Protein–RNA interactions for Protein: P36406

TRIM23, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM23, humanhuman

Predictions only

Length 574 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM23P36406 UNC5C-203ENST00000506749 2220 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TRIM23P36406 HNRNPA1P48-201ENST00000562726 1377 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
TRIM23P36406 CYP4F2-202ENST00000221700 2407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TRIM23P36406 NR2C2-201ENST00000323373 2406 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TRIM23P36406 C14orf93-207ENST00000397382 1986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TRIM23P36406 NELFA-203ENST00000411638 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TRIM23P36406 CNN1-202ENST00000535659 1527 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TRIM23P36406 NR4A1-204ENST00000394825 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TRIM23P36406 GLUD2-201ENST00000328078 2493 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TRIM23P36406 CCDC136-212ENST00000487361 2268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TRIM23P36406 RAP1GDS1-203ENST00000380158 2085 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TRIM23P36406 KLK3-202ENST00000360617 1664 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TRIM23P36406 TP73-209ENST00000603362 1668 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TRIM23P36406 ITIH1-202ENST00000405128 1122 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TRIM23P36406 U91328.1-201ENST00000437528 223 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
TRIM23P36406 KCNQ1DN-201ENST00000441418 1093 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TRIM23P36406 CGB8-201ENST00000448456 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TRIM23P36406 NAA50-208ENST00000497255 789 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TRIM23P36406 AC021491.2-201ENST00000513017 607 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TRIM23P36406 AC015910.1-201ENST00000579400 975 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
TRIM23P36406 FXYD6-216ENST00000584230 566 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TRIM23P36406 SLC25A39-207ENST00000586016 1156 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TRIM23P36406 AC008758.5-201ENST00000595562 617 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TRIM23P36406 AC005785.1-202ENST00000597164 237 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TRIM23P36406 SPIN2A-203ENST00000614076 966 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TRIM23P36406 EFNB3-201ENST00000226091 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TRIM23P36406 CLEC18A-209ENST00000615430 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TRIM23P36406 CLEC18C-211ENST00000618957 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TRIM23P36406 CLEC18B-205ENST00000619275 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TRIM23P36406 SBNO2-202ENST00000438103 4537 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TRIM23P36406 PIAS4-201ENST00000262971 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TRIM23P36406 ADARB1-202ENST00000360697 6604 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TRIM23P36406 ATP2C1-218ENST00000510168 5067 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TRIM23P36406 PRX-202ENST00000324001 4855 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TRIM23P36406 TMEM222-211ENST00000611517 1613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TRIM23P36406 PIK3IP1-203ENST00000441972 2374 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TRIM23P36406 SIX5-204ENST00000622857 1401 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TRIM23P36406 C5orf24-204ENST00000504727 2923 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TRIM23P36406 MYB-203ENST00000341911 3672 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TRIM23P36406 TGIF1-201ENST00000330513 1980 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TRIM23P36406 SSFA2-201ENST00000320370 4965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TRIM23P36406 SP140L-204ENST00000444636 1781 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TRIM23P36406 FRA10AC1-201ENST00000359204 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TRIM23P36406 RNF31-201ENST00000324103 3627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TRIM23P36406 PRPF38B-202ENST00000370022 1591 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TRIM23P36406 CEACAM16-201ENST00000405314 1583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TRIM23P36406 DENND3-201ENST00000262585 5438 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TRIM23P36406 RSPO1-203ENST00000612451 2463 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TRIM23P36406 LFNG-204ENST00000402045 2058 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TRIM23P36406 FAM46A-201ENST00000320172 5609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TRIM23P36406 TSC2-222ENST00000568454 5434 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TRIM23P36406 MTX3-201ENST00000509852 1655 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TRIM23P36406 DEPDC7-202ENST00000311388 2012 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TRIM23P36406 LINC01529-205ENST00000637365 2000 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TRIM23P36406 EPB41L3-202ENST00000342933 4270 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TRIM23P36406 FBP1-203ENST00000415431 1487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TRIM23P36406 GOLM1-203ENST00000388712 3046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TRIM23P36406 C7orf31-201ENST00000283905 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TRIM23P36406 EDN3-205ENST00000395654 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TRIM23P36406 UGCG-201ENST00000374279 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TRIM23P36406 TRIM13-201ENST00000356017 1637 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TRIM23P36406 MSI2-206ENST00000579180 1635 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TRIM23P36406 ZNF500-201ENST00000219478 5880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TRIM23P36406 MIOX-201ENST00000216075 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TRIM23P36406 VCX-201ENST00000341408 677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TRIM23P36406 C14orf178-201ENST00000355883 642 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TRIM23P36406 AC093423.3-201ENST00000370453 654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TRIM23P36406 AL513303.2-201ENST00000413339 536 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TRIM23P36406 C1orf210-201ENST00000423420 629 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TRIM23P36406 AC134915.1-201ENST00000426461 574 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
TRIM23P36406 AC007389.4-201ENST00000454674 793 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
TRIM23P36406 AC009686.1-201ENST00000522494 364 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TRIM23P36406 AC008750.2-202ENST00000532688 729 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TRIM23P36406 ENPP7P5-201ENST00000541031 1031 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
TRIM23P36406 AL359711.2-201ENST00000563105 872 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
TRIM23P36406 AC106886.1-201ENST00000568660 600 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
TRIM23P36406 HAUS2-207ENST00000568846 709 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TRIM23P36406 AC016727.1-204ENST00000578974 420 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TRIM23P36406 GPX4-206ENST00000588919 803 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TRIM23P36406 AC005253.2-201ENST00000593791 432 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TRIM23P36406 AC073389.2-202ENST00000607450 441 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TRIM23P36406 FXN-201ENST00000377270 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TRIM23P36406 AGK-211ENST00000629555 2765 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TRIM23P36406 ADD1-205ENST00000398125 4079 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TRIM23P36406 FDX1-201ENST00000260270 3206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TRIM23P36406 TGFB1I1-203ENST00000394863 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TRIM23P36406 FAM76B-201ENST00000358780 3952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TRIM23P36406 C5orf24-202ENST00000394976 5065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TRIM23P36406 GFOD1-203ENST00000379287 8751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TRIM23P36406 CCDC71L-202ENST00000523505 4232 ntAPPRIS P2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TRIM23P36406 FAM153B-220ENST00000515817 1966 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TRIM23P36406 AL136309.2-201ENST00000427049 2277 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TRIM23P36406 SCYL1-214ENST00000533862 2570 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TRIM23P36406 SLC3A2-208ENST00000536981 1486 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TRIM23P36406 SLC34A1-204ENST00000512593 1912 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TRIM23P36406 ZNF418-208ENST00000599852 2501 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TRIM23P36406 ACE-204ENST00000428043 5120 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TRIM23P36406 MICALL2-201ENST00000297508 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TRIM23P36406 SEC14L4-201ENST00000255858 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TRIM23P36406 GK-202ENST00000378941 458 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.1 ms