ENST00000443711 628 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SLC10A2Q12908 SERBP1P3-201ENST00000459980 809 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
SLC10A2Q12908 LAMTOR4-206ENST00000473459 720 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SLC10A2Q12908 RHBDL2-203ENST00000540558 697 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SLC10A2Q12908 PCED1B-202ENST00000546455 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SLC10A2Q12908 LINC00207-204ENST00000605505 666 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SLC10A2Q12908 MALAT1-213ENST00000618227 593 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SLC10A2Q12908 AL590560.3-201ENST00000623350 461 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
SLC10A2Q12908 AC105277.1-203ENST00000635492 1293 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SLC10A2Q12908 AL359644.1-202ENST00000637541 571 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SLC10A2Q12908 NUS1-201ENST00000368494 4676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SLC10A2Q12908 ABHD14B-201ENST00000315877 2236 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SLC10A2Q12908 CPA1-201ENST00000011292 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SLC10A2Q12908 CCDC28A-201ENST00000332797 1496 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SLC10A2Q12908 UROC1-202ENST00000383579 2735 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SLC10A2Q12908 JAG1-201ENST00000254958 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SLC10A2Q12908 SMAD4-201ENST00000342988 8769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SLC10A2Q12908 NUP88-207ENST00000573584 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SLC10A2Q12908 C11orf80-201ENST00000360962 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SLC10A2Q12908 AEN-201ENST00000332810 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
SLC10A2Q12908 ASH2L-212ENST00000545394 2808 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SLC10A2Q12908 DUSP26-203ENST00000523956 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SLC10A2Q12908 SNX1-213ENST00000561026 1374 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SLC10A2Q12908 SLC2A4-202ENST00000424875 1852 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SLC10A2Q12908 SYP-207ENST00000479808 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SLC10A2Q12908 CACNA1A-225ENST00000636389 8137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SLC10A2Q12908 COX10-201ENST00000261643 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SLC10A2Q12908 TUBGCP2-204ENST00000417178 4029 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SLC10A2Q12908 TNIP1-219ENST00000524280 1716 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SLC10A2Q12908 LAP3-201ENST00000226299 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SLC10A2Q12908 HTR3A-203ENST00000375498 2235 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SLC10A2Q12908 DDX1-201ENST00000233084 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SLC10A2Q12908 GFY-202ENST00000610896 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SLC10A2Q12908 ARHGAP9-201ENST00000393791 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SLC10A2Q12908 LRP4-201ENST00000378623 8076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SLC10A2Q12908 ZNF397-201ENST00000261333 1419 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SLC10A2Q12908 AC100757.3-201ENST00000622361 1406 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
SLC10A2Q12908 AKAP1-202ENST00000337714 3970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SLC10A2Q12908 SORT1-201ENST00000256637 7028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SLC10A2Q12908 RTN1-209ENST00000611068 2647 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SLC10A2Q12908 JTB-201ENST00000271843 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SLC10A2Q12908 TMEM52-201ENST00000310991 929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SLC10A2Q12908 NKAIN2-201ENST00000368416 1106 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SLC10A2Q12908 LY6G6C-201ENST00000375819 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SLC10A2Q12908 STPG3-201ENST00000388931 1207 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SLC10A2Q12908 ZC3H12D-202ENST00000409948 753 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SLC10A2Q12908 TSSK5P-201ENST00000423978 907 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
SLC10A2Q12908 LINC01160-201ENST00000441004 768 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SLC10A2Q12908 PIGZ-204ENST00000443835 675 ntTSL 4 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SLC10A2Q12908 FAM86GP-201ENST00000448322 971 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
SLC10A2Q12908 AL359815.1-201ENST00000457706 821 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SLC10A2Q12908 AC067863.1-201ENST00000494933 530 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
SLC10A2Q12908 LINC02437-201ENST00000505053 911 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SLC10A2Q12908 LINC01184-209ENST00000514573 609 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SLC10A2Q12908 LY6E-204ENST00000519546 971 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SLC10A2Q12908 AC044860.1-202ENST00000559481 777 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
SLC10A2Q12908 AL158211.3-201ENST00000607385 239 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
SLC10A2Q12908 AC243773.2-203ENST00000612281 640 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SLC10A2Q12908 AL109936.8-201ENST00000641772 604 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
SLC10A2Q12908 LMF2-201ENST00000216080 2658 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SLC10A2Q12908 MKNK2-201ENST00000250896 3774 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SLC10A2Q12908 PSMD2-201ENST00000310118 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SLC10A2Q12908 DACT3-203ENST00000410105 3085 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SLC10A2Q12908 ACOT9-201ENST00000336430 1675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SLC10A2Q12908 AC087499.5-201ENST00000452760 1342 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
SLC10A2Q12908 KCTD20-202ENST00000373731 5619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SLC10A2Q12908 AL035460.1-201ENST00000380593 1866 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SLC10A2Q12908 CHAF1A-201ENST00000301280 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SLC10A2Q12908 GRB7-204ENST00000394211 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SLC10A2Q12908 TAOK2-202ENST00000308893 5169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SLC10A2Q12908 PEPD-201ENST00000244137 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SLC10A2Q12908 APBB1-218ENST00000608655 1920 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SLC10A2Q12908 PAQR6-204ENST00000356983 2143 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SLC10A2Q12908 DBH-AS1-201ENST00000425189 2139 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SLC10A2Q12908 POLG2-201ENST00000539111 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SLC10A2Q12908 WSCD1-208ENST00000573634 1573 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36 ms