Protein–RNA interactions for Protein: P63121

HERVK_113, Endogenous retrovirus group K member 113 Pro protein, humanhuman

Predictions only

Length 156 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERVK_113P63121 POU5F1-204ENST00000471529 1723 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
HERVK_113P63121 TACR2-203ENST00000619173 1713 ntTSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
HERVK_113P63121 ADSL-220ENST00000636714 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
HERVK_113P63121 TRAF3-202ENST00000351691 2239 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
HERVK_113P63121 CNDP1-201ENST00000358821 2215 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
HERVK_113P63121 CICP23-201ENST00000605013 2741 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
HERVK_113P63121 PIGG-202ENST00000383028 2787 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
HERVK_113P63121 EEPD1-205ENST00000534978 2769 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.99□□□□□ -0.65
HERVK_113P63121 PEX5-206ENST00000434354 2253 ntTSL 2 BASIC10.99□□□□□ -0.65
HERVK_113P63121 LINC01271-201ENST00000441214 2250 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
HERVK_113P63121 IFT52-201ENST00000373030 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
HERVK_113P63121 CHIC2-201ENST00000263921 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
HERVK_113P63121 PPIB-201ENST00000300026 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
HERVK_113P63121 SELENOM-202ENST00000402395 1054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
HERVK_113P63121 PABPN1L-201ENST00000411789 873 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
HERVK_113P63121 RNASET2-206ENST00000476238 887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
HERVK_113P63121 AC021087.1-201ENST00000512642 522 ntTSL 2 BASIC10.99□□□□□ -0.65
HERVK_113P63121 NDUFB9-202ENST00000517367 636 ntTSL 3 BASIC10.99□□□□□ -0.65
HERVK_113P63121 BATF2-204ENST00000527716 1230 ntTSL 2 BASIC10.99□□□□□ -0.65
HERVK_113P63121 ZFPM1-204ENST00000563351 808 ntTSL 2 BASIC10.99□□□□□ -0.65
HERVK_113P63121 ZFPM1-205ENST00000569086 563 ntTSL 2 BASIC10.99□□□□□ -0.65
HERVK_113P63121 RN7SL850P-201ENST00000579959 291 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
HERVK_113P63121 MIR3180-1-201ENST00000580374 94 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
HERVK_113P63121 MIR4515-201ENST00000584082 81 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
HERVK_113P63121 MIR3180-3-201ENST00000584616 94 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
HERVK_113P63121 LINC01785-201ENST00000598042 1112 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
HERVK_113P63121 BCL10-202ENST00000620248 774 ntTSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
HERVK_113P63121 AL355877.3-201ENST00000622820 899 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
HERVK_113P63121 NRAS-201ENST00000369535 4449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
HERVK_113P63121 CT62-201ENST00000449977 1825 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
HERVK_113P63121 ING1-203ENST00000375774 2870 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
HERVK_113P63121 ZNF785-202ENST00000470110 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.99□□□□□ -0.65
HERVK_113P63121 DBF4-201ENST00000265728 3907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
HERVK_113P63121 KIF25-201ENST00000351261 1326 ntTSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
HERVK_113P63121 DOK3-203ENST00000377112 1884 ntTSL 2 BASIC10.99□□□□□ -0.65
HERVK_113P63121 NDFIP2-205ENST00000612570 4648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
HERVK_113P63121 FAM219A-206ENST00000379087 3573 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC10.99□□□□□ -0.65
HERVK_113P63121 ITGA6-202ENST00000409080 5306 ntTSL 2 BASIC10.99□□□□□ -0.65
HERVK_113P63121 APP-208ENST00000439274 2517 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
HERVK_113P63121 ILF3-AS1-201ENST00000591501 1983 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
HERVK_113P63121 APBB1-207ENST00000529519 1442 ntTSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
HERVK_113P63121 EMC10-201ENST00000334976 9446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
HERVK_113P63121 DMTN-203ENST00000381470 2601 ntTSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
HERVK_113P63121 RAB2A-201ENST00000262646 3848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
HERVK_113P63121 CYP51A1P2-201ENST00000419457 1499 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
HERVK_113P63121 ZNF541-203ENST00000391901 4580 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
HERVK_113P63121 BHMT2-205ENST00000521567 1537 ntTSL 2 BASIC10.99□□□□□ -0.65
HERVK_113P63121 MIF4GD-204ENST00000577542 1531 ntTSL 3 BASIC10.99□□□□□ -0.65
HERVK_113P63121 SLC26A11-203ENST00000546047 2807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
