Protein–RNA interactions for Protein: P56704

WNT3A, Protein Wnt-3a, humanhuman

Predictions only

Length 352 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
WNT3AP56704 MAPKAPK5-203ENST00000547305 494 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
WNT3AP56704 AC106028.4-201ENST00000614509 607 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
WNT3AP56704 GDF5-201ENST00000374369 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
WNT3AP56704 AP002360.1-202ENST00000530460 2462 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
WNT3AP56704 MCF2L-232ENST00000535094 3752 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
WNT3AP56704 ZP3-201ENST00000336517 1483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
WNT3AP56704 FBXO22-202ENST00000453211 1486 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
WNT3AP56704 TSPY26P-202ENST00000565928 3884 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
WNT3AP56704 CRAMP1-201ENST00000293925 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
WNT3AP56704 NPRL3-201ENST00000399953 2784 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
WNT3AP56704 GFY-202ENST00000610896 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
WNT3AP56704 MTX3-201ENST00000509852 1655 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
WNT3AP56704 LRFN2-201ENST00000338305 3270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
WNT3AP56704 SLC18A1-207ENST00000519026 1980 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
WNT3AP56704 RASA4B-202ENST00000465829 2931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
WNT3AP56704 COL17A1-202ENST00000369733 5488 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
WNT3AP56704 STAU2-219ENST00000522509 2173 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
WNT3AP56704 AC087499.5-201ENST00000452760 1342 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
WNT3AP56704 CDC42-203ENST00000400259 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
WNT3AP56704 APBA2-205ENST00000558330 3349 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
WNT3AP56704 AC091100.1-201ENST00000558424 2354 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
WNT3AP56704 AC100757.3-201ENST00000622361 1406 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
WNT3AP56704 HLF-201ENST00000226067 5547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
WNT3AP56704 HDAC8-209ENST00000373589 1740 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
WNT3AP56704 MARK3-204ENST00000416682 2969 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
WNT3AP56704 HPCAL1-202ENST00000381765 1904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
WNT3AP56704 NR1H3-235ENST00000616973 1919 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
WNT3AP56704 TSG101-204ENST00000536719 2101 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
WNT3AP56704 MYB-201ENST00000316528 3571 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
WNT3AP56704 MYB-241ENST00000616088 3573 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
WNT3AP56704 AC068580.4-201ENST00000636615 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
WNT3AP56704 NKIRAS1-201ENST00000388759 2335 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
WNT3AP56704 HSD17B10-203ENST00000375304 916 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
WNT3AP56704 EEF1B2-202ENST00000392221 880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
WNT3AP56704 HNRNPA3P1-201ENST00000401429 1139 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
WNT3AP56704 AC018685.2-201ENST00000414065 547 ntTSL 4 BASIC15.94■□□□□ 0.14
WNT3AP56704 RAD18-204ENST00000418463 563 ntTSL 4 BASIC15.94■□□□□ 0.14
WNT3AP56704 RAD18-205ENST00000421052 582 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
WNT3AP56704 AC092809.2-202ENST00000436706 790 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
WNT3AP56704 PIGZ-204ENST00000443835 675 ntTSL 4 BASIC15.94■□□□□ 0.14
WNT3AP56704 NAGK-205ENST00000443938 1221 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
WNT3AP56704 HNRNPA3P5-201ENST00000455201 833 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
WNT3AP56704 ZIC4-214ENST00000491672 925 ntTSL 4 BASIC15.94■□□□□ 0.14
WNT3AP56704 IGHV3-42-201ENST00000520410 361 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
WNT3AP56704 AC137894.1-201ENST00000526431 547 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
WNT3AP56704 SLC1A4-205ENST00000531327 1217 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
WNT3AP56704 AL844908.2-201ENST00000609461 460 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
WNT3AP56704 SELENOH-206ENST00000622257 1291 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
WNT3AP56704 AL590560.3-201ENST00000623350 461 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
WNT3AP56704 RAB34-223ENST00000636154 730 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
WNT3AP56704 WDR61-201ENST00000267973 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
WNT3AP56704 DUSP26-203ENST00000523956 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
WNT3AP56704 CPA1-201ENST00000011292 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
WNT3AP56704 SRGAP2C-201ENST00000304465 1477 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
WNT3AP56704 CCDC28A-201ENST00000332797 1496 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
WNT3AP56704 SRGAP2-201ENST00000419187 1477 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
WNT3AP56704 SRGAP2B-205ENST00000619678 1477 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
WNT3AP56704 SHTN1-201ENST00000260777 5308 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
WNT3AP56704 FOXRED1-201ENST00000263578 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
WNT3AP56704 THEMIS2-202ENST00000373921 2687 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
WNT3AP56704 NRBP1-201ENST00000233557 2887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
WNT3AP56704 TMED7-TICAM2-202ENST00000333314 3453 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
WNT3AP56704 GFRA2-208ENST00000524240 4921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
WNT3AP56704 HSPA4L-204ENST00000508776 3020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
WNT3AP56704 KLHDC8A-201ENST00000367155 2928 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
WNT3AP56704 GPER1-202ENST00000397088 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
WNT3AP56704 ZNF620-202ENST00000418905 2022 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
WNT3AP56704 PNLDC1-202ENST00000392167 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
WNT3AP56704 MON1B-203ENST00000545553 1814 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
WNT3AP56704 TRIM46-209ENST00000543729 1703 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
WNT3AP56704 CFLAR-205ENST00000342795 1613 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
WNT3AP56704 BDKRB2-201ENST00000539359 1600 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
WNT3AP56704 DXO-203ENST00000375356 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
WNT3AP56704 PTGES3-202ENST00000414274 1547 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
WNT3AP56704 ZNF397-201ENST00000261333 1419 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
WNT3AP56704 SIX5-204ENST00000622857 1401 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
WNT3AP56704 TMED1-201ENST00000214869 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
WNT3AP56704 ORAOV1-201ENST00000279147 2478 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
WNT3AP56704 ACOX3-202ENST00000413009 2374 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
WNT3AP56704 CHRNG-202ENST00000389494 2262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
WNT3AP56704 WIZ-206ENST00000599686 3644 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
WNT3AP56704 ANKRD20A5P-207ENST00000581935 2089 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
WNT3AP56704 DUSP6-202ENST00000308385 1959 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
WNT3AP56704 LZTR1-201ENST00000215739 4572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
WNT3AP56704 BSG-204ENST00000545507 1795 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
WNT3AP56704 TNN-201ENST00000239462 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
WNT3AP56704 ACOT9-201ENST00000336430 1675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
WNT3AP56704 CLIC6-202ENST00000360731 3860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
WNT3AP56704 CDH7-203ENST00000536984 3766 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
WNT3AP56704 TMEM132D-AS2-201ENST00000542578 1568 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
WNT3AP56704 IRF9-203ENST00000557894 1391 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
WNT3AP56704 AL355493.2-201ENST00000568270 1395 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
WNT3AP56704 USE1-201ENST00000263897 843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
WNT3AP56704 PNMT-202ENST00000394246 821 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
WNT3AP56704 SELENOM-202ENST00000402395 1054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
WNT3AP56704 AC093702.1-201ENST00000423433 367 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
WNT3AP56704 ARHGAP11B-201ENST00000428041 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
WNT3AP56704 PAX5-207ENST00000446742 885 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
WNT3AP56704 AL359815.1-201ENST00000457706 821 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
WNT3AP56704 UBA5-213ENST00000494238 2997 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
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