Protein–RNA interactions for Protein: P28070

PSMB4, Proteasome subunit beta type-4, humanhuman

Predictions only

Length 264 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSMB4P28070 PSMA8-203ENST00000415576 1280 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PSMB4P28070 TSEN15P1-201ENST00000423257 515 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
PSMB4P28070 AL135791.1-201ENST00000429214 826 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PSMB4P28070 PRRT3-AS1-201ENST00000431558 614 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PSMB4P28070 LINC01983-203ENST00000444346 519 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PSMB4P28070 AC004865.2-202ENST00000444348 852 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PSMB4P28070 FXYD6-209ENST00000530956 579 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PSMB4P28070 AC069262.1-201ENST00000539058 672 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
PSMB4P28070 AP3S2-204ENST00000558011 738 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PSMB4P28070 AC138207.8-201ENST00000579692 739 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PSMB4P28070 AC016727.1-203ENST00000603199 540 ntTSL 4 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PSMB4P28070 AL589739.1-201ENST00000607720 493 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
PSMB4P28070 AC244153.1-203ENST00000622796 419 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PSMB4P28070 STIP1-201ENST00000305218 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PSMB4P28070 ATP6AP2-233ENST00000638153 1303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PSMB4P28070 IL11RA-215ENST00000602473 1388 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PSMB4P28070 FYN-205ENST00000368682 3234 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PSMB4P28070 RPS19-206ENST00000598742 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PSMB4P28070 ALOX15-205ENST00000574640 2422 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PSMB4P28070 PHF10-205ENST00000612128 4395 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PSMB4P28070 TDRP-205ENST00000613071 3421 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PSMB4P28070 ZP3-201ENST00000336517 1483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PSMB4P28070 SURF6-201ENST00000372022 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PSMB4P28070 NISCH-202ENST00000420808 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PSMB4P28070 N4BP1-201ENST00000262384 7106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PSMB4P28070 TNN-201ENST00000239462 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PSMB4P28070 PITX2-204ENST00000394595 1693 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PSMB4P28070 CCAR2-202ENST00000389279 3980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PSMB4P28070 NIPAL3-204ENST00000374399 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PSMB4P28070 RNF168-201ENST00000318037 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PSMB4P28070 SLC12A5-209ENST00000616201 2955 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PSMB4P28070 FLAD1-201ENST00000292180 2160 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PSMB4P28070 GORAB-202ENST00000367763 2189 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PSMB4P28070 TSC22D3-201ENST00000315660 2213 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PSMB4P28070 NFIC-211ENST00000641145 8399 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
PSMB4P28070 PRX-201ENST00000291825 5502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PSMB4P28070 DMTN-204ENST00000415253 2394 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PSMB4P28070 PAK6-203ENST00000542403 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PSMB4P28070 TSPOAP1-202ENST00000343736 5947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PSMB4P28070 DIDO1-207ENST00000395343 8477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PSMB4P28070 KLHL42-201ENST00000381271 6703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PSMB4P28070 HNRNPK-204ENST00000376263 2942 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PSMB4P28070 EIF4E-201ENST00000280892 1097 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PSMB4P28070 HNRNPFP1-201ENST00000391730 1133 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
PSMB4P28070 AL080243.2-201ENST00000418783 582 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
PSMB4P28070 CD28-203ENST00000458610 705 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PSMB4P28070 PTK7-212ENST00000476760 902 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PSMB4P28070 HLA-J-203ENST00000494367 1087 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
PSMB4P28070 AC025183.1-201ENST00000506335 425 ntTSL 4 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PSMB4P28070 VPS29-207ENST00000549970 818 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PSMB4P28070 TMEM263-206ENST00000550344 925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PSMB4P28070 TGIF2-C20orf24-201ENST00000558530 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PSMB4P28070 PRR29-209ENST00000582540 967 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PSMB4P28070 AL691403.2-201ENST00000618460 490 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
PSMB4P28070 AC023511.2-201ENST00000618803 211 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
PSMB4P28070 HADH-212ENST00000638621 741 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PSMB4P28070 TMEM53-204ENST00000372243 1579 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PSMB4P28070 MTX3-201ENST00000509852 1655 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PSMB4P28070 COLGALT2-201ENST00000361927 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PSMB4P28070 ACTL6A-203ENST00000450518 1750 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PSMB4P28070 STK33-217ENST00000534493 1895 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PSMB4P28070 LFNG-202ENST00000338732 1968 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PSMB4P28070 FUT3-209ENST00000589918 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PSMB4P28070 CDK11B-209ENST00000629312 2496 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PSMB4P28070 PPP2R5D-202ENST00000394110 2894 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PSMB4P28070 LINC00900-201ENST00000499809 3322 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PSMB4P28070 SLC25A4-201ENST00000281456 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PSMB4P28070 LZTR1-201ENST00000215739 4572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PSMB4P28070 SLC25A36-203ENST00000446041 4638 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PSMB4P28070 RCAN3-202ENST00000374395 6802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PSMB4P28070 PTPN13-204ENST00000436978 8573 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PSMB4P28070 FLOT2-201ENST00000394906 2756 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PSMB4P28070 AC004834.1-201ENST00000640784 2412 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PSMB4P28070 HEY1-201ENST00000337919 2296 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PSMB4P28070 CHRNG-202ENST00000389494 2262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PSMB4P28070 TRMT1-203ENST00000437766 2263 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PSMB4P28070 CETN4P-206ENST00000642099 2168 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
PSMB4P28070 TSG101-204ENST00000536719 2101 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PSMB4P28070 WRAP73-202ENST00000378322 1998 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PSMB4P28070 CPSF6-203ENST00000456847 1915 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PSMB4P28070 CELF4-221ENST00000601019 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PSMB4P28070 BEND5-201ENST00000371833 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PSMB4P28070 IDH3B-201ENST00000380843 1545 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PSMB4P28070 TBC1D25-201ENST00000376771 4042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PSMB4P28070 C8orf76-201ENST00000276704 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PSMB4P28070 SLC18A2-201ENST00000298472 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PSMB4P28070 HRAS-202ENST00000397594 1099 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PSMB4P28070 TMEM191A-202ENST00000419950 663 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PSMB4P28070 CDH23-AS1-201ENST00000428918 378 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PSMB4P28070 LINC02558-202ENST00000436395 298 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PSMB4P28070 AC093904.3-201ENST00000492300 368 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PSMB4P28070 COMMD4-207ENST00000562789 746 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PSMB4P28070 TIMM13-202ENST00000591871 631 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PSMB4P28070 Z92544.3-201ENST00000624747 417 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
PSMB4P28070 CBR3-AS1-216ENST00000624883 564 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PSMB4P28070 ZNF644-201ENST00000337393 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PSMB4P28070 FOXI2-201ENST00000388920 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PSMB4P28070 CLCN7-202ENST00000382745 4720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PSMB4P28070 TMEM50A-201ENST00000374358 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PSMB4P28070 SPAG6-201ENST00000313311 2421 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.9 ms