Protein–RNA interactions for Protein: P12110

COL6A2, Collagen alpha-2(VI) chain, humanhuman

Predictions only

Length 1,019 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL6A2P12110 ADAM22-204ENST00000398204 9334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
COL6A2P12110 MSI2-206ENST00000579180 1635 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
COL6A2P12110 PPP2R5D-208ENST00000485511 3044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
COL6A2P12110 NFATC4-213ENST00000554591 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
COL6A2P12110 MBD1-224ENST00000591416 4905 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
COL6A2P12110 AC004834.1-201ENST00000640784 2412 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
COL6A2P12110 TAF4B-203ENST00000578121 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
COL6A2P12110 RAB3IL1-201ENST00000301773 2125 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
COL6A2P12110 TJP2-212ENST00000636438 4689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
COL6A2P12110 NFATC1-207ENST00000545796 3558 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
COL6A2P12110 C12orf40-202ENST00000405531 1656 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
COL6A2P12110 EIF4E1B-203ENST00000504597 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
COL6A2P12110 PAQR8-202ENST00000442253 4738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
COL6A2P12110 HSD17B6-206ENST00000555159 1525 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
COL6A2P12110 MBD1-205ENST00000353909 2820 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
COL6A2P12110 MAP4K1-203ENST00000586296 1363 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
COL6A2P12110 SLC52A3-201ENST00000217254 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
COL6A2P12110 HSP90B1-201ENST00000299767 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
COL6A2P12110 PITPNC1-203ENST00000580974 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
COL6A2P12110 PNPLA3-203ENST00000423180 2222 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
COL6A2P12110 TRAF6-201ENST00000348124 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
COL6A2P12110 MARS-233ENST00000628866 2583 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
COL6A2P12110 PLD3-201ENST00000356508 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
COL6A2P12110 WRAP53-202ENST00000396463 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
COL6A2P12110 ARIH2-205ENST00000449376 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
COL6A2P12110 AL928654.2-201ENST00000551271 2279 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
COL6A2P12110 LAPTM4A-201ENST00000175091 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
COL6A2P12110 MLKL-201ENST00000306247 1781 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
COL6A2P12110 PCNX2-201ENST00000258229 7518 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
COL6A2P12110 CELA2A-201ENST00000359621 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
COL6A2P12110 STK40-202ENST00000373129 3846 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
COL6A2P12110 HRAS-202ENST00000397594 1099 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
COL6A2P12110 RPL5P21-201ENST00000404620 815 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
COL6A2P12110 HRAS-204ENST00000417302 1233 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
COL6A2P12110 PITPNA-AS1-201ENST00000425081 542 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
COL6A2P12110 FAM41C-202ENST00000432963 504 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
COL6A2P12110 SNHG11-207ENST00000434729 1058 ntTSL 4 BASIC15.63■□□□□ 0.09
COL6A2P12110 HRAS-205ENST00000451590 1151 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
COL6A2P12110 AC079140.1-201ENST00000508039 487 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
COL6A2P12110 GATB-205ENST00000508611 605 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
COL6A2P12110 PFN1-203ENST00000574872 1173 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
COL6A2P12110 ZNF586-205ENST00000598885 578 ntTSL 4 BASIC15.63■□□□□ 0.09
COL6A2P12110 AC091951.1-201ENST00000512854 2465 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
COL6A2P12110 TTBK1-201ENST00000259750 6932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
COL6A2P12110 POLR1D-207ENST00000621089 1606 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
COL6A2P12110 NFE2L1-214ENST00000582155 1998 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
COL6A2P12110 FAM53B-202ENST00000337318 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
COL6A2P12110 RSPH6A-202ENST00000597055 2306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
COL6A2P12110 DIAPH2-204ENST00000373054 3376 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
COL6A2P12110 SLC25A4-201ENST00000281456 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
COL6A2P12110 GNS-201ENST00000258145 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
COL6A2P12110 MON1B-203ENST00000545553 1814 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
COL6A2P12110 SELENOF-208ENST00000616787 1835 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
COL6A2P12110 LIMS2-205ENST00000409455 2500 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
COL6A2P12110 CDH7-203ENST00000536984 3766 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
COL6A2P12110 LIPE-AS1-205ENST00000594688 2383 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
COL6A2P12110 CEP104-202ENST00000378230 6424 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
COL6A2P12110 CLCN2-201ENST00000265593 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
COL6A2P12110 PAM-206ENST00000438793 5432 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
COL6A2P12110 CELP-203ENST00000624767 2414 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
COL6A2P12110 LRCH1-202ENST00000389797 3314 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
COL6A2P12110 DPEP1-202ENST00000393092 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
COL6A2P12110 TAF6-209ENST00000452041 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
COL6A2P12110 SPON1-201ENST00000576479 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
COL6A2P12110 PODN-201ENST00000312553 3010 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
COL6A2P12110 CDH24-202ENST00000397359 3552 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
COL6A2P12110 EGLN1-201ENST00000366641 7097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
COL6A2P12110 THRA-203ENST00000450525 4895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
COL6A2P12110 WDR81-202ENST00000409644 6733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
COL6A2P12110 PACSIN2-201ENST00000263246 3249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
COL6A2P12110 SERPINA3-203ENST00000467132 2660 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
COL6A2P12110 TM4SF4-201ENST00000305354 2101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
COL6A2P12110 MAGEA8-204ENST00000535454 2112 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
COL6A2P12110 MAPT-201ENST00000262410 6762 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
COL6A2P12110 NAXD-202ENST00000424185 2311 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
COL6A2P12110 LINC01250-201ENST00000457478 2344 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
COL6A2P12110 NPM1-201ENST00000296930 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
COL6A2P12110 MAP4K1-210ENST00000591517 2700 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
COL6A2P12110 BET1L-201ENST00000325147 2916 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
COL6A2P12110 AC087289.2-201ENST00000587267 1419 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
COL6A2P12110 SFRP4-201ENST00000436072 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
COL6A2P12110 ARHGEF7-214ENST00000478679 1833 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
COL6A2P12110 CHTF18-205ENST00000455171 3172 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
COL6A2P12110 B4GALNT1-201ENST00000341156 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
COL6A2P12110 PHTF1-202ENST00000369598 3000 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
COL6A2P12110 MALSU1-202ENST00000466681 3044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
COL6A2P12110 PSD4-201ENST00000245796 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
COL6A2P12110 C11orf88-201ENST00000332814 795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
COL6A2P12110 GUK1-210ENST00000391865 990 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
COL6A2P12110 PRSS21-202ENST00000450020 1106 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
COL6A2P12110 RPS3A-212ENST00000514682 985 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
COL6A2P12110 HELT-204ENST00000515777 841 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
COL6A2P12110 AP000275.2-202ENST00000553001 929 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
COL6A2P12110 IL11-202ENST00000585513 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
COL6A2P12110 ZNF773-202ENST00000593916 548 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
COL6A2P12110 LINC00623-204ENST00000617702 746 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
COL6A2P12110 TBC1D25-201ENST00000376771 4042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
COL6A2P12110 TAGLN3-202ENST00000393917 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
COL6A2P12110 IGSF11-209ENST00000491903 1487 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
COL6A2P12110 DUSP11-201ENST00000272444 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.6 ms