Protein–RNA interactions for Protein: P78414

IRX1, Iroquois-class homeodomain protein IRX-1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 480 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IRX1P78414 STRA6-202ENST00000395105 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
IRX1P78414 LMBRD1-202ENST00000370577 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
IRX1P78414 FANCA-203ENST00000389302 1641 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
IRX1P78414 MFSD11-217ENST00000590514 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
IRX1P78414 INSL3-201ENST00000317306 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
IRX1P78414 TPM1-203ENST00000317516 738 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
IRX1P78414 DNAH14-205ENST00000366850 1103 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
IRX1P78414 MRPL43-208ENST00000370242 884 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
IRX1P78414 RNU1-129P-201ENST00000384064 167 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
IRX1P78414 UPK3A-202ENST00000396082 627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
IRX1P78414 DHRS4-203ENST00000397075 727 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
IRX1P78414 RAB17-203ENST00000409576 466 ntTSL 3 BASIC15.66■□□□□ 0.1
IRX1P78414 LSM5-204ENST00000409909 740 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
IRX1P78414 ACP6-203ENST00000487562 1258 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
IRX1P78414 AC136632.2-201ENST00000512891 861 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
IRX1P78414 TPM1-218ENST00000559281 851 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
IRX1P78414 IRF8-202ENST00000562492 946 ntTSL 3 BASIC15.66■□□□□ 0.1
IRX1P78414 U1.21-201ENST00000580816 167 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
IRX1P78414 ZSCAN1-203ENST00000601162 813 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
IRX1P78414 AC025062.2-201ENST00000605477 670 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
IRX1P78414 AL022328.2-201ENST00000608016 640 ntTSL 3 BASIC15.66■□□□□ 0.1
IRX1P78414 TUB-AS1-201ENST00000506601 2021 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
IRX1P78414 THSD4-202ENST00000355327 9200 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
IRX1P78414 EHMT2-201ENST00000375528 4047 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
IRX1P78414 C21orf33-201ENST00000291577 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
IRX1P78414 TVP23C-203ENST00000428082 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
IRX1P78414 SEPT9-220ENST00000588690 2919 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
IRX1P78414 E2F6-212ENST00000546212 3191 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
IRX1P78414 THOC5-202ENST00000397871 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
IRX1P78414 LINC00324-201ENST00000315707 2082 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
IRX1P78414 TMEM216-201ENST00000334888 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
IRX1P78414 COLGALT1-201ENST00000252599 3704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
IRX1P78414 PARD3B-204ENST00000406610 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
IRX1P78414 NBEA-203ENST00000379939 10738 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
IRX1P78414 CACTIN-203ENST00000429344 3612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
IRX1P78414 KCP-208ENST00000620378 4515 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
IRX1P78414 AP001282.1-201ENST00000531301 1499 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
IRX1P78414 RGS12-202ENST00000338806 3010 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
IRX1P78414 RASA4-201ENST00000262940 5605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
IRX1P78414 SLC6A6P1-201ENST00000413933 1850 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
IRX1P78414 ADD3-202ENST00000356080 3081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
IRX1P78414 THBS4-201ENST00000350881 3222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
IRX1P78414 TINF2-202ENST00000399423 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
IRX1P78414 BHMT2-205ENST00000521567 1537 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
IRX1P78414 TNFSF8-203ENST00000618336 1523 ntTSL 3 BASIC15.65■□□□□ 0.1
IRX1P78414 SUN2-203ENST00000406622 2725 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
IRX1P78414 SEC16A-202ENST00000290037 8982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
IRX1P78414 HDDC3-201ENST00000330334 1047 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
IRX1P78414 AP2S1-202ENST00000352203 793 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
IRX1P78414 AGTRAP-205ENST00000400895 786 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
IRX1P78414 STK32A-AS1-201ENST00000504297 863 ntTSL 3 BASIC15.65■□□□□ 0.1
IRX1P78414 IGHV3-65-201ENST00000523210 341 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
IRX1P78414 BATF2-204ENST00000527716 1230 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
IRX1P78414 REXO2-206ENST00000539275 710 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
IRX1P78414 AC116612.1-201ENST00000557144 562 ntTSL 3 BASIC15.65■□□□□ 0.1
IRX1P78414 RNPS1-224ENST00000569598 918 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
IRX1P78414 AP2S1-204ENST00000597020 707 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
IRX1P78414 AL645728.2-201ENST00000641974 660 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
IRX1P78414 ASAH1-249ENST00000637528 2215 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
IRX1P78414 ARFIP2-203ENST00000423813 1430 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
IRX1P78414 CARMIL3-201ENST00000342740 4597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
IRX1P78414 GNRHR2-201ENST00000312753 1599 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
IRX1P78414 TNN-201ENST00000239462 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
IRX1P78414 RABIF-201ENST00000367262 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
IRX1P78414 SYCP2L-201ENST00000283141 3130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
IRX1P78414 SFRP2-201ENST00000274063 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
IRX1P78414 ZNF786-202ENST00000491431 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
IRX1P78414 DNAJC2-203ENST00000379263 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
IRX1P78414 SPSB2-203ENST00000519357 1496 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
IRX1P78414 OGFOD2-224ENST00000545612 1465 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
IRX1P78414 ZNF514-201ENST00000295208 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
IRX1P78414 IFT52-201ENST00000373030 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.1
IRX1P78414 NDFIP2-201ENST00000218652 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
IRX1P78414 RBM6-201ENST00000266022 3750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
IRX1P78414 SNED1-202ENST00000342631 1930 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
IRX1P78414 ARFGAP2-202ENST00000426335 2937 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
IRX1P78414 ALG12-201ENST00000330817 5350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
IRX1P78414 CCDC144A-202ENST00000340621 2214 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
IRX1P78414 SYT15-201ENST00000374321 1369 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
IRX1P78414 UBAC2-203ENST00000403766 1375 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
IRX1P78414 LCA10-201ENST00000618311 1392 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
IRX1P78414 AC097376.2-205ENST00000610159 5334 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
IRX1P78414 WDR77-201ENST00000235090 2576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
IRX1P78414 HLF-201ENST00000226067 5547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
IRX1P78414 MCC-202ENST00000408903 3476 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
IRX1P78414 PHF8-203ENST00000338946 4651 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
IRX1P78414 CNDP2-201ENST00000324262 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
IRX1P78414 AC004870.1-201ENST00000315132 882 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
IRX1P78414 CD99-205ENST00000381192 1245 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
IRX1P78414 ADARB2-201ENST00000381305 703 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
IRX1P78414 RNF34-202ENST00000392464 1722 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
IRX1P78414 AC073621.1-201ENST00000392730 636 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
IRX1P78414 C8orf31-201ENST00000395172 1875 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
IRX1P78414 BICDL1-201ENST00000397558 3055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
IRX1P78414 NOP14-203ENST00000416614 3538 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
IRX1P78414 ATP6V0CP3-201ENST00000417255 467 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
IRX1P78414 CES1P1-201ENST00000421606 1704 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
IRX1P78414 AC093724.1-201ENST00000448659 1027 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
IRX1P78414 TSTD3-201ENST00000452647 962 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
IRX1P78414 MMP24-AS1-209ENST00000456790 712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
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