Protein–RNA interactions for Protein: P23470

PTPRG, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase gamma, humanhuman

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Length 1,445 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRGP23470 QSOX1-201ENST00000367600 2519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
PTPRGP23470 SKOR1-202ENST00000380035 3675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
PTPRGP23470 ZSWIM8-AS1-201ENST00000456638 1460 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
PTPRGP23470 OSBPL1A-203ENST00000399441 1887 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
PTPRGP23470 AC006449.6-201ENST00000612330 2296 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
PTPRGP23470 IL12A-201ENST00000305579 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
PTPRGP23470 CTNNBL1-209ENST00000621317 1990 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
PTPRGP23470 FAM129C-202ENST00000335393 2508 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
PTPRGP23470 MRPL43-206ENST00000370236 866 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
PTPRGP23470 MRPL43-207ENST00000370241 824 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
PTPRGP23470 AP1S3-204ENST00000409375 552 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
PTPRGP23470 TMEM219-202ENST00000414689 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
PTPRGP23470 AL109767.1-201ENST00000429450 564 ntTSL 4 BASIC24.21■■□□□ 1.47
PTPRGP23470 MESTP3-201ENST00000503460 968 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
PTPRGP23470 NEU3-205ENST00000531619 582 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
PTPRGP23470 TMEM219-204ENST00000566848 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
PTPRGP23470 AL445483.1-201ENST00000568695 736 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
PTPRGP23470 AC011825.3-201ENST00000583184 565 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
PTPRGP23470 AC092171.5-201ENST00000608012 942 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
PTPRGP23470 JMJD4-201ENST00000366758 2595 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
PTPRGP23470 MTSS1L-201ENST00000338779 4992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
PTPRGP23470 AMBP-201ENST00000265132 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
PTPRGP23470 CBS-202ENST00000359624 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
PTPRGP23470 CBSL-203ENST00000618024 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
PTPRGP23470 PSMD13-212ENST00000532097 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
PTPRGP23470 DDOST-206ENST00000602624 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
PTPRGP23470 RHBDF1-201ENST00000262316 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
PTPRGP23470 IFFO1-201ENST00000336604 2686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
PTPRGP23470 INPP5A-203ENST00000368594 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
PTPRGP23470 ADAM6-201ENST00000606026 1843 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.47
PTPRGP23470 FGFR3-202ENST00000340107 4293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.47
PTPRGP23470 PLAG1-203ENST00000429357 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
PTPRGP23470 C10orf62-201ENST00000370640 1208 ntAPPRIS P1 BASIC24.2■■□□□ 1.46
PTPRGP23470 LINC01006-202ENST00000418309 640 ntTSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
PTPRGP23470 PFN2-202ENST00000423691 911 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
PTPRGP23470 AL133481.1-201ENST00000438554 511 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
PTPRGP23470 AC073150.1-201ENST00000450406 1084 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
PTPRGP23470 AC093627.5-203ENST00000497320 746 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
PTPRGP23470 AC108134.4-201ENST00000570700 302 ntTSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
PTPRGP23470 CUEDC1-207ENST00000577840 875 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
PTPRGP23470 AC061992.1-201ENST00000592569 777 ntTSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
PTPRGP23470 AC005901.1-201ENST00000592766 552 ntTSL 4 BASIC24.2■■□□□ 1.46
PTPRGP23470 AL358472.3-201ENST00000608147 415 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
PTPRGP23470 TMEM179-205ENST00000615704 636 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
PTPRGP23470 GLIDR-205ENST00000640674 884 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
PTPRGP23470 WRAP53-202ENST00000396463 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
PTPRGP23470 LONP1-201ENST00000360614 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
PTPRGP23470 TRAPPC2L-201ENST00000301021 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
PTPRGP23470 SYVN1-201ENST00000294256 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
PTPRGP23470 AC009802.1-201ENST00000637973 1609 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
PTPRGP23470 FAM222B-211ENST00000582266 2613 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
PTPRGP23470 SUMO3-203ENST00000397898 1779 ntTSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
PTPRGP23470 AL035460.1-201ENST00000380593 1866 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
PTPRGP23470 LINC01529-205ENST00000637365 2000 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
PTPRGP23470 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
PTPRGP23470 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
PTPRGP23470 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
PTPRGP23470 SNX2-213ENST00000514949 2119 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
PTPRGP23470 NOV-201ENST00000259526 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
PTPRGP23470 RN7SKP214-201ENST00000364208 315 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
PTPRGP23470 GSG1L-201ENST00000380897 1173 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
PTPRGP23470 AC078991.1-201ENST00000437297 610 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
PTPRGP23470 SNHG14-213ENST00000551077 638 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
PTPRGP23470 CDIP1-202ENST00000562334 1205 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
PTPRGP23470 SNORD3B-2-202ENST00000571722 791 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
PTPRGP23470 AL031282.1-201ENST00000577672 409 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
PTPRGP23470 MIR4683-201ENST00000579659 81 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
PTPRGP23470 AL132994.2-201ENST00000603120 687 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
PTPRGP23470 AC090515.2-201ENST00000500929 1396 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
PTPRGP23470 MEN1-202ENST00000315422 3148 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
PTPRGP23470 MEF2C-AS1-210ENST00000514011 1754 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
PTPRGP23470 C11orf16-201ENST00000326053 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
PTPRGP23470 LUC7L3-201ENST00000240304 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
PTPRGP23470 CNNM1-201ENST00000356713 5959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
PTPRGP23470 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
PTPRGP23470 SPSB4-201ENST00000310546 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
PTPRGP23470 USP37-202ENST00000338465 1771 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
PTPRGP23470 RPS16-202ENST00000339471 643 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
PTPRGP23470 MUC1-203ENST00000342482 537 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
PTPRGP23470 CNR1-201ENST00000362094 1252 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
PTPRGP23470 CXorf40B-202ENST00000370404 1316 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
PTPRGP23470 GPC5-201ENST00000377067 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
PTPRGP23470 RCL1-204ENST00000381750 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
PTPRGP23470 MRPL23-204ENST00000397297 613 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
PTPRGP23470 BUD31-202ENST00000403633 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
PTPRGP23470 PARVB-203ENST00000404989 1591 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
PTPRGP23470 SUMO1-204ENST00000409181 784 ntTSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
PTPRGP23470 SUMO1-207ENST00000409498 779 ntTSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
PTPRGP23470 SMIM25-203ENST00000425497 2010 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
PTPRGP23470 PRDM5-212ENST00000515109 2259 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
PTPRGP23470 IKBKB-212ENST00000519735 1166 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
PTPRGP23470 AC132192.2-201ENST00000596206 1147 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
PTPRGP23470 AL136295.7-201ENST00000619226 1200 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
PTPRGP23470 SLC12A2-208ENST00000628403 3617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
PTPRGP23470 MCCC1-201ENST00000265594 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
PTPRGP23470 ACYP2-203ENST00000406041 1913 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
PTPRGP23470 COX10-AS1-202ENST00000449363 1944 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
PTPRGP23470 HNF1B-202ENST00000614313 1819 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
PTPRGP23470 RPS6KA1-204ENST00000374168 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
PTPRGP23470 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
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