Protein–RNA interactions for Protein: P35244

RPA3, Replication protein A 14 kDa subunit, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 121 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPA3P35244 TSPAN4-208ENST00000409531 1339 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
RPA3P35244 SSFA2-205ENST00000431877 5150 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
RPA3P35244 ALOX12B-201ENST00000319144 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
RPA3P35244 DISC1-209ENST00000439617 7059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
RPA3P35244 GMPPA-202ENST00000341142 1524 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
RPA3P35244 CD82-202ENST00000342935 967 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
RPA3P35244 BAX-203ENST00000354470 433 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
RPA3P35244 TCEAL3-203ENST00000372628 1221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
RPA3P35244 CTRC-202ENST00000375949 898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
RPA3P35244 PRR29-203ENST00000425164 1266 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
RPA3P35244 ACTG1P14-201ENST00000446382 1122 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
RPA3P35244 AKR1A1-204ENST00000471651 1018 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
RPA3P35244 ALG1L5P-201ENST00000482043 771 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
RPA3P35244 CTBP1-AS2-204ENST00000514984 533 ntTSL 4 BASIC16.01■□□□□ 0.15
RPA3P35244 AC087276.3-201ENST00000526220 787 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
RPA3P35244 SMCO4-204ENST00000527149 472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
RPA3P35244 AC133550.1-201ENST00000563565 295 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
RPA3P35244 RARRES2P8-201ENST00000566335 367 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
RPA3P35244 LINC01842-201ENST00000588275 768 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
RPA3P35244 MRPL34-205ENST00000600434 793 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
RPA3P35244 AC010624.2-201ENST00000600998 575 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
RPA3P35244 AC099522.2-201ENST00000607001 744 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
RPA3P35244 IRF1-211ENST00000613424 821 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
RPA3P35244 AC092902.6-201ENST00000641783 218 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
RPA3P35244 DNAJC14-201ENST00000317269 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
RPA3P35244 ITPRIPL1-205ENST00000536814 1947 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
RPA3P35244 TM4SF4-201ENST00000305354 2101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
RPA3P35244 TSG101-204ENST00000536719 2101 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
RPA3P35244 MFN2-203ENST00000444836 4531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
RPA3P35244 AC027601.1-201ENST00000575922 4506 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
RPA3P35244 BRSK2-204ENST00000526678 2091 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
RPA3P35244 FAM114A2-215ENST00000522858 3379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
RPA3P35244 TMEM222-211ENST00000611517 1613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
RPA3P35244 SGK3-211ENST00000522398 3106 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
RPA3P35244 PPP1R16B-202ENST00000373331 6106 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
RPA3P35244 PLEKHA8P1-201ENST00000256692 1839 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
RPA3P35244 ALG1-204ENST00000588623 2671 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
RPA3P35244 PHF19-203ENST00000419155 3525 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
RPA3P35244 PRR22-202ENST00000419421 1392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
RPA3P35244 KRT8P44-201ENST00000441609 1350 ntBASIC16■□□□□ 0.15
RPA3P35244 PARP10-201ENST00000313028 3497 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RPA3P35244 ELAVL3-201ENST00000359227 4729 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
RPA3P35244 CBX7-201ENST00000216133 4081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RPA3P35244 MAX-204ENST00000358402 1973 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RPA3P35244 THRA-203ENST00000450525 4895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RPA3P35244 CALD1-222ENST00000495522 2199 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
RPA3P35244 CCNL1-202ENST00000295926 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RPA3P35244 APPL1-201ENST00000288266 6058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RPA3P35244 FLJ16779-201ENST00000612722 7638 ntBASIC16■□□□□ 0.15
RPA3P35244 ALOX12-AS1-201ENST00000399540 1730 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
RPA3P35244 TNIP1-217ENST00000523200 1743 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RPA3P35244 CATSPER4-202ENST00000456354 1912 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RPA3P35244 CDH16-207ENST00000568632 2526 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RPA3P35244 NUP93-201ENST00000308159 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RPA3P35244 THOC5-203ENST00000397872 2676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
RPA3P35244 AC018892.3-201ENST00000623986 2499 ntBASIC16■□□□□ 0.15
RPA3P35244 NCALD-217ENST00000521599 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RPA3P35244 SH3BP2-207ENST00000503393 9158 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RPA3P35244 CLDN14-201ENST00000342108 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RPA3P35244 TNRC18-202ENST00000399434 1459 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
RPA3P35244 IGSF11-209ENST00000491903 1487 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
RPA3P35244 TSTD1-203ENST00000368024 457 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
RPA3P35244 KRT18P13-201ENST00000400056 1290 ntBASIC16■□□□□ 0.15
RPA3P35244 SELENOM-202ENST00000402395 1054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RPA3P35244 UPF3AP3-201ENST00000420996 769 ntBASIC16■□□□□ 0.15
RPA3P35244 AL671277.1-201ENST00000429656 993 ntBASIC16■□□□□ 0.15
RPA3P35244 EHMT1-216ENST00000493484 1182 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
RPA3P35244 LINC01485-205ENST00000523617 586 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
RPA3P35244 CFL1-202ENST00000524553 860 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
RPA3P35244 FAM86C2P-203ENST00000528684 1004 ntBASIC16■□□□□ 0.15
RPA3P35244 FLYWCH2-203ENST00000572006 754 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
RPA3P35244 AC011476.2-201ENST00000585492 1271 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
RPA3P35244 IGFLR1-205ENST00000588992 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
RPA3P35244 SIGLEC7-205ENST00000600577 616 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RPA3P35244 CITED2-204ENST00000618718 901 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
RPA3P35244 SHISA9-203ENST00000558583 6724 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
RPA3P35244 ALDH3B2-201ENST00000349015 2649 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
RPA3P35244 CYP4F2-202ENST00000221700 2407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RPA3P35244 AKAP7-204ENST00000431975 2954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
RPA3P35244 EEPD1-205ENST00000534978 2769 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
RPA3P35244 RPS9-207ENST00000441429 1600 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RPA3P35244 TANK-202ENST00000392749 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RPA3P35244 TRAF3-204ENST00000539721 1786 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
RPA3P35244 RNPS1-223ENST00000568631 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
RPA3P35244 MAPK7-204ENST00000395604 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RPA3P35244 MFSD13A-201ENST00000238936 2852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
RPA3P35244 AC053503.2-201ENST00000420563 1598 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
RPA3P35244 SALL3-205ENST00000575389 3996 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
RPA3P35244 DYSF-207ENST00000409762 6727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RPA3P35244 DYSF-211ENST00000429174 6739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RPA3P35244 KLK5-203ENST00000593428 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RPA3P35244 EIF2B3-210ENST00000620860 1923 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RPA3P35244 AC232323.1-201ENST00000540724 2099 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
RPA3P35244 REXO1L5P-201ENST00000622260 2098 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
RPA3P35244 ACSL3-201ENST00000357430 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RPA3P35244 F10-202ENST00000375559 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RPA3P35244 EIF4G1-209ENST00000414031 5569 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RPA3P35244 BEX4-202ENST00000372695 1328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RPA3P35244 RHD-207ENST00000454452 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RPA3P35244 PCDHA6-203ENST00000529310 5374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.9 ms