Protein–RNA interactions for Protein: Q04206

RELA, Transcription factor p65, humanhuman

Predictions only

Length 551 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RELAQ04206 CPEB2-204ENST00000382401 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RELAQ04206 ACOXL-201ENST00000340561 2188 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RELAQ04206 HPN-201ENST00000262626 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RELAQ04206 CCDC83-201ENST00000280245 2358 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RELAQ04206 CDH1-202ENST00000422392 2567 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RELAQ04206 ARHGAP9-203ENST00000424809 2569 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RELAQ04206 UBA5-213ENST00000494238 2997 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RELAQ04206 JAK3-201ENST00000458235 5432 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RELAQ04206 NRSN1-203ENST00000378478 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RELAQ04206 SLC29A1-205ENST00000371740 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RELAQ04206 PPHLN1-204ENST00000358314 1643 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RELAQ04206 VWA1-203ENST00000476993 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RELAQ04206 CRHR2-208ENST00000506074 3109 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RELAQ04206 BRAT1-201ENST00000340611 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RELAQ04206 CANT1-211ENST00000591773 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RELAQ04206 OSBPL5-210ENST00000525498 2733 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RELAQ04206 USE1-201ENST00000263897 843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RELAQ04206 KLK8-202ENST00000320838 456 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RELAQ04206 RPL37AP1-201ENST00000412502 279 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
RELAQ04206 TMEM120A-203ENST00000439537 1161 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RELAQ04206 AC091729.1-201ENST00000449721 869 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RELAQ04206 PRICKLE2-AS1-203ENST00000476308 623 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RELAQ04206 FXR1-221ENST00000491674 365 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RELAQ04206 AC025183.2-201ENST00000503386 428 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RELAQ04206 AC106872.10-201ENST00000503778 747 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RELAQ04206 TSC22D3-213ENST00000506081 956 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RELAQ04206 RNA5SP421-201ENST00000516864 134 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
RELAQ04206 AL583722.3-202ENST00000554954 486 ntTSL 4 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RELAQ04206 DUT-210ENST00000559935 569 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RELAQ04206 TEX28P1-201ENST00000613479 1221 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
RELAQ04206 AC106028.4-201ENST00000614509 607 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
RELAQ04206 TEX28P2-201ENST00000617764 1221 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
RELAQ04206 SPDYE12P-201ENST00000618416 771 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
RELAQ04206 SGSH-201ENST00000326317 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RELAQ04206 SALL4-203ENST00000395997 1918 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RELAQ04206 PSEN2-203ENST00000422240 1947 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RELAQ04206 ATP2A2-204ENST00000539276 4094 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RELAQ04206 OSGIN1-201ENST00000343939 2391 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RELAQ04206 PPP1R3E-201ENST00000452015 4773 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RELAQ04206 TBXAS1-201ENST00000336425 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RELAQ04206 SLC9A5-201ENST00000299798 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RELAQ04206 HNRNPH3-202ENST00000354695 1332 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RELAQ04206 AC139749.1-202ENST00000617529 3139 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
RELAQ04206 BNIP3P1-202ENST00000550043 1585 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
RELAQ04206 LINC01529-205ENST00000637365 2000 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RELAQ04206 ASIC1-201ENST00000228468 4072 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RELAQ04206 MECR-201ENST00000263702 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RELAQ04206 MLKL-202ENST00000308807 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RELAQ04206 SMARCA4-203ENST00000429416 5691 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
RELAQ04206 DTD2-202ENST00000356180 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RELAQ04206 KRT8P37-201ENST00000451609 1420 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
RELAQ04206 KTN1-AS1-202ENST00000412224 2185 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
RELAQ04206 AC012485.3-201ENST00000637634 2424 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
RELAQ04206 TAGLN3-202ENST00000393917 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
RELAQ04206 AC069224.1-201ENST00000566372 1715 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
RELAQ04206 ADSL-220ENST00000636714 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
RELAQ04206 MBD1-210ENST00000457839 2473 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
RELAQ04206 KCND3-202ENST00000315987 2716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RELAQ04206 DMRTC2-201ENST00000269945 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RELAQ04206 MAGEA8-201ENST00000286482 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RELAQ04206 SLIT1-204ENST00000371070 4564 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
RELAQ04206 MANBAL-204ENST00000397151 1503 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
RELAQ04206 MANBAL-205ENST00000397152 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RELAQ04206 HFE-208ENST00000397022 1280 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RELAQ04206 AC241585.1-201ENST00000433527 519 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
RELAQ04206 U52111.1-201ENST00000434284 914 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
RELAQ04206 SHF-202ENST00000458022 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
RELAQ04206 HFE-214ENST00000488199 781 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RELAQ04206 AC027369.6-201ENST00000525520 931 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
RELAQ04206 OBP2A-206ENST00000539850 914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
RELAQ04206 AC138304.1-201ENST00000563841 424 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
RELAQ04206 MIR6069-201ENST00000620069 79 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
RELAQ04206 AL590560.3-201ENST00000623350 461 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
RELAQ04206 LRRFIP1-201ENST00000244815 4370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RELAQ04206 DCBLD1-202ENST00000338728 3626 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
RELAQ04206 NDRG2-211ENST00000397858 2054 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
RELAQ04206 AC069281.2-201ENST00000485071 4401 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
RELAQ04206 GIGYF1-201ENST00000275732 6530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RELAQ04206 PRKACG-201ENST00000377276 1585 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
RELAQ04206 AL139082.1-201ENST00000613982 3433 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RELAQ04206 USP25-201ENST00000285679 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RELAQ04206 CSAD-208ENST00000444623 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RELAQ04206 GINS2-201ENST00000253462 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RELAQ04206 ZNF252P-AS1-201ENST00000527067 3236 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
RELAQ04206 PCYOX1-201ENST00000264441 2959 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
RELAQ04206 HM13-202ENST00000340852 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RELAQ04206 MSI2-204ENST00000442934 1624 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
RELAQ04206 AKR1B15-202ENST00000457545 1621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
RELAQ04206 ZFPL1-201ENST00000294258 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RELAQ04206 BACE1-201ENST00000313005 6326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RELAQ04206 ELN-208ENST00000380575 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RELAQ04206 NUP58-201ENST00000381718 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
RELAQ04206 KIFC3-207ENST00000543930 3018 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
RELAQ04206 FP565260.3-204ENST00000623795 2238 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
RELAQ04206 KRT8-215ENST00000552150 1687 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RELAQ04206 ANTXR1-201ENST00000303714 5859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RELAQ04206 COG5-203ENST00000393603 5418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
RELAQ04206 EXOC6B-209ENST00000634650 2583 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
RELAQ04206 TGFBR2-201ENST00000295754 4621 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
RELAQ04206 HOXB4-201ENST00000332503 3757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.7 ms