Protein–RNA interactions for Protein: Q0VFZ6

CCDC173, Coiled-coil domain-containing protein 173, humanhuman

Predictions only

Length 552 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC173Q0VFZ6 TTLL10-AS1-201ENST00000379317 3532 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
CCDC173Q0VFZ6 ARPC4-TTLL3-201ENST00000397256 2466 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
CCDC173Q0VFZ6 TNIK-202ENST00000341852 4727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CCDC173Q0VFZ6 UNC13B-201ENST00000378495 6303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CCDC173Q0VFZ6 TNS2-201ENST00000314250 5010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CCDC173Q0VFZ6 MAGEA12-201ENST00000357916 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CCDC173Q0VFZ6 RBPJ-206ENST00000361572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CCDC173Q0VFZ6 GABARAPL1-218ENST00000546017 2294 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
CCDC173Q0VFZ6 LRIG3-201ENST00000320743 4070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CCDC173Q0VFZ6 PLEKHO2-201ENST00000323544 3720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CCDC173Q0VFZ6 LINC00475-202ENST00000416438 2506 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
CCDC173Q0VFZ6 ESM1-201ENST00000381403 1326 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
CCDC173Q0VFZ6 PRKRA-203ENST00000432031 1344 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
CCDC173Q0VFZ6 CCDC74A-206ENST00000467992 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
CCDC173Q0VFZ6 TCOF1-201ENST00000323668 4832 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
CCDC173Q0VFZ6 ACOXL-201ENST00000340561 2188 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
CCDC173Q0VFZ6 MYOD1-201ENST00000250003 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CCDC173Q0VFZ6 PRDM15-201ENST00000269844 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CCDC173Q0VFZ6 AL365205.1-204ENST00000359201 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CCDC173Q0VFZ6 NDRG2-209ENST00000397853 2079 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
CCDC173Q0VFZ6 MAGEA8-205ENST00000542674 2084 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
CCDC173Q0VFZ6 RNF183-206ENST00000478815 2312 ntAPPRIS P1 BASIC17.95■□□□□ 0.46
CCDC173Q0VFZ6 AC004890.2-205ENST00000416232 2804 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
CCDC173Q0VFZ6 ALOX12-AS1-201ENST00000399540 1730 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
CCDC173Q0VFZ6 NFIC-203ENST00000443272 1716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
CCDC173Q0VFZ6 AC026688.2-201ENST00000518984 1734 ntTSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
CCDC173Q0VFZ6 SCYL1-205ENST00000524944 2715 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CCDC173Q0VFZ6 RLIM-202ENST00000349225 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
CCDC173Q0VFZ6 ESYT3-201ENST00000289135 1356 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
CCDC173Q0VFZ6 SCAMP4-202ENST00000409472 2394 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
CCDC173Q0VFZ6 SLC4A7-212ENST00000446700 4000 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CCDC173Q0VFZ6 MBD1-201ENST00000269468 3259 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
CCDC173Q0VFZ6 ADAMTS15-201ENST00000299164 5673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CCDC173Q0VFZ6 EIF5-202ENST00000392715 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CCDC173Q0VFZ6 USF2-202ENST00000343550 1523 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CCDC173Q0VFZ6 CLDN15-208ENST00000611078 1509 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
CCDC173Q0VFZ6 KCNH6-202ENST00000456941 2928 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
CCDC173Q0VFZ6 WNT9B-202ENST00000393461 2654 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
CCDC173Q0VFZ6 GJC3-201ENST00000312891 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CCDC173Q0VFZ6 GGT1-208ENST00000404920 657 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CCDC173Q0VFZ6 ING5-202ENST00000406941 946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CCDC173Q0VFZ6 CDK2AP2P3-201ENST00000422476 372 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
CCDC173Q0VFZ6 LINC01237-203ENST00000430555 843 ntTSL 4 BASIC17.95■□□□□ 0.46
CCDC173Q0VFZ6 AP002383.4-201ENST00000442518 975 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
CCDC173Q0VFZ6 DMKN-212ENST00000443640 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
CCDC173Q0VFZ6 MMP24-AS1-209ENST00000456790 712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
CCDC173Q0VFZ6 GGTLC2-203ENST00000480559 657 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CCDC173Q0VFZ6 NDUFB9-202ENST00000517367 636 ntTSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
CCDC173Q0VFZ6 ERCC5-207ENST00000535557 1125 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
