Protein–RNA interactions for Protein: P68871

HBB, Hemoglobin subunit beta, humanhuman

Predictions only

Length 147 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HBBP68871 ALOX15-201ENST00000293761 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
HBBP68871 SLC6A8-204ENST00000430077 1892 ntTSL 2 BASIC11.83□□□□□ -0.52
HBBP68871 STK33-217ENST00000534493 1895 ntTSL 2 BASIC11.83□□□□□ -0.52
HBBP68871 TRIO-202ENST00000344204 11100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
HBBP68871 IDH3G-201ENST00000217901 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
HBBP68871 AFF2-204ENST00000370458 1488 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
HBBP68871 MFSD11-211ENST00000588460 3612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.83□□□□□ -0.52
HBBP68871 FCHO1-206ENST00000594202 3214 ntTSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
HBBP68871 SLC4A7-213ENST00000454389 4159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
HBBP68871 ALAS2-201ENST00000330807 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
HBBP68871 FAM218A-201ENST00000513876 2175 ntAPPRIS P1 BASIC11.82□□□□□ -0.52
HBBP68871 RPL15-201ENST00000307839 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
HBBP68871 PORCN-201ENST00000326194 1755 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
HBBP68871 TRIML1-201ENST00000332517 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
HBBP68871 CAB39-201ENST00000258418 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
HBBP68871 SMARCA2-204ENST00000357248 5855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
HBBP68871 ABHD2-207ENST00000565973 2347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
HBBP68871 ZNF785-202ENST00000470110 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.82□□□□□ -0.52
HBBP68871 BSCL2-201ENST00000278893 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.82□□□□□ -0.52
HBBP68871 PRMT2-207ENST00000440086 1932 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
HBBP68871 LONP1-202ENST00000540670 3002 ntTSL 2 BASIC11.82□□□□□ -0.52
HBBP68871 FAM237A-203ENST00000543490 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
HBBP68871 PHF14-201ENST00000403050 4276 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
HBBP68871 DNAJC22-201ENST00000395069 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
HBBP68871 TBC1D3G-201ENST00000569055 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
HBBP68871 TBC1D3H-201ENST00000610350 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
HBBP68871 TBC1D3L-202ENST00000617678 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
HBBP68871 ABCB7-202ENST00000339447 2234 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
HBBP68871 BRAT1-201ENST00000340611 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
HBBP68871 NDRG4-217ENST00000562999 2931 ntTSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
HBBP68871 C11orf16-202ENST00000525780 1685 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
HBBP68871 OASL-204ENST00000620239 1695 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
HBBP68871 SIGLEC5-201ENST00000534261 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
HBBP68871 FGF8-201ENST00000320185 799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
HBBP68871 ADARB2-201ENST00000381305 703 ntTSL 2 BASIC11.82□□□□□ -0.52
HBBP68871 BX276092.7-202ENST00000422194 696 ntTSL 3 BASIC11.82□□□□□ -0.52
HBBP68871 BX664615.1-201ENST00000443558 458 ntBASIC11.82□□□□□ -0.52
HBBP68871 ICAM2-203ENST00000449662 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
HBBP68871 AC091607.1-201ENST00000490318 1060 ntBASIC11.82□□□□□ -0.52
HBBP68871 LY6E-213ENST00000522528 606 ntTSL 3 BASIC11.82□□□□□ -0.52
HBBP68871 IGLL5-201ENST00000526893 1050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
HBBP68871 GRP-204ENST00000529320 824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
HBBP68871 IGLL5-202ENST00000531372 882 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
HBBP68871 DUSP6-204ENST00000547291 1074 ntTSL 2 BASIC11.82□□□□□ -0.52
HBBP68871 L2HGDH-205ENST00000555423 841 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
HBBP68871 L2HGDH-206ENST00000555610 804 ntTSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
HBBP68871 FAM98C-205ENST00000588262 826 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
HBBP68871 WT1-AS_2.1-201ENST00000613208 137 ntBASIC11.82□□□□□ -0.52
HBBP68871 MED16-213ENST00000616387 1078 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
