Protein–RNA interactions for Protein: P29374

ARID4A, AT-rich interactive domain-containing protein 4A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,257 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARID4AP29374 NOX5-204ENST00000455873 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
ARID4AP29374 RPN1-207ENST00000497289 2137 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
ARID4AP29374 RSRP1-202ENST00000431849 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
ARID4AP29374 KRTAP10-2-201ENST00000391621 1149 ntAPPRIS P1 BASIC18.94■□□□□ 0.62
ARID4AP29374 AL133481.1-201ENST00000438554 511 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
ARID4AP29374 MDH2-205ENST00000461263 648 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
ARID4AP29374 AC078785.1-203ENST00000467342 573 ntTSL 4 BASIC18.94■□□□□ 0.62
ARID4AP29374 TIMM8B-201ENST00000504148 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
ARID4AP29374 AP001995.1-201ENST00000531784 1157 ntTSL 4 BASIC18.94■□□□□ 0.62
ARID4AP29374 AC006449.3-201ENST00000620144 563 ntTSL 4 BASIC18.94■□□□□ 0.62
ARID4AP29374 AC005252.2-201ENST00000624630 1141 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
ARID4AP29374 LINC00391-201ENST00000433569 1844 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
ARID4AP29374 GRIN2C-202ENST00000347612 2929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
ARID4AP29374 APOBEC3A-202ENST00000402255 1478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
ARID4AP29374 RHNO1-202ENST00000461997 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
ARID4AP29374 AC006063.2-201ENST00000640161 1696 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
ARID4AP29374 MDGA1-203ENST00000434837 10736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
ARID4AP29374 ELAVL2-208ENST00000544538 3789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
ARID4AP29374 TAF6-209ENST00000452041 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
ARID4AP29374 SLC6A2-209ENST00000568943 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
ARID4AP29374 ATP6AP2-217ENST00000636580 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
ARID4AP29374 DUSP8-202ENST00000397374 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
ARID4AP29374 STYXL1-203ENST00000359697 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
ARID4AP29374 SLC22A6-203ENST00000421062 1560 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
ARID4AP29374 ADGRB2-212ENST00000527361 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
ARID4AP29374 MED17-201ENST00000251871 5142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
ARID4AP29374 SCNN1A-221ENST00000543768 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
ARID4AP29374 KSR1-216ENST00000582410 2392 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
ARID4AP29374 AMFR-201ENST00000290649 3600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
ARID4AP29374 SEC14L4-204ENST00000381982 1603 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
ARID4AP29374 BCS1L-205ENST00000412366 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
ARID4AP29374 CD2BP2-203ENST00000569466 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
ARID4AP29374 UCHL5-206ENST00000367455 5327 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
ARID4AP29374 EXD3-201ENST00000340951 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
ARID4AP29374 CD34-202ENST00000356522 2874 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
ARID4AP29374 FERMT2-203ENST00000395631 3369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
ARID4AP29374 ZCCHC3-201ENST00000500893 3354 ntAPPRIS P1 BASIC18.93■□□□□ 0.62
ARID4AP29374 RAP1GAP2-209ENST00000637138 3175 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
ARID4AP29374 FGF6-201ENST00000228837 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
ARID4AP29374 IL32-202ENST00000325568 1105 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
ARID4AP29374 CKLF-203ENST00000351137 508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
ARID4AP29374 ADAMTSL1-208ENST00000380570 931 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
ARID4AP29374 RCL1-204ENST00000381750 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
ARID4AP29374 IL32-203ENST00000382213 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.93■□□□□ 0.62
ARID4AP29374 SELENOM-201ENST00000400299 694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
ARID4AP29374 Z98749.2-201ENST00000428294 700 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
ARID4AP29374 PRSS42-202ENST00000447340 1280 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
ARID4AP29374 MTX3-202ENST00000512528 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
ARID4AP29374 AP006621.2-201ENST00000533938 284 ntTSL 3 BASIC18.93■□□□□ 0.62
ARID4AP29374 BX927359.1-201ENST00000556073 543 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