HERVK_113P63121 TBRG4-201ENST00000258770 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
HERVK_113P63121 ILDR1-202ENST00000344209 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
HERVK_113P63121 HCK-209ENST00000538448 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.99□□□□□ -0.65
HERVK_113P63121 TGM6-201ENST00000202625 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
HERVK_113P63121 SIRT6-202ENST00000337491 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
HERVK_113P63121 COLQ-206ENST00000603808 1668 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
HERVK_113P63121 GRK6P1-201ENST00000400595 1711 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
HERVK_113P63121 C1QTNF2-201ENST00000393975 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
HERVK_113P63121 DCHS1-201ENST00000299441 10765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
HERVK_113P63121 PPRC1-203ENST00000413464 4580 ntTSL 2 BASIC10.98□□□□□ -0.65
HERVK_113P63121 TMPRSS6-204ENST00000406856 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
HERVK_113P63121 RNF167-211ENST00000575111 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
HERVK_113P63121 VTI1B-204ENST00000554659 5351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
HERVK_113P63121 PPHLN1-201ENST00000256678 1820 ntTSL 2 BASIC10.98□□□□□ -0.65
HERVK_113P63121 PUS1-202ENST00000376649 4094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
HERVK_113P63121 AC092127.1-201ENST00000567093 3455 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
HERVK_113P63121 VAT1-201ENST00000355653 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
HERVK_113P63121 FBXO45-202ENST00000440469 3689 ntTSL 2 BASIC10.98□□□□□ -0.65
HERVK_113P63121 CDC42EP4-202ENST00000439510 2879 ntTSL 2 BASIC10.98□□□□□ -0.65
HERVK_113P63121 AC005885.1-204ENST00000637885 2885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
HERVK_113P63121 PLXNB2-201ENST00000359337 6335 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
HERVK_113P63121 VKORC1-201ENST00000300851 876 ntTSL 2 BASIC10.98□□□□□ -0.65
HERVK_113P63121 TM4SF4-201ENST00000305354 2101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
HERVK_113P63121 NAALADL1-203ENST00000356632 2118 ntTSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
HERVK_113P63121 GNB1L-203ENST00000405009 1076 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
HERVK_113P63121 AKR7L-201ENST00000420396 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
HERVK_113P63121 TMPOP1-202ENST00000424642 1267 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
HERVK_113P63121 AC093151.3-201ENST00000425554 623 ntTSL 2 BASIC10.98□□□□□ -0.65
HERVK_113P63121 AP000347.1-209ENST00000437294 557 ntTSL 4 BASIC10.98□□□□□ -0.65
HERVK_113P63121 CBR1-203ENST00000439427 1024 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
HERVK_113P63121 YKT6-207ENST00000496112 1270 ntTSL 2 BASIC10.98□□□□□ -0.65
HERVK_113P63121 PKD2-202ENST00000502363 1222 ntTSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
HERVK_113P63121 QPRT-203ENST00000562473 579 ntTSL 3 BASIC10.98□□□□□ -0.65
HERVK_113P63121 AL162497.1-201ENST00000615635 518 ntTSL 4 BASIC10.98□□□□□ -0.65
HERVK_113P63121 AC008567.3-202ENST00000619671 859 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
HERVK_113P63121 SPACA6-213ENST00000637797 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
HERVK_113P63121 STIP1-201ENST00000305218 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
HERVK_113P63121 TINF2-202ENST00000399423 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
HERVK_113P63121 CYP21A2-221ENST00000418967 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
HERVK_113P63121 PNPLA3-203ENST00000423180 2222 ntTSL 2 BASIC10.98□□□□□ -0.65
HERVK_113P63121 HYAL1-209ENST00000618175 2225 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
HERVK_113P63121 MEGF8-201ENST00000251268 9549 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
HERVK_113P63121 APLP1-202ENST00000537454 2266 ntTSL 2 BASIC10.98□□□□□ -0.65
HERVK_113P63121 HTD2-206ENST00000481972 1378 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.98□□□□□ -0.65
HERVK_113P63121 CCDC22-201ENST00000376227 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
HERVK_113P63121 ACSM2B-207ENST00000565232 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.98□□□□□ -0.65
HERVK_113P63121 RALGAPA1-201ENST00000307138 7911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
HERVK_113P63121 IRF3-202ENST00000377135 1442 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
HERVK_113P63121 GDPGP1-202ENST00000558017 5323 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.98□□□□□ -0.65
HERVK_113P63121 PKD1L2-209ENST00000531391 1488 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
HERVK_113P63121 PRPF8-205ENST00000572621 7445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.3 ms