Protein–RNA interactions for Protein: P42263

GRIA3, Glutamate receptor 3, humanhuman

Predictions only

Length 894 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIA3P42263 PCDH19-202ENST00000373034 9756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
GRIA3P42263 DNM1-201ENST00000341179 3254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
GRIA3P42263 LMAN1-201ENST00000251047 5521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
GRIA3P42263 GFRA2-208ENST00000524240 4921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
GRIA3P42263 RNF183-203ENST00000441031 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
GRIA3P42263 CISH-201ENST00000348721 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
GRIA3P42263 FKRP-201ENST00000318584 3332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
GRIA3P42263 SHROOM4-201ENST00000289292 6261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
GRIA3P42263 HTR7-201ENST00000277874 3028 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
GRIA3P42263 LAT2-202ENST00000344995 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
GRIA3P42263 TACR3-201ENST00000304883 5190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
GRIA3P42263 DDB1-201ENST00000301764 4506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
GRIA3P42263 SPAG6-201ENST00000313311 2421 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
GRIA3P42263 MCM3AP-AS1-202ENST00000420074 1947 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
GRIA3P42263 TTC13-201ENST00000366661 3253 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
GRIA3P42263 B3GALNT1-203ENST00000392781 3606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
GRIA3P42263 GTPBP8-202ENST00000383677 1787 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
GRIA3P42263 LEF1-202ENST00000379951 3477 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
GRIA3P42263 LCE1A-201ENST00000335123 422 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
GRIA3P42263 GJB6-202ENST00000356192 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
GRIA3P42263 LRRC37A5P-201ENST00000374304 1103 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
GRIA3P42263 TMEM191A-202ENST00000419950 663 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
GRIA3P42263 YAE1D1-202ENST00000432096 968 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
GRIA3P42263 CTDSP1-204ENST00000443891 1109 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
GRIA3P42263 AL359764.1-201ENST00000444330 504 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
GRIA3P42263 NSUN5P1-208ENST00000473960 500 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
GRIA3P42263 BEST1-205ENST00000526988 1263 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
GRIA3P42263 MAX-210ENST00000555419 765 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
GRIA3P42263 ITPK1-201ENST00000267615 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
GRIA3P42263 DDX1-202ENST00000381341 2817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
GRIA3P42263 CARMIL3-201ENST00000342740 4597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
GRIA3P42263 CCDC144B-202ENST00000445752 2197 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
GRIA3P42263 MAP7D1-203ENST00000373150 3238 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
GRIA3P42263 ZNF252P-AS1-201ENST00000527067 3236 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
GRIA3P42263 SHISA5-219ENST00000612611 1677 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
GRIA3P42263 TEAD3-204ENST00000639578 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
GRIA3P42263 MCFD2-201ENST00000319466 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
GRIA3P42263 LLGL2-201ENST00000167462 3480 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
GRIA3P42263 FOXB1-201ENST00000396057 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
GRIA3P42263 IRF3-217ENST00000597198 1741 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
GRIA3P42263 TONSL-203ENST00000613741 1713 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
GRIA3P42263 SSR4P1-203ENST00000599569 2260 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
GRIA3P42263 DMPK-202ENST00000343373 3227 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
GRIA3P42263 CLDND1-222ENST00000510545 2124 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
GRIA3P42263 ITPKB-201ENST00000272117 5822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
GRIA3P42263 ABHD2-207ENST00000565973 2347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
GRIA3P42263 RIMS3-201ENST00000372683 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
GRIA3P42263 ASAH1-249ENST00000637528 2215 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
GRIA3P42263 USP25-201ENST00000285679 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
GRIA3P42263 C16orf92-201ENST00000300575 895 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
GRIA3P42263 RPL21-203ENST00000319826 806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
GRIA3P42263 LY6G6C-201ENST00000375819 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
GRIA3P42263 XXYLT1-204ENST00000429994 865 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
GRIA3P42263 AC092809.2-202ENST00000436706 790 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
GRIA3P42263 PPP6R2P1-201ENST00000450880 1275 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
GRIA3P42263 CYMP-203ENST00000474680 1263 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
GRIA3P42263 APBB2-208ENST00000504305 1274 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
GRIA3P42263 AP002748.3-201ENST00000527092 828 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
GRIA3P42263 NRK-203ENST00000536164 908 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
GRIA3P42263 CSRP2-202ENST00000546966 754 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
GRIA3P42263 AC012173.1-201ENST00000567942 430 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
GRIA3P42263 MIR4321-201ENST00000592276 80 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
GRIA3P42263 LAMTOR5-208ENST00000614544 846 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
GRIA3P42263 PHOSPHO2-207ENST00000616524 1253 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
GRIA3P42263 GOLGA2-215ENST00000639983 1038 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
GRIA3P42263 FHL2-201ENST00000322142 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
GRIA3P42263 CCDC181-206ENST00000491570 1652 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
GRIA3P42263 ERP29-203ENST00000546477 1698 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
GRIA3P42263 SAE1-202ENST00000392776 1851 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
GRIA3P42263 LINC01267-201ENST00000502417 2284 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
GRIA3P42263 KRT82-201ENST00000257974 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
GRIA3P42263 GTF3C4-201ENST00000372146 9043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
GRIA3P42263 WNT16-201ENST00000222462 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
GRIA3P42263 PKD2L2-205ENST00000508638 2333 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
GRIA3P42263 SERAC1-201ENST00000367101 1907 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
GRIA3P42263 HEY1-208ENST00000523976 1325 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
GRIA3P42263 BCAR1-207ENST00000538440 3192 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
GRIA3P42263 SFRP4-201ENST00000436072 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
GRIA3P42263 HPS1-202ENST00000338546 1580 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
GRIA3P42263 LINC01118-203ENST00000479311 1588 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
GRIA3P42263 TRPC6-206ENST00000532133 2648 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
GRIA3P42263 CCDC144A-202ENST00000340621 2214 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
GRIA3P42263 TIA1-206ENST00000445587 1440 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
GRIA3P42263 TNR-201ENST00000263525 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
GRIA3P42263 ROR2-202ENST00000375715 2993 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
GRIA3P42263 NACAD-202ENST00000490531 4780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
GRIA3P42263 HNRNPU-204ENST00000440865 3207 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
GRIA3P42263 RASSF1-205ENST00000395126 1657 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
GRIA3P42263 ZNF398-203ENST00000483892 2121 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
GRIA3P42263 AIFM2-202ENST00000373248 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
GRIA3P42263 MARK3-202ENST00000303622 3283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
GRIA3P42263 MCHR2-201ENST00000281806 2368 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
GRIA3P42263 DMTN-204ENST00000415253 2394 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
GRIA3P42263 SNAP47-213ENST00000617596 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
GRIA3P42263 CREB3L3-201ENST00000078445 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
GRIA3P42263 FAM160B1-203ENST00000369250 2870 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
GRIA3P42263 TXNDC2-204ENST00000536353 1703 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
GRIA3P42263 ANKMY1-203ENST00000373318 2449 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
GRIA3P42263 RPL36-201ENST00000347512 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
GRIA3P42263 WLS-203ENST00000370971 700 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.7 ms