CCDC173Q0VFZ6 SPINT1-AS1-202ENST00000564302 643 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
CCDC173Q0VFZ6 LAT-211ENST00000566177 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CCDC173Q0VFZ6 DEF8-228ENST00000610455 816 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CCDC173Q0VFZ6 AXIN2-208ENST00000611991 1019 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
CCDC173Q0VFZ6 DHRS4L2-211ENST00000621761 1049 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
CCDC173Q0VFZ6 TMPRSS9-201ENST00000332578 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CCDC173Q0VFZ6 STK17B-201ENST00000263955 5287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CCDC173Q0VFZ6 HNRNPDL-208ENST00000621267 4139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CCDC173Q0VFZ6 B4GALNT3-201ENST00000266383 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CCDC173Q0VFZ6 C15orf52-206ENST00000559313 3022 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
CCDC173Q0VFZ6 AMACR-205ENST00000426255 1316 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
CCDC173Q0VFZ6 SRSF1-208ENST00000584773 1317 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
CCDC173Q0VFZ6 AL359881.3-201ENST00000602640 1721 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
CCDC173Q0VFZ6 ADSL-220ENST00000636714 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
CCDC173Q0VFZ6 TMED9-201ENST00000332598 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CCDC173Q0VFZ6 SAFB2-201ENST00000252542 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CCDC173Q0VFZ6 FANCA-203ENST00000389302 1641 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CCDC173Q0VFZ6 C1QTNF6-202ENST00000397110 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CCDC173Q0VFZ6 GCK-204ENST00000403799 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CCDC173Q0VFZ6 GSTO2-203ENST00000450629 1391 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
CCDC173Q0VFZ6 TEX13A-201ENST00000600991 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CCDC173Q0VFZ6 TPM3-208ENST00000341485 2063 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CCDC173Q0VFZ6 TIE1-201ENST00000372476 3882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CCDC173Q0VFZ6 TOB2-201ENST00000327492 4561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CCDC173Q0VFZ6 TMUB2-213ENST00000589856 1505 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
CCDC173Q0VFZ6 YME1L1-202ENST00000375972 2517 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CCDC173Q0VFZ6 PRNP-203ENST00000430350 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CCDC173Q0VFZ6 LAT2-205ENST00000460943 2527 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CCDC173Q0VFZ6 MRPS17-201ENST00000285298 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CCDC173Q0VFZ6 RSPO3-201ENST00000356698 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CCDC173Q0VFZ6 FBRS-201ENST00000287468 2811 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
CCDC173Q0VFZ6 TMEM150B-201ENST00000326652 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CCDC173Q0VFZ6 TOR3A-201ENST00000352445 1182 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CCDC173Q0VFZ6 CGB7-201ENST00000377280 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
CCDC173Q0VFZ6 RPP38-203ENST00000378202 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CCDC173Q0VFZ6 GGT1-204ENST00000401885 968 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CCDC173Q0VFZ6 AL645608.6-201ENST00000418300 402 ntTSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
CCDC173Q0VFZ6 B4GALT1-AS1-202ENST00000442432 843 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
CCDC173Q0VFZ6 ANKRD13D-218ENST00000515828 1111 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CCDC173Q0VFZ6 RNASEH2C-202ENST00000527610 835 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
CCDC173Q0VFZ6 GSTO1-207ENST00000539281 1052 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
CCDC173Q0VFZ6 AL160237.2-201ENST00000556165 472 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
CCDC173Q0VFZ6 AC015712.1-203ENST00000559331 593 ntTSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
CCDC173Q0VFZ6 CARHSP1-205ENST00000562843 843 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
CCDC173Q0VFZ6 AC129926.1-201ENST00000581944 614 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
CCDC173Q0VFZ6 TBCB-205ENST00000585746 875 ntTSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
CCDC173Q0VFZ6 IL11-204ENST00000590625 1028 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
CCDC173Q0VFZ6 PGPEP1-209ENST00000604499 769 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
CCDC173Q0VFZ6 PXDNL-201ENST00000356297 4805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CCDC173Q0VFZ6 CEP170B-204ENST00000556508 6683 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
CCDC173Q0VFZ6 WASH6P-202ENST00000359512 1437 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.7 ms