Protein–RNA interactions for Protein: Q05682

CALD1, Caldesmon, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 793 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CALD1Q05682 VASH1-203ENST00000554237 1462 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CALD1Q05682 TPD52L2-203ENST00000348257 2237 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CALD1Q05682 AL353608.3-201ENST00000603200 2211 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CALD1Q05682 ZFP41-201ENST00000330701 4797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CALD1Q05682 CARD11-203ENST00000396946 4366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CALD1Q05682 ADD1-205ENST00000398125 4079 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CALD1Q05682 DFNA5-202ENST00000409775 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CALD1Q05682 CHD1L-203ENST00000369259 2358 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CALD1Q05682 CXorf38-202ENST00000378421 2380 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CALD1Q05682 SFT2D1-201ENST00000361731 1079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CALD1Q05682 AQP7-204ENST00000379506 1062 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CALD1Q05682 KRTAP6-3-201ENST00000391624 636 ntAPPRIS P1 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CALD1Q05682 AL161785.3-201ENST00000435157 395 ntTSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CALD1Q05682 PTPRG-AS1-205ENST00000475371 733 ntTSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CALD1Q05682 AC009902.2-201ENST00000518880 620 ntTSL 4 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CALD1Q05682 CHMP4A-204ENST00000530996 967 ntTSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CALD1Q05682 AC233702.7-201ENST00000536958 924 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CALD1Q05682 NUBP2-208ENST00000565987 1049 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CALD1Q05682 COMMD4-217ENST00000567195 677 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CALD1Q05682 AC036164.1-201ENST00000570544 333 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
CALD1Q05682 AC015910.1-201ENST00000579400 975 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
CALD1Q05682 AC138761.1-201ENST00000584393 385 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
CALD1Q05682 AC011499.1-201ENST00000586012 581 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CALD1Q05682 PTPRS-208ENST00000590509 893 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CALD1Q05682 TAMM41-212ENST00000630288 607 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CALD1Q05682 PDE4C-202ENST00000355502 5979 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CALD1Q05682 PTCH1-201ENST00000331920 8057 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CALD1Q05682 MCF2L2-208ENST00000473233 4748 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CALD1Q05682 GOLIM4-201ENST00000309027 2100 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CALD1Q05682 RPN1-207ENST00000497289 2137 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CALD1Q05682 UVSSA-208ENST00000511563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CALD1Q05682 PCDHB6-202ENST00000622991 2608 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CALD1Q05682 SLC4A3-204ENST00000373760 4134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CALD1Q05682 BNC1-201ENST00000345382 4610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CALD1Q05682 RABL2B-204ENST00000395593 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CALD1Q05682 ZNF628-201ENST00000391718 3177 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CALD1Q05682 PLPPR2-201ENST00000251473 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CALD1Q05682 VGLL2-202ENST00000352536 1709 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CALD1Q05682 KRT2-201ENST00000309680 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CALD1Q05682 AC008770.3-201ENST00000590798 1562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CALD1Q05682 DDHD1-202ENST00000357758 5603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CALD1Q05682 TSG101-204ENST00000536719 2101 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CALD1Q05682 KHNYN-202ENST00000553935 3359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CALD1Q05682 WASF1-207ENST00000392589 3220 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CALD1Q05682 AKR1B15-202ENST00000457545 1621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CALD1Q05682 MGRN1-201ENST00000262370 3968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CALD1Q05682 RPL18A-201ENST00000222247 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CALD1Q05682 TMEM26-AS1-201ENST00000389640 863 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CALD1Q05682 AC079336.2-201ENST00000578408 927 ntTSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CALD1Q05682 ZNF324B-203ENST00000594214 564 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CALD1Q05682 LINC01703-202ENST00000602806 595 ntTSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CALD1Q05682 AC000095.1-201ENST00000603208 874 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
CALD1Q05682 AC247036.4-201ENST00000632099 353 ntAPPRIS P1 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CALD1Q05682 PRF1-203ENST00000638674 1080 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CALD1Q05682 OR2T27-203ENST00000641652 1285 ntAPPRIS P1 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CALD1Q05682 TCF25-202ENST00000263347 2377 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CALD1Q05682 LINC02551-202ENST00000533812 2203 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CALD1Q05682 NEO1-202ENST00000339362 7342 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CALD1Q05682 SAMD4A-208ENST00000555192 1337 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CALD1Q05682 KLK8-211ENST00000600767 1324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CALD1Q05682 AL121723.1-201ENST00000445194 1519 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
CALD1Q05682 BEGAIN-201ENST00000355173 2674 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CALD1Q05682 LINC02199-201ENST00000506655 2702 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
CALD1Q05682 KIAA0391-202ENST00000321130 1589 ntTSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CALD1Q05682 PTPRN2-201ENST00000389413 4723 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CALD1Q05682 GNAL-202ENST00000334049 6535 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CALD1Q05682 SCYL1-206ENST00000525364 2584 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CALD1Q05682 FAM76B-201ENST00000358780 3952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CALD1Q05682 GOLM1-203ENST00000388712 3046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CALD1Q05682 AC127383.1-201ENST00000444697 1800 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
CALD1Q05682 KIRREL1-202ENST00000360089 3304 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CALD1Q05682 EXT2-210ENST00000533608 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CALD1Q05682 RBPMS-204ENST00000397323 2941 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CALD1Q05682 AGFG1-202ENST00000373671 1669 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CALD1Q05682 POR-218ENST00000461988 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CALD1Q05682 TRIM74-202ENST00000395244 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CALD1Q05682 AC093151.3-201ENST00000425554 623 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CALD1Q05682 TRIM73-204ENST00000447409 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CALD1Q05682 METTL21A-209ENST00000448823 869 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CALD1Q05682 AC147067.1-201ENST00000466692 579 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CALD1Q05682 PRKAG2-AS1-202ENST00000467458 1064 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CALD1Q05682 YEATS4-202ENST00000548020 1100 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CALD1Q05682 AC108134.3-202ENST00000571404 1207 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CALD1Q05682 NOP16-209ENST00000618911 1087 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CALD1Q05682 MIB1-201ENST00000261537 9576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CALD1Q05682 ABCB7-201ENST00000253577 2377 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CALD1Q05682 SLC22A6-204ENST00000458333 1521 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CALD1Q05682 MEX3C-204ENST00000616921 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CALD1Q05682 DUOX1-202ENST00000389037 5483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CALD1Q05682 SLIT1-204ENST00000371070 4564 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CALD1Q05682 SPATS1-201ENST00000288390 1354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CALD1Q05682 TK2-201ENST00000299697 5114 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.87
CALD1Q05682 CYP2U1-201ENST00000332884 4944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CALD1Q05682 AKT1-214ENST00000555528 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CALD1Q05682 AL136379.1-201ENST00000623471 2642 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
CALD1Q05682 LINC00668-206ENST00000581725 1902 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
CALD1Q05682 SUCLA2-201ENST00000378654 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CALD1Q05682 MAP4-202ENST00000360240 5142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CALD1Q05682 KIFC1-211ENST00000428849 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CALD1Q05682 NCOA1-205ENST00000406961 7289 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.9 ms