Protein–RNA interactions for Protein: P48681

NES, Nestin, humanhuman

Predictions only

Length 1,621 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NESP48681 CALCR-207ENST00000426151 1741 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
NESP48681 AGER-201ENST00000375055 1369 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
NESP48681 AC090502.4-201ENST00000551714 1386 ntBASIC26.38■■□□□ 1.81
NESP48681 CEP128-201ENST00000216517 1606 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
NESP48681 LINC00957-202ENST00000441052 2590 ntTSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
NESP48681 CGB1-201ENST00000301407 573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
NESP48681 PFN2-205ENST00000461868 613 ntTSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
NESP48681 PFN2-206ENST00000461930 606 ntTSL 4 BASIC26.38■■□□□ 1.81
NESP48681 RN7SL396P-201ENST00000471086 295 ntBASIC26.38■■□□□ 1.81
NESP48681 AC004066.1-201ENST00000502488 802 ntBASIC26.38■■□□□ 1.81
NESP48681 SDHAF2-206ENST00000542074 835 ntTSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
NESP48681 GLIS2-AS1-201ENST00000576080 340 ntTSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
NESP48681 AC008805.1-201ENST00000590892 364 ntBASIC26.38■■□□□ 1.81
NESP48681 AC005041.3-201ENST00000606287 649 ntBASIC26.38■■□□□ 1.81
NESP48681 AC002472.3-201ENST00000640124 621 ntBASIC26.38■■□□□ 1.81
NESP48681 Z98259.2-201ENST00000641583 609 ntBASIC26.38■■□□□ 1.81
NESP48681 ASH1L-207ENST00000548830 1862 ntTSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
NESP48681 EVA1A-202ENST00000393913 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
NESP48681 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
NESP48681 PES1-202ENST00000354694 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
NESP48681 ZNF584-209ENST00000599238 2288 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
NESP48681 ASS1-204ENST00000372394 1973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
NESP48681 LINC00921-202ENST00000573951 2468 ntTSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
NESP48681 C3orf18-201ENST00000357203 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
NESP48681 UNG-201ENST00000242576 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
NESP48681 PPM1G-201ENST00000344034 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
NESP48681 LAIR2-201ENST00000301202 699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
NESP48681 SCARNA21-201ENST00000517026 139 ntBASIC26.37■■□□□ 1.81
NESP48681 POU5F1P2-201ENST00000521750 823 ntBASIC26.37■■□□□ 1.81
NESP48681 AC107464.3-201ENST00000609172 737 ntBASIC26.37■■□□□ 1.81
NESP48681 TSC1-202ENST00000403810 1507 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
NESP48681 SLC39A13-201ENST00000354884 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
NESP48681 PCK2-205ENST00000558096 2433 ntTSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
NESP48681 CCDC140-201ENST00000295226 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
NESP48681 PNMA6E-202ENST00000633844 2596 ntTSL 3 BASIC26.37■■□□□ 1.81
NESP48681 ADAMTSL1-204ENST00000380545 1562 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
NESP48681 CXCL14-202ENST00000512158 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
NESP48681 ANP32A-203ENST00000465139 2440 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
NESP48681 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
NESP48681 SAMM50-201ENST00000350028 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
NESP48681 PSEN2-203ENST00000422240 1947 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
NESP48681 BATF2-201ENST00000301887 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
NESP48681 CRB3-201ENST00000308243 631 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
NESP48681 MAGOH-202ENST00000371470 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
NESP48681 CD300A-204ENST00000392625 1163 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
NESP48681 CRYBB3-202ENST00000404334 601 ntTSL 3 BASIC26.36■■□□□ 1.81
NESP48681 CNRIP1-202ENST00000409559 644 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
NESP48681 PSMD4P1-201ENST00000433951 1109 ntBASIC26.36■■□□□ 1.81
NESP48681 AGPAT5P1-201ENST00000455855 1019 ntBASIC26.36■■□□□ 1.81
NESP48681 AC091564.6-201ENST00000526633 487 ntTSL 3 BASIC26.36■■□□□ 1.81
