Protein–RNA interactions for Protein: P31947

SFN, 14-3-3 protein sigma, humanhuman

Predictions only

Length 248 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SFNP31947 AC120045.2-201ENST00000567334 178 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
SFNP31947 AC005785.1-202ENST00000597164 237 ntTSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
SFNP31947 B4GALNT4-201ENST00000329962 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
SFNP31947 GSTO2-203ENST00000450629 1391 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
SFNP31947 VPS16-203ENST00000380469 2318 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
SFNP31947 TIPRL-202ENST00000367833 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
SFNP31947 PABPC4-203ENST00000372858 2753 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
SFNP31947 DMRT2-202ENST00000302441 1495 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
SFNP31947 KRT9-202ENST00000588431 1493 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
SFNP31947 CLIP4-201ENST00000320081 4293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
SFNP31947 DHX40-202ENST00000425628 2255 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
SFNP31947 NFE2L3-201ENST00000056233 3686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
SFNP31947 LARP4B-211ENST00000612396 8546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
SFNP31947 TBL2-201ENST00000305632 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
SFNP31947 HHIP-202ENST00000434550 1770 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
SFNP31947 PDXK-202ENST00000327574 2583 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
SFNP31947 ACP2-201ENST00000256997 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
SFNP31947 SLC29A1-205ENST00000371740 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
SFNP31947 ATP2C1-218ENST00000510168 5067 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
SFNP31947 AC006460.2-201ENST00000638173 4744 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
SFNP31947 HERPUD1-201ENST00000300302 1862 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
SFNP31947 SLC2A4-202ENST00000424875 1852 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
SFNP31947 AP003680.1-201ENST00000598970 3660 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
SFNP31947 POLL-217ENST00000628479 1953 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
SFNP31947 KIAA1586-203ENST00000545356 2883 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
SFNP31947 SYBU-219ENST00000528647 2995 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
SFNP31947 BECN1-213ENST00000590099 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
SFNP31947 NDUFB7-201ENST00000215565 531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
SFNP31947 FANK1-204ENST00000368695 1296 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
SFNP31947 WDR38-201ENST00000373574 1252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
SFNP31947 DERL3-204ENST00000406855 1063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
SFNP31947 SOCS2P1-201ENST00000417727 557 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
SFNP31947 TMEM191A-209ENST00000452055 788 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
SFNP31947 AL451067.1-201ENST00000453111 394 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
SFNP31947 AC026410.3-201ENST00000514280 936 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
SFNP31947 ENPP7P5-201ENST00000541031 1031 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
SFNP31947 GABARAPL1-217ENST00000545887 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
SFNP31947 LYSMD2-204ENST00000560491 1026 ntTSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
SFNP31947 AL359711.2-201ENST00000563105 872 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
SFNP31947 AC124283.3-201ENST00000570869 594 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
SFNP31947 PAM16-204ENST00000571941 674 ntTSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
SFNP31947 PPP1R14A-203ENST00000587515 607 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
SFNP31947 AC008758.5-201ENST00000595562 617 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.48■□□□□ 0.39
SFNP31947 CTDSP2-201ENST00000398073 4795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
SFNP31947 AC020915.1-201ENST00000413518 1469 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
SFNP31947 LCK-202ENST00000336890 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
SFNP31947 DFNA5-202ENST00000409775 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
SFNP31947 AC022188.1-201ENST00000620960 1664 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
SFNP31947 LINC00942-201ENST00000515614 2417 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
SFNP31947 PCDHA12-201ENST00000398631 5233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
SFNP31947 DOK3-203ENST00000377112 1884 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
SFNP31947 NUCB1-202ENST00000407032 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
SFNP31947 CCDC144B-202ENST00000445752 2197 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
SFNP31947 NOX5-204ENST00000455873 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
SFNP31947 KRT8P22-201ENST00000562317 1415 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
SFNP31947 VPS26A-201ENST00000263559 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
SFNP31947 NIPAL3-204ENST00000374399 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
SFNP31947 SQSTM1-213ENST00000510187 1714 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
SFNP31947 STOX1-201ENST00000298596 3377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
SFNP31947 BUD31-201ENST00000222969 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
SFNP31947 CC2D2B-203ENST00000423344 1241 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
SFNP31947 AC097717.1-202ENST00000457577 740 ntTSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
SFNP31947 RN7SL837P-201ENST00000463010 287 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
SFNP31947 ZNF7-206ENST00000528130 1134 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
SFNP31947 AP006621.2-201ENST00000533938 284 ntTSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
SFNP31947 AC129507.3-201ENST00000571512 913 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
SFNP31947 MIF4GD-206ENST00000579119 856 ntTSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
SFNP31947 HIST1H2AB-201ENST00000615868 393 ntAPPRIS P1 BASIC17.47■□□□□ 0.39
SFNP31947 IGHV3-72-202ENST00000621503 303 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
SFNP31947 KIAA0391-202ENST00000321130 1589 ntTSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
SFNP31947 PRRG1-203ENST00000463135 1663 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
SFNP31947 SLC2A9-202ENST00000309065 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
SFNP31947 CLEC18A-203ENST00000449317 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
SFNP31947 CLCNKA-203ENST00000439316 1997 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
SFNP31947 SLC35C2-202ENST00000317734 2175 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
SFNP31947 CD34-202ENST00000356522 2874 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
SFNP31947 TBC1D9B-201ENST00000355235 5119 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
SFNP31947 KAT2A-201ENST00000225916 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
SFNP31947 PARP9-204ENST00000471785 3040 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
SFNP31947 FOXP1-218ENST00000498215 2400 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
SFNP31947 HIC2-201ENST00000407464 6798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
SFNP31947 ATP6V1B1-202ENST00000412314 1805 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
SFNP31947 SPIB-201ENST00000270632 1443 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
SFNP31947 ODF3-201ENST00000325113 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
SFNP31947 SCNN1A-221ENST00000543768 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
SFNP31947 FAM184B-201ENST00000265018 6622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
SFNP31947 MFF-204ENST00000353339 2186 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
SFNP31947 STEAP3-202ENST00000393107 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
SFNP31947 RNF167-211ENST00000575111 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
SFNP31947 TSC2-201ENST00000219476 6156 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
SFNP31947 VGLL4-202ENST00000413604 1554 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
SFNP31947 PDCD2-208ENST00000541970 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
SFNP31947 CDC42EP4-201ENST00000335793 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
SFNP31947 PSMD9-201ENST00000261817 2307 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
SFNP31947 DZANK1-202ENST00000329494 1389 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
SFNP31947 PHLDA2-201ENST00000314222 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
SFNP31947 PRKN-203ENST00000366894 1157 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
SFNP31947 LDLRAD1-201ENST00000371360 785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
SFNP31947 C1QBPP1-201ENST00000400117 770 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
SFNP31947 KRTAP10-1-201ENST00000400375 1215 ntAPPRIS P1 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.1 ms