Protein–RNA interactions for Protein: P29973

CNGA1, cGMP-gated cation channel alpha-1, humanhuman

Predictions only

Length 690 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNGA1P29973 AC133919.2-202ENST00000563515 416 ntTSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
CNGA1P29973 DCST1-201ENST00000295542 2279 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
CNGA1P29973 ERO1A-201ENST00000395686 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CNGA1P29973 PGAP3-201ENST00000300658 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CNGA1P29973 NAT9-210ENST00000580301 1860 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CNGA1P29973 REXO1L8P-201ENST00000604378 1897 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
CNGA1P29973 NEIL2-204ENST00000455213 2323 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
CNGA1P29973 PDE4C-201ENST00000262805 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CNGA1P29973 PRDM5-202ENST00000394435 2492 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CNGA1P29973 CALM1-216ENST00000626705 1341 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
CNGA1P29973 ERICH5-201ENST00000318528 1761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CNGA1P29973 C17orf100-201ENST00000542475 1756 ntAPPRIS P1 BASIC17.94■□□□□ 0.46
CNGA1P29973 GPER1-206ENST00000617001 1900 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
CNGA1P29973 AC006449.5-201ENST00000610658 2098 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
CNGA1P29973 STKLD1-201ENST00000371957 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CNGA1P29973 ABHD10-201ENST00000273359 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CNGA1P29973 SMAD3-201ENST00000327367 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CNGA1P29973 PRRT4-201ENST00000446477 3544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
CNGA1P29973 CPEB2-203ENST00000382395 5524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CNGA1P29973 PPM1D-201ENST00000305921 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CNGA1P29973 ILVBL-201ENST00000263383 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CNGA1P29973 EIF4H-202ENST00000353999 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CNGA1P29973 PNMA3-202ENST00000593810 1432 ntAPPRIS P1 BASIC17.93■□□□□ 0.46
CNGA1P29973 CCDC88B-201ENST00000301897 870 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CNGA1P29973 DMKN-216ENST00000458071 510 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
CNGA1P29973 RPL13AP25-201ENST00000484130 612 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
CNGA1P29973 AC115284.1-201ENST00000488257 547 ntTSL 4 BASIC17.93■□□□□ 0.46
CNGA1P29973 RMDN1-212ENST00000519966 1164 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
CNGA1P29973 AL390726.5-201ENST00000562942 871 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
CNGA1P29973 FBXL12-211ENST00000591009 1005 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CNGA1P29973 TUBB6-213ENST00000591909 1017 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CNGA1P29973 TVP23B-201ENST00000307767 2064 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CNGA1P29973 PCIF1-201ENST00000372409 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CNGA1P29973 AL121758.1-201ENST00000488788 2714 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
CNGA1P29973 NAIF1-201ENST00000373078 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CNGA1P29973 C9orf78-201ENST00000372447 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CNGA1P29973 DUSP13-203ENST00000372702 1778 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CNGA1P29973 RNPS1-223ENST00000568631 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
CNGA1P29973 FBP1-203ENST00000415431 1487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
CNGA1P29973 CBX8-201ENST00000269385 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CNGA1P29973 SULT1A2-204ENST00000533150 1991 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
CNGA1P29973 SNX31-201ENST00000311812 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
CNGA1P29973 ADARB2-203ENST00000381312 8421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CNGA1P29973 GRAPL-201ENST00000344415 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CNGA1P29973 PCNP-201ENST00000265260 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CNGA1P29973 LRRC47-201ENST00000378251 4310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CNGA1P29973 AL596257.1-201ENST00000641463 2694 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
CNGA1P29973 CBS-202ENST00000359624 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CNGA1P29973 CBSL-203ENST00000618024 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CNGA1P29973 BX088651.4-201ENST00000435586 2579 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
CNGA1P29973 APH1A-203ENST00000369109 1713 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CNGA1P29973 AC008969.1-201ENST00000550135 6438 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
CNGA1P29973 SGPP1-201ENST00000247225 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CNGA1P29973 HCLS1-202ENST00000428394 1560 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
CNGA1P29973 AP000787.1-201ENST00000501356 1926 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
CNGA1P29973 C1RL-210ENST00000544702 1569 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CNGA1P29973 GLS2-216ENST00000610413 2296 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
CNGA1P29973 CARNS1-201ENST00000307823 3942 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CNGA1P29973 NIM1K-201ENST00000326035 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CNGA1P29973 CLPTM1-203ENST00000546079 2342 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
CNGA1P29973 CLMAT3-201ENST00000510576 1973 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CNGA1P29973 ANKRD35-202ENST00000544626 3093 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
CNGA1P29973 MPP1-205ENST00000413259 2195 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
CNGA1P29973 CYP21A2-221ENST00000418967 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CNGA1P29973 CCT2-202ENST00000543146 2189 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
CNGA1P29973 FAM169B-201ENST00000332908 579 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
CNGA1P29973 SS18L1-202ENST00000370848 1238 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CNGA1P29973 MOGAT3-202ENST00000379423 933 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CNGA1P29973 IGHV3-16-201ENST00000390604 425 ntAPPRIS P1 BASIC17.92■□□□□ 0.46
CNGA1P29973 ATP5D-202ENST00000395633 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CNGA1P29973 C1QBPP1-201ENST00000400117 770 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
CNGA1P29973 AC016694.1-201ENST00000434179 700 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
CNGA1P29973 AL669970.3-201ENST00000435284 428 ntTSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
CNGA1P29973 AP000552.1-208ENST00000452952 576 ntTSL 4 BASIC17.92■□□□□ 0.46
CNGA1P29973 PARP8-218ENST00000513738 596 ntTSL 4 BASIC17.92■□□□□ 0.46
CNGA1P29973 AP001007.1-201ENST00000526796 645 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
CNGA1P29973 PLEKHA7-214ENST00000532079 565 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
CNGA1P29973 LINC02279-201ENST00000553435 737 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
CNGA1P29973 MIR3615-201ENST00000581999 87 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
CNGA1P29973 AC003070.2-201ENST00000589730 386 ntTSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
CNGA1P29973 AC011497.1-201ENST00000596781 561 ntTSL 4 BASIC17.92■□□□□ 0.46
CNGA1P29973 C9orf50-202ENST00000619117 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CNGA1P29973 AC006449.3-201ENST00000620144 563 ntTSL 4 BASIC17.92■□□□□ 0.46
CNGA1P29973 LILRA2-208ENST00000629481 661 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
CNGA1P29973 HADH-212ENST00000638621 741 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
CNGA1P29973 CALHM2-202ENST00000369788 1843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
CNGA1P29973 ZMYM3-203ENST00000373981 1841 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CNGA1P29973 GTF2H2C-201ENST00000380729 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CNGA1P29973 WNT2-201ENST00000265441 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CNGA1P29973 KLC1-212ENST00000553286 3135 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
CNGA1P29973 ATP4B-201ENST00000335288 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CNGA1P29973 SLC17A7-204ENST00000600601 2237 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
CNGA1P29973 SLC1A6-208ENST00000598504 2987 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CNGA1P29973 ARL14EP-201ENST00000282032 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CNGA1P29973 SHISA9-203ENST00000558583 6724 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
CNGA1P29973 BCS1L-203ENST00000392110 1525 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
CNGA1P29973 AL592424.1-201ENST00000563624 1536 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
CNGA1P29973 ADRB1-201ENST00000369295 2853 ntAPPRIS P1 BASIC17.92■□□□□ 0.46
CNGA1P29973 FGFR2-215ENST00000457416 3061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CNGA1P29973 FOXN1-203ENST00000579795 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.7 ms