Protein–RNA interactions for Protein: P49674

CSNK1E, Casein kinase I isoform epsilon, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 416 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSNK1EP49674 PTPRN2-205ENST00000409483 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CSNK1EP49674 TRMO-203ENST00000375119 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CSNK1EP49674 ACSF3-204ENST00000406948 2247 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CSNK1EP49674 KCNJ8-201ENST00000240662 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CSNK1EP49674 HPN-201ENST00000262626 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CSNK1EP49674 SPECC1-203ENST00000395525 2536 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CSNK1EP49674 AGTPBP1-201ENST00000337006 4473 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CSNK1EP49674 TJP1-201ENST00000346128 7950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CSNK1EP49674 LINC00094-205ENST00000603928 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CSNK1EP49674 YARS2-201ENST00000324868 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CSNK1EP49674 PCBP4-205ENST00000461554 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CSNK1EP49674 CLDND1-215ENST00000507874 1380 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CSNK1EP49674 RAB15-203ENST00000533601 3515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CSNK1EP49674 SLCO5A1-206ENST00000530307 2630 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CSNK1EP49674 POU4F2-201ENST00000281321 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CSNK1EP49674 RBPMS2-202ENST00000560606 1746 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CSNK1EP49674 KDM4B-203ENST00000536461 5027 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CSNK1EP49674 UBE3B-201ENST00000340074 1448 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CSNK1EP49674 MEPCE-201ENST00000310512 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CSNK1EP49674 NPPC-201ENST00000295440 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CSNK1EP49674 KLK1-201ENST00000301420 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CSNK1EP49674 MIR326-201ENST00000362220 95 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
CSNK1EP49674 RBM8A-201ENST00000369307 796 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CSNK1EP49674 DYNC1I1-203ENST00000413338 958 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CSNK1EP49674 TPI1-206ENST00000488464 791 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CSNK1EP49674 LYRM9-204ENST00000503642 432 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CSNK1EP49674 AP002748.3-205ENST00000525142 567 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CSNK1EP49674 AP002748.3-203ENST00000533502 581 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CSNK1EP49674 RAB40B-202ENST00000538809 704 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CSNK1EP49674 AC012568.1-201ENST00000558463 472 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CSNK1EP49674 AP003096.1-203ENST00000564469 563 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CSNK1EP49674 TNNT1-212ENST00000588981 1163 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CSNK1EP49674 PLA2G4C-AS1-201ENST00000596552 568 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CSNK1EP49674 AL118558.3-201ENST00000607414 1079 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
CSNK1EP49674 LINC02028-216ENST00000609015 732 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CSNK1EP49674 HTT-AS1_1.1-201ENST00000612914 230 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
CSNK1EP49674 LINC00623-205ENST00000621058 767 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CSNK1EP49674 TPRX1-201ENST00000322175 1924 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CSNK1EP49674 CCDC110-209ENST00000510617 2592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CSNK1EP49674 HEG1-201ENST00000311127 9156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CSNK1EP49674 MEIKIN-203ENST00000442687 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CSNK1EP49674 TMEM39B-201ENST00000336294 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CSNK1EP49674 ARL4C-202ENST00000390645 4013 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CSNK1EP49674 GUCA1A-203ENST00000394237 2233 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CSNK1EP49674 RGP1-201ENST00000378078 7018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CSNK1EP49674 TCAF2-203ENST00000425618 2448 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CSNK1EP49674 RUNX2-201ENST00000359524 5390 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CSNK1EP49674 DTX2-201ENST00000324432 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CSNK1EP49674 P2RY4-201ENST00000374519 1595 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CSNK1EP49674 PCDHA3-201ENST00000522353 5260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CSNK1EP49674 FCGBP-203ENST00000620799 4926 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CSNK1EP49674 PGR-209ENST00000617858 2816 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CSNK1EP49674 CHST8-201ENST00000262622 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CSNK1EP49674 RAB31-207ENST00000578921 4055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CSNK1EP49674 HNRNPR-204ENST00000427764 1788 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CSNK1EP49674 GOLM1-203ENST00000388712 3046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CSNK1EP49674 CHI3L2-212ENST00000524472 1435 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CSNK1EP49674 RSPO1-204ENST00000615459 2331 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CSNK1EP49674 SH3BP4-201ENST00000344528 5044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CSNK1EP49674 MAPT-205ENST00000351559 5811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CSNK1EP49674 PPP1R14B-202ENST00000392210 600 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CSNK1EP49674 AL133267.1-201ENST00000398220 340 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
CSNK1EP49674 EVA1A-203ENST00000410010 696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CSNK1EP49674 C1QTNF6-203ENST00000434784 975 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CSNK1EP49674 GOLGA2P4-201ENST00000441462 777 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
CSNK1EP49674 ZNF767P-206ENST00000513792 565 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
CSNK1EP49674 C2orf69P2-201ENST00000562032 1123 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
CSNK1EP49674 ANAPC11-216ENST00000579133 563 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CSNK1EP49674 AC015910.1-201ENST00000579400 975 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
CSNK1EP49674 AC005262.2-201ENST00000587701 452 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CSNK1EP49674 EBAG9-209ENST00000614147 1179 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CSNK1EP49674 UNC5C-203ENST00000506749 2220 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CSNK1EP49674 SLC9A5-201ENST00000299798 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CSNK1EP49674 ONECUT1-201ENST00000305901 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CSNK1EP49674 RHNO1-209ENST00000618250 2070 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CSNK1EP49674 KCNQ2-207ENST00000370224 3004 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CSNK1EP49674 RGR-201ENST00000358110 1349 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CSNK1EP49674 CALCB-202ENST00000523376 2258 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CSNK1EP49674 NELFA-216ENST00000542778 2465 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CSNK1EP49674 CLN5-208ENST00000636183 6664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CSNK1EP49674 EWSR1-206ENST00000397938 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CSNK1EP49674 MIB2-201ENST00000355826 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CSNK1EP49674 ACIN1-205ENST00000457657 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CSNK1EP49674 USP13-201ENST00000263966 8323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CSNK1EP49674 PAX6-276ENST00000640684 1557 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CSNK1EP49674 ACTN2-207ENST00000546208 5103 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CSNK1EP49674 MYLK3-202ENST00000536476 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CSNK1EP49674 EIF2B4-212ENST00000622434 1771 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CSNK1EP49674 MTMR14-203ENST00000353332 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CSNK1EP49674 ABHD10-201ENST00000273359 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CSNK1EP49674 SAMD11-202ENST00000342066 2551 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CSNK1EP49674 SAMD11-217ENST00000622503 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CSNK1EP49674 AC084018.2-201ENST00000613093 2607 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
CSNK1EP49674 TRPC6-202ENST00000348423 2448 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CSNK1EP49674 MAPKAPK5-207ENST00000551404 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CSNK1EP49674 PPAN-P2RY11-202ENST00000428358 2661 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CSNK1EP49674 SLC5A2-201ENST00000330498 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CSNK1EP49674 GPD2-201ENST00000310454 6041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CSNK1EP49674 LETM2-202ENST00000379957 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CSNK1EP49674 KDM5C-202ENST00000375379 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 67.8 ms