Protein–RNA interactions for Protein: Q01892

SPIB, Transcription factor Spi-B, humanhuman

Predictions only

Length 262 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPIBQ01892 GPER1-201ENST00000297469 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
SPIBQ01892 PGAP3-211ENST00000619169 2094 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
SPIBQ01892 KRT8P44-201ENST00000441609 1350 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
SPIBQ01892 ARHGEF16-201ENST00000378371 2219 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
SPIBQ01892 PNPLA3-203ENST00000423180 2222 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
SPIBQ01892 KREMEN1-201ENST00000327813 2719 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
SPIBQ01892 TRAPPC8-201ENST00000283351 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
SPIBQ01892 RUNDC1-201ENST00000361677 3828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
SPIBQ01892 NUP98-201ENST00000324932 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
SPIBQ01892 CSRNP2-201ENST00000228515 4471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
SPIBQ01892 TMEM41B-204ENST00000528080 3968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
SPIBQ01892 AC007686.3-201ENST00000619017 3487 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
SPIBQ01892 AL390038.1-201ENST00000419814 2481 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
SPIBQ01892 AL359258.1-201ENST00000438965 2481 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
SPIBQ01892 PHAX-201ENST00000297540 4288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
SPIBQ01892 SIRT6-202ENST00000337491 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
SPIBQ01892 UBC-205ENST00000536769 3745 ntAPPRIS P1 BASIC14.71□□□□□ -0.05
SPIBQ01892 MARS-233ENST00000628866 2583 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
SPIBQ01892 GOLGA2P9-201ENST00000596977 1937 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
SPIBQ01892 KCNMA1-202ENST00000286628 6233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
SPIBQ01892 CKLF-204ENST00000362093 412 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
SPIBQ01892 CSF3-203ENST00000394148 622 ntTSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
SPIBQ01892 AL049612.1-201ENST00000427017 694 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
SPIBQ01892 RAP1B-229ENST00000543393 874 ntTSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
SPIBQ01892 UBE2Q2P1-205ENST00000559871 534 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
SPIBQ01892 AL773604.1-201ENST00000617417 272 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
SPIBQ01892 MED16-214ENST00000617672 554 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
SPIBQ01892 SLC26A1-205ENST00000622731 1057 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
SPIBQ01892 VPS51-217ENST00000639871 243 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
SPIBQ01892 ODF2-202ENST00000372791 2375 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
SPIBQ01892 C16orf89-202ENST00000472572 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
SPIBQ01892 PARP10-201ENST00000313028 3497 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
SPIBQ01892 RASGRF2-206ENST00000638442 2842 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
SPIBQ01892 CCDC40-202ENST00000374876 2010 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
SPIBQ01892 MAPK7-204ENST00000395604 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
SPIBQ01892 SNRPF-201ENST00000266735 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
SPIBQ01892 JPH4-201ENST00000356300 4278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
SPIBQ01892 AC126365.1-201ENST00000578585 1514 ntBASIC14.71□□□□□ -0.06
SPIBQ01892 CYB561A3-203ENST00000447532 1803 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.06
SPIBQ01892 AC007292.2-201ENST00000593524 1812 ntBASIC14.71□□□□□ -0.06
SPIBQ01892 AC004834.1-201ENST00000640784 2412 ntTSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.06
SPIBQ01892 PPM1F-201ENST00000263212 5143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
SPIBQ01892 COL17A1-201ENST00000353479 5734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
SPIBQ01892 NF2-209ENST00000403999 2999 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
SPIBQ01892 ZBTB32-202ENST00000392197 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
SPIBQ01892 EIF4A1-201ENST00000293831 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
SPIBQ01892 MAPKAPK5-207ENST00000551404 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
SPIBQ01892 LRRN1-201ENST00000319331 3823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
SPIBQ01892 EFCAB2-202ENST00000366522 6167 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
SPIBQ01892 YTHDC1-202ENST00000355665 3244 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
SPIBQ01892 RTN1-209ENST00000611068 2647 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
SPIBQ01892 KCNMA1-262ENST00000639489 4302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
SPIBQ01892 PCCB-204ENST00000462637 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
SPIBQ01892 HIC2-202ENST00000407598 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
SPIBQ01892 BNIP3P1-202ENST00000550043 1585 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
SPIBQ01892 ACSL6-201ENST00000296869 2561 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
SPIBQ01892 PLTP-204ENST00000420868 1420 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
SPIBQ01892 PTPN9-206ENST00000618819 7813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
SPIBQ01892 ZNF586-201ENST00000391702 2265 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
SPIBQ01892 SLX1A-202ENST00000345535 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
SPIBQ01892 MYL6-202ENST00000348108 722 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
SPIBQ01892 SLX1B-202ENST00000351581 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
SPIBQ01892 WWOX-204ENST00000408984 1227 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
SPIBQ01892 COPS7B-207ENST00000410024 1103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
SPIBQ01892 DBH-AS1-201ENST00000425189 2139 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
SPIBQ01892 ODF3B-205ENST00000428989 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
SPIBQ01892 OTUB2-202ENST00000553723 708 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
SPIBQ01892 AC133550.1-201ENST00000563565 295 ntTSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
SPIBQ01892 PRSS8-206ENST00000568261 1214 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
SPIBQ01892 PAM16-215ENST00000577031 548 ntTSL 4 BASIC14.7□□□□□ -0.06
SPIBQ01892 MIR4313-201ENST00000580760 101 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
SPIBQ01892 IGFLR1-205ENST00000588992 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
SPIBQ01892 AC036176.1-201ENST00000589905 785 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
SPIBQ01892 ZSCAN1-203ENST00000601162 813 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
SPIBQ01892 GPX4-212ENST00000616066 924 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
SPIBQ01892 NEK5-204ENST00000617045 2127 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
SPIBQ01892 TSPY4-205ENST00000640033 663 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
SPIBQ01892 REXO1L1P-202ENST00000608646 1974 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
SPIBQ01892 THOC5-203ENST00000397872 2676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
SPIBQ01892 ZBTB7C-213ENST00000588982 4949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
SPIBQ01892 SLC2A11-203ENST00000345044 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
SPIBQ01892 ZNF516-201ENST00000443185 8118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
SPIBQ01892 OSR2-209ENST00000522510 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
SPIBQ01892 AKAP9-205ENST00000394564 1356 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
SPIBQ01892 ABTB2-201ENST00000435224 4902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
SPIBQ01892 AC148477.4-201ENST00000613430 1793 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
SPIBQ01892 MAPK7-202ENST00000308406 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
SPIBQ01892 SRSF8-201ENST00000587424 4028 ntAPPRIS P1 BASIC14.7□□□□□ -0.06
SPIBQ01892 REEP4-202ENST00000334530 1476 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
SPIBQ01892 AKNA-206ENST00000374088 5464 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
SPIBQ01892 HDAC8-209ENST00000373589 1740 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
SPIBQ01892 BCAR1-209ENST00000546196 1340 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
SPIBQ01892 TEKT4P2-201ENST00000416067 1599 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
SPIBQ01892 MYADML2-201ENST00000409745 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
SPIBQ01892 FAM210A-202ENST00000402563 4240 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
SPIBQ01892 GOLGA8DP-202ENST00000341390 2184 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
SPIBQ01892 PTH2-201ENST00000270631 459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
SPIBQ01892 ASTL-201ENST00000342380 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
SPIBQ01892 AC092384.3-201ENST00000561980 531 ntTSL 4 BASIC14.69□□□□□ -0.06
SPIBQ01892 YPEL3-209ENST00000566595 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.5 ms