HBBP68871 Metazoa_SRP.104-201ENST00000622099 280 ntBASIC11.82□□□□□ -0.52
HBBP68871 TRMT1-203ENST00000437766 2263 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
HBBP68871 IMPDH1-201ENST00000338791 2881 ntTSL 2 BASIC11.82□□□□□ -0.52
HBBP68871 IMPDH1-217ENST00000626419 2862 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
HBBP68871 DMBT1P1-203ENST00000636837 4628 ntBASIC11.82□□□□□ -0.52
HBBP68871 MED4-201ENST00000258648 2022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
HBBP68871 CHRNA7-217ENST00000636603 2012 ntTSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
HBBP68871 CRACR2A-201ENST00000252322 2186 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
HBBP68871 CUEDC1-206ENST00000577830 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
HBBP68871 MBD1-211ENST00000585595 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.82□□□□□ -0.52
HBBP68871 GPD2-208ENST00000438166 2457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
HBBP68871 CILP2-202ENST00000586018 4234 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC11.82□□□□□ -0.52
HBBP68871 RUBCNL-204ENST00000378797 3206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
HBBP68871 STAB1-201ENST00000321725 7928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
HBBP68871 SLC35C2-213ENST00000543605 5740 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
HBBP68871 NTMT1-203ENST00000372483 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
HBBP68871 TKT-201ENST00000296289 1931 ntTSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
HBBP68871 HSPA7-201ENST00000445535 1927 ntBASIC11.82□□□□□ -0.52
HBBP68871 TBC1D1-219ENST00000615497 2383 ntTSL 2 BASIC11.82□□□□□ -0.52
HBBP68871 LINC00476-204ENST00000429781 2825 ntTSL 2 BASIC11.82□□□□□ -0.52
HBBP68871 AL731571.1-201ENST00000617058 5428 ntBASIC11.81□□□□□ -0.52
HBBP68871 MCM9-202ENST00000316316 5101 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.81□□□□□ -0.52
HBBP68871 NPR1-202ENST00000368680 4236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
HBBP68871 BCKDHA-201ENST00000269980 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
HBBP68871 AL031595.1-201ENST00000623969 4709 ntBASIC11.81□□□□□ -0.52
HBBP68871 ARID3B-201ENST00000346246 4271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
HBBP68871 PTPRN2-204ENST00000404321 1374 ntTSL 5 BASIC11.81□□□□□ -0.52
HBBP68871 PDE3B-202ENST00000455098 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
HBBP68871 PIGG-202ENST00000383028 2787 ntTSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
HBBP68871 AC027601.5-201ENST00000624065 2482 ntBASIC11.81□□□□□ -0.52
HBBP68871 HTR3A-202ENST00000355556 2331 ntTSL 2 BASIC11.81□□□□□ -0.52
HBBP68871 MGME1-203ENST00000377710 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
HBBP68871 PTPN5-204ENST00000396170 3871 ntTSL 2 BASIC11.81□□□□□ -0.52
HBBP68871 HDAC2-206ENST00000519108 2000 ntTSL 2 BASIC11.81□□□□□ -0.52
HBBP68871 ZNF354B-201ENST00000322434 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
HBBP68871 ATRN-202ENST00000446916 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
HBBP68871 CYB561D1-201ENST00000310611 5009 ntTSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
HBBP68871 PDHX-203ENST00000448838 2653 ntTSL 5 BASIC11.81□□□□□ -0.52
HBBP68871 TRH-202ENST00000507066 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.81□□□□□ -0.52
HBBP68871 DNAJC16-201ENST00000375838 2357 ntTSL 5 BASIC11.81□□□□□ -0.52
HBBP68871 FBXO21-202ENST00000427718 4138 ntTSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
HBBP68871 NRCAM-217ENST00000613830 3025 ntTSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
HBBP68871 SUCO-201ENST00000263688 5556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
HBBP68871 GOSR2-201ENST00000225567 1245 ntTSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
HBBP68871 STX10-201ENST00000242770 1099 ntTSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
HBBP68871 POMZP3-201ENST00000275569 1259 ntTSL 2 BASIC11.81□□□□□ -0.52
HBBP68871 HAAO-201ENST00000294973 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
HBBP68871 DBI-201ENST00000311521 714 ntTSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
HBBP68871 CD7-201ENST00000312648 1281 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
HBBP68871 ITM2B-201ENST00000378549 805 ntTSL 5 BASIC11.81□□□□□ -0.52
HBBP68871 CLDN14-205ENST00000399139 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.2 ms