ARID4AP29374 SALL4-203ENST00000395997 1918 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
ARID4AP29374 ROPN1-203ENST00000459660 1909 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
ARID4AP29374 ZSCAN32-205ENST00000439568 1746 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
ARID4AP29374 CCDC144B-202ENST00000445752 2197 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
ARID4AP29374 ZC2HC1C-202ENST00000439583 1509 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
ARID4AP29374 LARP4B-211ENST00000612396 8546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
ARID4AP29374 EIF3K-203ENST00000545173 1327 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
ARID4AP29374 NPRL3-211ENST00000611875 2881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
ARID4AP29374 PGAP2-205ENST00000396993 1566 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
ARID4AP29374 RBPMS-204ENST00000397323 2941 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
ARID4AP29374 NTRK1-202ENST00000368196 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
ARID4AP29374 SYBU-219ENST00000528647 2995 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
ARID4AP29374 METTL25-201ENST00000248306 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
ARID4AP29374 NUCB1-202ENST00000407032 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
ARID4AP29374 LINC00942-201ENST00000515614 2417 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
ARID4AP29374 KTN1-AS1-201ENST00000335142 1465 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
ARID4AP29374 KLK6-203ENST00000391808 1478 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
ARID4AP29374 SLC29A1-205ENST00000371740 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
ARID4AP29374 MGMT-201ENST00000306010 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
ARID4AP29374 RNF167-211ENST00000575111 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
ARID4AP29374 PRDM8-201ENST00000339711 4095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
ARID4AP29374 APOA1-201ENST00000236850 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
ARID4AP29374 TSPO-202ENST00000337554 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
ARID4AP29374 APOA1-205ENST00000375329 927 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
ARID4AP29374 ARSEP1-201ENST00000420443 635 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
ARID4AP29374 AC112492.5-201ENST00000421897 457 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
ARID4AP29374 AC017116.1-201ENST00000445938 708 ntTSL 3 BASIC18.92■□□□□ 0.62
ARID4AP29374 CXorf40A-211ENST00000450602 1204 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.92■□□□□ 0.62
ARID4AP29374 AC097717.1-202ENST00000457577 740 ntTSL 3 BASIC18.92■□□□□ 0.62
ARID4AP29374 AL354710.2-201ENST00000468244 550 ntTSL 4 BASIC18.92■□□□□ 0.62
ARID4AP29374 C12orf10-204ENST00000548632 988 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
ARID4AP29374 EEF1AKMT3-204ENST00000551420 836 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
ARID4AP29374 AC129507.3-201ENST00000571512 913 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
ARID4AP29374 AC011489.1-202ENST00000586556 618 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
ARID4AP29374 RAB11B-202ENST00000594216 894 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
ARID4AP29374 PIH1D1-209ENST00000596049 992 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
ARID4AP29374 FLT3LG-205ENST00000596435 1034 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
ARID4AP29374 AC093813.1-201ENST00000605066 256 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
ARID4AP29374 TPTE2P2-205ENST00000606711 505 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
ARID4AP29374 AC025181.2-201ENST00000606994 802 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
ARID4AP29374 TP73-204ENST00000378280 2062 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
ARID4AP29374 AQP3-201ENST00000297991 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
ARID4AP29374 CTSA-202ENST00000354880 1820 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
ARID4AP29374 VPS37C-201ENST00000301765 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
ARID4AP29374 EIF4ENIF1-206ENST00000397525 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
ARID4AP29374 TBC1D26-206ENST00000579428 1583 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
ARID4AP29374 AC092127.1-201ENST00000567093 3455 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
ARID4AP29374 HERPUD1-201ENST00000300302 1862 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
ARID4AP29374 RECK-201ENST00000377966 4888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
ARID4AP29374 CTSB-219ENST00000530640 1389 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 151 ms