Protein–RNA interactions for Protein: P50548

ERF, ETS domain-containing transcription factor ERF, humanhuman

Predictions only

Length 548 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERFP50548 PDLIM1-201ENST00000329399 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ERFP50548 IL3RA-202ENST00000381469 1476 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ERFP50548 DNAJC7-202ENST00000426588 1774 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ERFP50548 ALDH4A1-206ENST00000538839 2957 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ERFP50548 ARHGAP45-201ENST00000313093 4273 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ERFP50548 CUL1-201ENST00000325222 3064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ERFP50548 JPH1-201ENST00000342232 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ERFP50548 AL035460.1-201ENST00000380593 1866 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ERFP50548 U82695.1-201ENST00000635752 1889 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
ERFP50548 HAUS4P1-201ENST00000406739 1145 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
ERFP50548 NAT6-202ENST00000417393 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ERFP50548 CSRP1-214ENST00000531916 890 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ERFP50548 C19orf25-204ENST00000586564 1265 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ERFP50548 AP002414.4-201ENST00000589764 1148 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
ERFP50548 RPS15-207ENST00000591032 550 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ERFP50548 RPS15-212ENST00000593052 629 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ERFP50548 OPN5-206ENST00000638973 1090 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ERFP50548 HSP90B1-211ENST00000640977 1127 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ERFP50548 PRSS30P-201ENST00000390681 2881 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ERFP50548 EMB-204ENST00000508934 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ERFP50548 SHBG-201ENST00000340624 1311 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ERFP50548 LINC00960-201ENST00000463183 1333 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ERFP50548 TBCE-202ENST00000406207 2012 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ERFP50548 CHRNA7-217ENST00000636603 2012 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ERFP50548 OSGIN1-201ENST00000343939 2391 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ERFP50548 ABHD14B-204ENST00000461108 1397 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ERFP50548 KRT20-201ENST00000167588 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ERFP50548 OCLN-202ENST00000396442 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ERFP50548 TRIM46-202ENST00000368382 3127 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ERFP50548 GTF2I-212ENST00000573035 4548 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ERFP50548 AL121992.1-201ENST00000428945 2845 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ERFP50548 CYBA-210ENST00000569359 1415 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ERFP50548 ACOXL-201ENST00000340561 2188 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ERFP50548 SREBF1-205ENST00000395757 3696 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
ERFP50548 STEAP3-202ENST00000393107 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
ERFP50548 MN1-201ENST00000302326 7556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
ERFP50548 ZBTB7C-213ENST00000588982 4949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
ERFP50548 PIP4K2C-207ENST00000550465 1532 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
ERFP50548 TBC1D1-219ENST00000615497 2383 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
ERFP50548 UHRF1BP1L-201ENST00000279907 5168 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
ERFP50548 MXD1-206ENST00000540449 5580 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
ERFP50548 FAM109A-201ENST00000361483 3256 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
ERFP50548 KAT5-202ENST00000352980 2059 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
ERFP50548 TSPAN18-207ENST00000520358 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
ERFP50548 CGB7-203ENST00000597853 3386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
ERFP50548 GID4-201ENST00000268719 4237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
ERFP50548 TNK2-202ENST00000381916 4223 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
ERFP50548 FADS2-201ENST00000257261 2964 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
ERFP50548 GJC3-201ENST00000312891 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
ERFP50548 TMEM44-201ENST00000330115 1278 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
ERFP50548 YIF1B-203ENST00000339413 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
ERFP50548 TP53TG1-202ENST00000416560 710 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
ERFP50548 THAP5-204ENST00000438865 868 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
ERFP50548 AC106771.1-201ENST00000502209 372 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
ERFP50548 SFTPC-204ENST00000520605 519 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
ERFP50548 SFTPC-210ENST00000524255 681 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
ERFP50548 GSTO1-207ENST00000539281 1052 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
ERFP50548 BARHL1-202ENST00000542090 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
ERFP50548 AC087641.1-201ENST00000557561 1021 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
ERFP50548 AL161669.1-201ENST00000559843 386 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
ERFP50548 BLOC1S6-202ENST00000562384 494 ntTSL 4 BASIC15.33■□□□□ 0.04
ERFP50548 LINC01785-201ENST00000598042 1112 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
ERFP50548 AC069148.1-201ENST00000608741 768 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
ERFP50548 REXO2-220ENST00000611665 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
ERFP50548 CR381653.1-203ENST00000625153 577 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
ERFP50548 SPACA6-213ENST00000637797 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
ERFP50548 GALNT3-201ENST00000392701 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
ERFP50548 PI4KAP1-204ENST00000612579 1703 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
ERFP50548 RILPL1-202ENST00000376874 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
ERFP50548 PRKRA-203ENST00000432031 1344 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
ERFP50548 KRT18P1-202ENST00000452408 1331 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
ERFP50548 FAM120A-202ENST00000375389 3585 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
ERFP50548 NFE2-203ENST00000540264 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
ERFP50548 NOL4L-210ENST00000616976 1376 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
ERFP50548 LCA10-201ENST00000618311 1392 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
ERFP50548 HTR3A-202ENST00000355556 2331 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
ERFP50548 REC8-209ENST00000611366 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
ERFP50548 FGFR3-203ENST00000352904 3733 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
ERFP50548 LINC00476-204ENST00000429781 2825 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
ERFP50548 KHK-201ENST00000260598 2397 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
ERFP50548 LRRK1-201ENST00000388948 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
ERFP50548 APBB1-217ENST00000608645 1925 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
ERFP50548 TMPRSS3-204ENST00000433957 2403 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
ERFP50548 TBC1D16-209ENST00000576768 6342 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
ERFP50548 TNFSF13-201ENST00000338784 1971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
ERFP50548 CORO7-201ENST00000251166 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
ERFP50548 IKBKB-217ENST00000520810 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ERFP50548 KCNMA1-202ENST00000286628 6233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ERFP50548 GPAT4-201ENST00000396987 6298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ERFP50548 PHTF1-204ENST00000369604 3273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
ERFP50548 MYH7-201ENST00000355349 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ERFP50548 SLC35C2-204ENST00000372230 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ERFP50548 RELA-227ENST00000615805 2236 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
ERFP50548 HYAL1-209ENST00000618175 2225 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
ERFP50548 CORO7-222ENST00000574025 2826 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
ERFP50548 APLP1-202ENST00000537454 2266 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
ERFP50548 CYP4F11-202ENST00000326742 2877 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ERFP50548 AC010424.3-201ENST00000635510 1745 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
ERFP50548 IL17RD-208ENST00000640796 2345 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ERFP50548 AC097359.2-201ENST00000604992 2389 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.2 ms