NESP48681 ZNF7-218ENST00000544249 2125 ntTSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
NESP48681 C19orf25-207ENST00000588871 2128 ntTSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
NESP48681 FSTL3-206ENST00000592947 2144 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
NESP48681 TMIGD2-204ENST00000600349 333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
NESP48681 CMC2-224ENST00000630396 481 ntTSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
NESP48681 LINC00431-202ENST00000636375 159 ntBASIC26.36■■□□□ 1.81
NESP48681 SLC29A1-208ENST00000393844 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
NESP48681 NR2F2-201ENST00000394166 5275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
NESP48681 ARHGAP28-203ENST00000383472 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
NESP48681 EXOC7-213ENST00000467929 2260 ntTSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
NESP48681 AMBP-201ENST00000265132 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
NESP48681 LINC01667-202ENST00000623919 1422 ntTSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
NESP48681 ANAPC2-201ENST00000323927 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
NESP48681 UCKL1-203ENST00000369908 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
NESP48681 COX10-AS1-202ENST00000449363 1944 ntTSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
NESP48681 SELPLG-201ENST00000228463 1704 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
NESP48681 AL008718.2-201ENST00000609206 1313 ntBASIC26.36■■□□□ 1.81
NESP48681 AC244394.1-201ENST00000435000 1665 ntBASIC26.36■■□□□ 1.81
NESP48681 AL118508.1-202ENST00000411595 709 ntTSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
NESP48681 HLA-K-203ENST00000430151 1046 ntBASIC26.36■■□□□ 1.81
NESP48681 AC078875.1-201ENST00000431907 724 ntBASIC26.36■■□□□ 1.81
NESP48681 MAATS1-203ENST00000463700 939 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
NESP48681 SMIM6-201ENST00000556126 866 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
NESP48681 DUX4L46-201ENST00000566845 751 ntBASIC26.36■■□□□ 1.81
NESP48681 SLC12A5-216ENST00000626701 617 ntTSL 3 BASIC26.36■■□□□ 1.81
NESP48681 RASL10B-201ENST00000603017 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
NESP48681 ALDH4A1-201ENST00000290597 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
NESP48681 RCL1-204ENST00000381750 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
NESP48681 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
NESP48681 PPIF-201ENST00000225174 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
NESP48681 TEX264-201ENST00000341333 1340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
NESP48681 AP001273.2-201ENST00000638767 2993 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
NESP48681 TMEM208-201ENST00000304800 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
NESP48681 AP1S3-204ENST00000409375 552 ntTSL 3 BASIC26.35■■□□□ 1.81
NESP48681 MAX-211ENST00000555667 574 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
NESP48681 AC027237.1-201ENST00000560942 655 ntBASIC26.35■■□□□ 1.81
NESP48681 DUX4L47-201ENST00000566374 394 ntBASIC26.35■■□□□ 1.81
NESP48681 AC004637.1-201ENST00000586675 482 ntTSL 3 BASIC26.35■■□□□ 1.81
NESP48681 SNRPD2-206ENST00000588301 702 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.35■■□□□ 1.81
NESP48681 AL603764.1-201ENST00000636452 321 ntBASIC26.35■■□□□ 1.81
NESP48681 SGCA-201ENST00000262018 1432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
NESP48681 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
NESP48681 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
NESP48681 MAPT-210ENST00000535772 5718 ntTSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
NESP48681 ID2-203ENST00000396290 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
NESP48681 HS1BP3-203ENST00000406618 1375 ntTSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
NESP48681 LRCH3-201ENST00000334859 2258 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
NESP48681 RBM4B-206ENST00000531036 1646 ntTSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
NESP48681 PIP4K2A-202ENST00000376573 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
NESP48681 ZSCAN10-201ENST00000252463 2463 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.3 ms