Protein–RNA interactions for Protein: P56597

NME5, Nucleoside diphosphate kinase homolog 5, humanhuman

Predictions only

Length 212 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NME5P56597 APOLD1-201ENST00000326765 4724 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NME5P56597 PIP5K1C-202ENST00000537021 3326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NME5P56597 AC114490.1-201ENST00000417456 3163 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
NME5P56597 ORMDL3-204ENST00000579695 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NME5P56597 SNX30-201ENST00000374232 7622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
NME5P56597 PTGES3L-AARSD1-201ENST00000360221 1790 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
NME5P56597 SLC35A2-204ENST00000376521 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NME5P56597 TOM1-209ENST00000447733 2317 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
NME5P56597 PACSIN2-201ENST00000263246 3249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NME5P56597 AFF3-203ENST00000409579 4342 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
NME5P56597 NDUFB2-AS1-201ENST00000465466 1648 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
NME5P56597 FYN-202ENST00000354650 3628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NME5P56597 ASTL-201ENST00000342380 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NME5P56597 PDLIM4-202ENST00000379018 1006 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NME5P56597 TMEM210-201ENST00000413619 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
NME5P56597 TRPC2-202ENST00000526541 1189 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NME5P56597 FKBP5-203ENST00000539068 3827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NME5P56597 AC092384.3-201ENST00000561980 531 ntTSL 4 BASIC15.37■□□□□ 0.05
NME5P56597 IRF1-211ENST00000613424 821 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NME5P56597 MED16-214ENST00000617672 554 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
NME5P56597 HMGN3-203ENST00000620514 1010 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
NME5P56597 ACSM2A-203ENST00000417235 1835 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
NME5P56597 NFE2-203ENST00000540264 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NME5P56597 MAD1L1-203ENST00000402746 2355 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
NME5P56597 CREB3L2-204ENST00000456390 2360 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
NME5P56597 FAM210A-202ENST00000402563 4240 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
NME5P56597 ME2-201ENST00000321341 9415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NME5P56597 FAM46C-201ENST00000369448 5751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NME5P56597 KNSTRN-202ENST00000416151 1899 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
NME5P56597 DENND5B-202ENST00000389082 9470 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
NME5P56597 FCHO1-206ENST00000594202 3214 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
NME5P56597 PTHLH-209ENST00000545234 1544 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
NME5P56597 UBE2G1-204ENST00000572484 1514 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
NME5P56597 NOP14-201ENST00000314262 2889 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NME5P56597 C3orf62-201ENST00000343010 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NME5P56597 TLL1-201ENST00000061240 6708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NME5P56597 SGK2-206ENST00000423407 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NME5P56597 ADAMTSL1-207ENST00000380566 2321 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NME5P56597 SKOR1-201ENST00000341418 3332 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NME5P56597 MBD1-203ENST00000339998 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NME5P56597 TAF1C-216ENST00000566732 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
NME5P56597 RALGDS-201ENST00000372047 3598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NME5P56597 RXRA-202ENST00000481739 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NME5P56597 FAM8A1-201ENST00000259963 4677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NME5P56597 WASH6P-202ENST00000359512 1437 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
NME5P56597 WDR20-202ENST00000322340 3060 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NME5P56597 FAM219A-204ENST00000379081 3543 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
NME5P56597 GTF2IRD1-203ENST00000455841 3315 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NME5P56597 ITSN2-203ENST00000406921 4563 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NME5P56597 MRPS21-201ENST00000581066 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NME5P56597 CTSG-201ENST00000216336 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NME5P56597 GHSR-201ENST00000241256 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NME5P56597 LAMTOR5-201ENST00000256644 868 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NME5P56597 AC004870.1-201ENST00000315132 882 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
NME5P56597 MEOX1-202ENST00000329168 2129 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NME5P56597 KCNIP2-208ENST00000370046 923 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
NME5P56597 SYS1-202ENST00000372727 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
NME5P56597 PRR29-203ENST00000425164 1266 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
NME5P56597 ZNF337-AS1-204ENST00000428254 817 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
NME5P56597 LAMTOR5-204ENST00000483260 694 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
NME5P56597 FBXL21-206ENST00000495672 589 ntTSL 4 BASIC15.36■□□□□ 0.05
NME5P56597 AC093909.1-201ENST00000504731 1122 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
NME5P56597 MOK-203ENST00000517966 1230 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NME5P56597 MTUS1-215ENST00000519066 567 ntTSL 4 BASIC15.36■□□□□ 0.05
NME5P56597 IGHV3-22-201ENST00000520721 359 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
NME5P56597 MVB12A-211ENST00000529939 1091 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
NME5P56597 MRVI1-AS1-203ENST00000529979 784 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
NME5P56597 MAL2-202ENST00000531508 892 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
NME5P56597 AL133467.1-201ENST00000554161 993 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
NME5P56597 AL138918.1-201ENST00000568306 659 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
NME5P56597 FAM71E1-202ENST00000595790 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NME5P56597 LAMTOR5-206ENST00000602318 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NME5P56597 PGLYRP1-201ENST00000008938 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NME5P56597 KCP-203ENST00000610776 5108 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
NME5P56597 LIPE-AS1-205ENST00000594688 2383 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
NME5P56597 SLC35C1-201ENST00000314134 4171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NME5P56597 NR1H3-204ENST00000407404 1330 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
NME5P56597 TMEM41B-204ENST00000528080 3968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NME5P56597 MOCS1-201ENST00000340692 2747 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
NME5P56597 APLP1-202ENST00000537454 2266 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
NME5P56597 MECR-201ENST00000263702 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NME5P56597 GULP1-206ENST00000409830 1376 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NME5P56597 ALOX12B-201ENST00000319144 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NME5P56597 GPER1-201ENST00000297469 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NME5P56597 PODN-202ENST00000371500 3287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
NME5P56597 NAALADL1-203ENST00000356632 2118 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
NME5P56597 RER1-202ENST00000378512 1404 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
NME5P56597 CAVIN1-201ENST00000357037 3828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
NME5P56597 TSPAN14-210ENST00000616406 2436 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
NME5P56597 PDE3B-202ENST00000455098 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
NME5P56597 FHAD1-205ENST00000375997 1459 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
NME5P56597 ALOX12-AS1-201ENST00000399540 1730 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
NME5P56597 INO80-201ENST00000361937 6439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
NME5P56597 AC005089.1-201ENST00000619486 2241 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
NME5P56597 BRCC3-201ENST00000330045 2496 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
NME5P56597 TAF6-209ENST00000452041 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
NME5P56597 F10-202ENST00000375559 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
NME5P56597 CCDC12-201ENST00000292314 1017 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
NME5P56597 UBE2C-206ENST00000405520 641 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
NME5P56597 PRAP1-202ENST00000463201 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.2 ms