Protein–RNA interactions for Protein: P52655

GTF2A1, Transcription initiation factor IIA subunit 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 376 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF2A1P52655 PDXDC1-204ENST00000455313 2183 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
GTF2A1P52655 ZNF655-201ENST00000252713 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
GTF2A1P52655 ENO2-211ENST00000541477 2549 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
GTF2A1P52655 SLC32A1-201ENST00000217420 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
GTF2A1P52655 SLC25A26-202ENST00000354883 2673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
GTF2A1P52655 CNOT3-201ENST00000221232 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
GTF2A1P52655 YTHDF3-201ENST00000517371 3122 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
GTF2A1P52655 SERBP1-204ENST00000370995 3482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
GTF2A1P52655 NEK10-206ENST00000429845 4250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
GTF2A1P52655 TP73-211ENST00000604074 4806 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
GTF2A1P52655 NDC1-201ENST00000371429 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
GTF2A1P52655 KIAA0513-202ENST00000538274 7381 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
GTF2A1P52655 MROH2A-208ENST00000610772 5324 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
GTF2A1P52655 TBX3-202ENST00000349155 4723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
GTF2A1P52655 CENPO-202ENST00000380834 4386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
GTF2A1P52655 NISCH-212ENST00000488380 3168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
GTF2A1P52655 LHCGR-201ENST00000294954 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
GTF2A1P52655 MAPT-IT1-201ENST00000624111 3016 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
GTF2A1P52655 AGBL2-205ENST00000528244 2929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
GTF2A1P52655 ASPH-214ENST00000519234 2874 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
GTF2A1P52655 PAX6-202ENST00000379107 2579 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
GTF2A1P52655 RPUSD4-201ENST00000298317 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
GTF2A1P52655 PSEN2-211ENST00000626989 1972 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
GTF2A1P52655 NCBP2-204ENST00000427641 1946 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
GTF2A1P52655 ADAMTSL1-202ENST00000327883 1864 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
GTF2A1P52655 AC018755.2-201ENST00000599649 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
GTF2A1P52655 GAL3ST4-204ENST00000423751 1695 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
GTF2A1P52655 ERP29-203ENST00000546477 1698 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
GTF2A1P52655 AC131212.3-201ENST00000624087 4219 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
GTF2A1P52655 MME-217ENST00000616757 1315 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
GTF2A1P52655 CES3-201ENST00000303334 3834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
GTF2A1P52655 TSPY14P-201ENST00000303979 915 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
GTF2A1P52655 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
GTF2A1P52655 TSPY7P-201ENST00000431358 1114 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
GTF2A1P52655 TSPY1-202ENST00000451548 1160 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
GTF2A1P52655 TAPBP-236ENST00000456592 817 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
GTF2A1P52655 KRT8P12-201ENST00000468527 998 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
GTF2A1P52655 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
GTF2A1P52655 LINGO1-AS2-201ENST00000557799 663 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
GTF2A1P52655 AL354712.1-201ENST00000563570 477 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
GTF2A1P52655 TK1-204ENST00000590430 683 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
GTF2A1P52655 Z94160.2-201ENST00000609322 910 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
GTF2A1P52655 RPS27A-211ENST00000639844 606 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
GTF2A1P52655 PLOD2-202ENST00000360060 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
GTF2A1P52655 AC092127.1-201ENST00000567093 3455 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
GTF2A1P52655 ACTR3-201ENST00000263238 6718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
GTF2A1P52655 MAP7-202ENST00000432797 4375 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
GTF2A1P52655 C18orf15-201ENST00000623680 2534 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
GTF2A1P52655 PNRC2-201ENST00000334351 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
GTF2A1P52655 PARP3-203ENST00000431474 2360 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
GTF2A1P52655 KCNAB2-219ENST00000602612 2396 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
GTF2A1P52655 MIR193BHG-211ENST00000641433 5365 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
GTF2A1P52655 SC5D-202ENST00000392789 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
GTF2A1P52655 CREBL2-201ENST00000228865 3754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
GTF2A1P52655 CRYZL1-202ENST00000361534 2224 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
GTF2A1P52655 GABRA5-202ENST00000355395 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
GTF2A1P52655 DLGAP3-201ENST00000235180 3587 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
GTF2A1P52655 VAC14-AS1-201ENST00000398177 2145 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
GTF2A1P52655 CORO7-201ENST00000251166 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
GTF2A1P52655 AC068987.4-201ENST00000562343 2094 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
GTF2A1P52655 BAIAP3-201ENST00000324385 4678 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
GTF2A1P52655 SETD1B-203ENST00000604567 5969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
GTF2A1P52655 BLOC1S6-212ENST00000566753 1996 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
GTF2A1P52655 CPSF1-213ENST00000620219 4462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
GTF2A1P52655 TRIM25-201ENST00000316881 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
GTF2A1P52655 CACNA1G-233ENST00000515765 6981 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
GTF2A1P52655 TXNDC2-201ENST00000306084 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
GTF2A1P52655 CNGA4-201ENST00000379936 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
GTF2A1P52655 AC109583.3-201ENST00000641183 3128 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
GTF2A1P52655 KIAA1211L-201ENST00000397899 3907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
GTF2A1P52655 NR1H3-211ENST00000441012 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
GTF2A1P52655 CALD1-205ENST00000422748 2665 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
GTF2A1P52655 BX276092.9-201ENST00000636797 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
GTF2A1P52655 ZNF274-210ENST00000610905 2559 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
GTF2A1P52655 OTUD5-204ENST00000428668 1493 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
GTF2A1P52655 RET-205ENST00000615310 4337 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
GTF2A1P52655 CHRNB4-202ENST00000412074 1355 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
GTF2A1P52655 WDR26-201ENST00000414423 6872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
GTF2A1P52655 BCAS3-204ENST00000585744 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
GTF2A1P52655 KCTD10-208ENST00000540089 3096 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
GTF2A1P52655 HES2-202ENST00000377836 507 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
GTF2A1P52655 AC099669.1-201ENST00000457331 456 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
GTF2A1P52655 TNNT1-208ENST00000587465 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
GTF2A1P52655 PDCD5-207ENST00000590247 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
GTF2A1P52655 PRKACA-209ENST00000590853 1101 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
GTF2A1P52655 AC064834.1-201ENST00000606986 503 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
GTF2A1P52655 ANKRD54-211ENST00000609454 825 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
GTF2A1P52655 HJURP-207ENST00000441687 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
GTF2A1P52655 TKT-203ENST00000423525 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
GTF2A1P52655 VIPAS39-202ENST00000343765 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
GTF2A1P52655 RAPGEF3-218ENST00000548919 2776 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
GTF2A1P52655 VPS9D1-202ENST00000561976 2791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
GTF2A1P52655 TTC38-201ENST00000381031 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
GTF2A1P52655 SMYD5-202ENST00000389501 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
GTF2A1P52655 SNHG28-201ENST00000368102 2501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
GTF2A1P52655 YME1L1-202ENST00000375972 2517 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
GTF2A1P52655 ARAF-203ENST00000377045 2458 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
GTF2A1P52655 PML-205ENST00000395132 1738 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
GTF2A1P52655 STPG3-AS1-201ENST00000612170 1701 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
GTF2A1P52655 LINC00940-201ENST00000418006 2350 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.6 ms