Protein–RNA interactions for Protein: P28290

SSFA2, Sperm-specific antigen 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,259 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSFA2P28290 LYRM9-204ENST00000503642 432 ntTSL 3 BASIC20.25■□□□□ 0.83
SSFA2P28290 AC126768.2-201ENST00000511693 718 ntTSL 3 BASIC20.25■□□□□ 0.83
SSFA2P28290 FAM86HP-204ENST00000513466 959 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
SSFA2P28290 AP002992.1-201ENST00000527519 491 ntTSL 3 BASIC20.25■□□□□ 0.83
SSFA2P28290 AL021546.1-201ENST00000551806 552 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.25■□□□□ 0.83
SSFA2P28290 AP001063.1-201ENST00000568332 529 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
SSFA2P28290 LINC01233-203ENST00000601708 494 ntTSL 3 BASIC20.25■□□□□ 0.83
SSFA2P28290 CRH-201ENST00000276571 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
SSFA2P28290 KLK3-202ENST00000360617 1664 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
SSFA2P28290 PTPN20-203ENST00000374342 1929 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
SSFA2P28290 PRR5-218ENST00000624862 1900 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
SSFA2P28290 SEMA4B-202ENST00000411539 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
SSFA2P28290 C1RL-210ENST00000544702 1569 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
SSFA2P28290 GREB1-205ENST00000389825 1315 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
SSFA2P28290 PSMD8-209ENST00000602911 1330 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
SSFA2P28290 BRI3BP-201ENST00000341446 6648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
SSFA2P28290 PRKCSH-217ENST00000592741 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
SSFA2P28290 AMT-206ENST00000458307 1860 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
SSFA2P28290 GPC1-201ENST00000264039 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
SSFA2P28290 VIPR1-204ENST00000438259 2427 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
SSFA2P28290 SYVN1-202ENST00000307289 2841 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
SSFA2P28290 GPR176-205ENST00000561100 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
SSFA2P28290 PPP2R2B-206ENST00000453001 2569 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
SSFA2P28290 PAUPAR-201ENST00000630360 2965 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
SSFA2P28290 MAPKAP1-206ENST00000373511 3252 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
SSFA2P28290 ONECUT1-201ENST00000305901 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
SSFA2P28290 NBL1-211ENST00000618761 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
SSFA2P28290 NAT8-201ENST00000272425 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
SSFA2P28290 COX6A2-201ENST00000287490 440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
SSFA2P28290 FCGR1B-203ENST00000369384 1044 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
SSFA2P28290 GTF2A2-204ENST00000396063 970 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
SSFA2P28290 APOPT1-207ENST00000477116 906 ntTSL 3 BASIC20.24■□□□□ 0.83
SSFA2P28290 CDKN2AIP-205ENST00000510928 860 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
SSFA2P28290 IFITM3-202ENST00000526811 543 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
SSFA2P28290 AKIP1-210ENST00000534147 1022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
SSFA2P28290 AC026495.1-203ENST00000557528 906 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
SSFA2P28290 LINC02205-201ENST00000559752 239 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
SSFA2P28290 AC108134.3-202ENST00000571404 1207 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
SSFA2P28290 AC106872.11-201ENST00000605838 421 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
SSFA2P28290 CCDC155-201ENST00000447857 2378 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
SSFA2P28290 AC010478.1-202ENST00000559112 2367 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
SSFA2P28290 HYMAI-201ENST00000635591 3347 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
SSFA2P28290 GRAPL-201ENST00000344415 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
SSFA2P28290 CHST10-203ENST00000409701 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
SSFA2P28290 CCNC-209ENST00000520371 2186 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
SSFA2P28290 SAMD4A-204ENST00000554335 3003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
SSFA2P28290 CDK13-201ENST00000181839 7298 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
SSFA2P28290 BBS5-201ENST00000295240 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
SSFA2P28290 SP140L-204ENST00000444636 1781 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
SSFA2P28290 PRSS54-204ENST00000567164 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
SSFA2P28290 MAD1L1-202ENST00000399654 2762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
SSFA2P28290 PKLR-201ENST00000342741 2083 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
SSFA2P28290 PLAGL1-211ENST00000625622 3216 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
SSFA2P28290 ANKK1-201ENST00000303941 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
SSFA2P28290 ZFAND5-204ENST00000376960 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
SSFA2P28290 GHR-201ENST00000230882 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
SSFA2P28290 AGFG1-202ENST00000373671 1669 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
SSFA2P28290 GPS1-226ENST00000623691 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
SSFA2P28290 CLCNKA-203ENST00000439316 1997 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
SSFA2P28290 LINC00942-201ENST00000515614 2417 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
SSFA2P28290 NCAPD2-201ENST00000315579 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
SSFA2P28290 C4orf32-201ENST00000309733 8901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
SSFA2P28290 APH1A-203ENST00000369109 1713 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
SSFA2P28290 BCAT2-202ENST00000402551 2041 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
SSFA2P28290 AL121983.1-201ENST00000424181 335 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
SSFA2P28290 OLR1-203ENST00000432556 950 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
SSFA2P28290 FAM104B-207ENST00000489298 712 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
SSFA2P28290 AC093904.3-201ENST00000492300 368 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
SSFA2P28290 C4orf3-202ENST00000504110 667 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
SSFA2P28290 RAB26-202ENST00000541451 944 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
SSFA2P28290 ERH-203ENST00000557016 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
SSFA2P28290 AC243562.2-201ENST00000561247 970 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
SSFA2P28290 AP003096.1-203ENST00000564469 563 ntTSL 3 BASIC20.23■□□□□ 0.83
SSFA2P28290 SHBG-212ENST00000575314 1146 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
SSFA2P28290 AL118558.3-201ENST00000607414 1079 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
SSFA2P28290 AC005252.2-201ENST00000624630 1141 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
SSFA2P28290 LILRA2-208ENST00000629481 661 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
SSFA2P28290 GDF6-201ENST00000287020 3701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
SSFA2P28290 USE1-206ENST00000595101 1776 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
SSFA2P28290 NPRL3-211ENST00000611875 2881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
SSFA2P28290 GOLGA2P3Y-201ENST00000416946 1653 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
SSFA2P28290 KCNJ2-202ENST00000535240 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
SSFA2P28290 NUCB1-202ENST00000407032 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
SSFA2P28290 CDKN2B-AS1-208ENST00000580576 2175 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
SSFA2P28290 AL513523.2-202ENST00000427283 2040 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
SSFA2P28290 RNF217-211ENST00000560949 5145 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
SSFA2P28290 PON2-201ENST00000222572 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
SSFA2P28290 CACNA1A-247ENST00000637769 8648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
SSFA2P28290 MYO1B-202ENST00000339514 5026 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
SSFA2P28290 KLHL21-202ENST00000377663 6445 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
SSFA2P28290 SLC25A2-201ENST00000239451 1417 ntAPPRIS P1 BASIC20.22■□□□□ 0.83
SSFA2P28290 TUBB8-201ENST00000561967 1413 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
SSFA2P28290 PPP1R21-202ENST00000294952 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
SSFA2P28290 NIPA2-204ENST00000398014 3130 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
SSFA2P28290 SASH3-201ENST00000356892 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
SSFA2P28290 C9orf16-201ENST00000372994 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
SSFA2P28290 LINC01665-201ENST00000422917 1241 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
SSFA2P28290 CALR4P-201ENST00000431943 946 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
SSFA2P28290 AL929472.3-201ENST00000433474 700 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
SSFA2P28290 TREX1-201ENST00000433541 1105 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.7 ms