Protein–RNA interactions for Protein: P10914

IRF1, Interferon regulatory factor 1, humanhuman

Predictions only

Length 325 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IRF1P10914 CD81-201ENST00000263645 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
IRF1P10914 TUBBP5-201ENST00000290377 1563 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
IRF1P10914 SCRN1-205ENST00000425819 1552 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
IRF1P10914 MAP7-203ENST00000438100 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
IRF1P10914 C1RL-210ENST00000544702 1569 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
IRF1P10914 PDZRN3-201ENST00000263666 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
IRF1P10914 MSI2-204ENST00000442934 1624 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
IRF1P10914 AC136759.1-201ENST00000534201 2163 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
IRF1P10914 PRKCZ-202ENST00000400921 2294 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
IRF1P10914 SHISA5-208ENST00000442747 2250 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
IRF1P10914 MXI1-202ENST00000332674 3470 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
IRF1P10914 ARHGAP39-202ENST00000377307 4673 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
IRF1P10914 UNC5D-203ENST00000416672 3532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
IRF1P10914 NR2C2-201ENST00000323373 2406 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
IRF1P10914 ST6GALNAC6-202ENST00000373141 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
IRF1P10914 SLC8B1-210ENST00000550047 2493 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
IRF1P10914 ELFN1-202ENST00000561626 3742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
IRF1P10914 RPL18A-201ENST00000222247 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
IRF1P10914 ALG5-201ENST00000239891 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
IRF1P10914 PHLDA2-201ENST00000314222 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
IRF1P10914 TSPO-202ENST00000337554 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
IRF1P10914 KCNK7-201ENST00000340313 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
IRF1P10914 DBNDD2-208ENST00000372723 1118 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
IRF1P10914 STK40-202ENST00000373129 3846 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
IRF1P10914 VCX3B-202ENST00000381032 1171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
IRF1P10914 TPSD1-202ENST00000397534 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
IRF1P10914 AL136311.1-206ENST00000416069 899 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
IRF1P10914 AC093151.3-201ENST00000425554 623 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
IRF1P10914 Z98749.2-201ENST00000428294 700 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
IRF1P10914 LINC01784-201ENST00000438401 378 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
IRF1P10914 TTTY23B-201ENST00000442790 549 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
IRF1P10914 AL606760.2-202ENST00000452466 524 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
IRF1P10914 GS1-24F4.2-201ENST00000500823 1110 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
IRF1P10914 AC010327.1-201ENST00000587871 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
IRF1P10914 YIF1B-214ENST00000591784 940 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
IRF1P10914 TMEM261P1-201ENST00000604899 340 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
IRF1P10914 TAF15-205ENST00000603777 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
IRF1P10914 ADD1-205ENST00000398125 4079 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
IRF1P10914 DNAJA3-201ENST00000262375 2763 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
IRF1P10914 GEM-202ENST00000396194 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
IRF1P10914 MDGA1-203ENST00000434837 10736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
IRF1P10914 LCK-201ENST00000333070 2166 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
IRF1P10914 CPA1-201ENST00000011292 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
IRF1P10914 GAS2L3-201ENST00000266754 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
IRF1P10914 GLUD1-201ENST00000277865 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
IRF1P10914 MSC-AS1-208ENST00000522519 1537 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
IRF1P10914 RBM33-205ENST00000392759 1580 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
IRF1P10914 CEACAM16-201ENST00000405314 1583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
IRF1P10914 TDRD6-203ENST00000544460 8887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
IRF1P10914 AC068831.1-204ENST00000501381 1621 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
IRF1P10914 RBPJL-201ENST00000343694 2489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
IRF1P10914 MBD4-203ENST00000429544 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
IRF1P10914 SPINT1-202ENST00000562057 2456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
IRF1P10914 C15orf61-201ENST00000342683 4253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
IRF1P10914 SEMA4C-201ENST00000305476 3545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
IRF1P10914 ISPD-202ENST00000407010 5524 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
IRF1P10914 TC2N-201ENST00000340892 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
IRF1P10914 MIB1-201ENST00000261537 9576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
IRF1P10914 C2orf54-202ENST00000388934 1911 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.21
IRF1P10914 FRA10AC1-201ENST00000359204 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
IRF1P10914 NDRG2-209ENST00000397853 2079 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.21
IRF1P10914 SERINC2-205ENST00000536384 2062 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.21
IRF1P10914 RAP1GAP2-209ENST00000637138 3175 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
IRF1P10914 ZFYVE28-208ENST00000511071 3273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
IRF1P10914 LRRFIP1-201ENST00000244815 4370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
IRF1P10914 AC104809.1-201ENST00000425110 2345 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
IRF1P10914 RELT-201ENST00000064780 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
IRF1P10914 AC025165.1-201ENST00000356672 2355 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
IRF1P10914 PIPOX-201ENST00000323372 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
IRF1P10914 LOXL3-203ENST00000409249 2431 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
IRF1P10914 UBXN1-201ENST00000294119 1291 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
IRF1P10914 OR8S1-201ENST00000310194 1080 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
IRF1P10914 AL513303.2-201ENST00000413339 536 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
IRF1P10914 TMEM14DP-201ENST00000422205 345 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
IRF1P10914 AC114730.3-201ENST00000435195 584 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
IRF1P10914 U91328.1-201ENST00000437528 223 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
IRF1P10914 AC006064.3-201ENST00000537921 477 ntTSL 4 BASIC16.33■□□□□ 0.2
IRF1P10914 AC108134.3-202ENST00000571404 1207 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
IRF1P10914 IL32-235ENST00000613483 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
IRF1P10914 AL033527.5-201ENST00000641382 801 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
IRF1P10914 ABHD11-201ENST00000222800 1483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
IRF1P10914 PDE3A-201ENST00000359062 7576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
IRF1P10914 INA-201ENST00000369849 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
IRF1P10914 EPHX2-202ENST00000517536 1600 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
IRF1P10914 SLC2A4-204ENST00000571308 1768 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
IRF1P10914 BCL11A-201ENST00000335712 5942 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
IRF1P10914 BACE1-211ENST00000528053 4083 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
IRF1P10914 PITPNC1-203ENST00000580974 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
IRF1P10914 BATF2-201ENST00000301887 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
IRF1P10914 SPATS2L-202ENST00000360760 2119 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
IRF1P10914 ZNF398-203ENST00000483892 2121 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
IRF1P10914 AC024909.3-201ENST00000611513 2257 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
IRF1P10914 CBS-202ENST00000359624 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
IRF1P10914 CBSL-203ENST00000618024 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
IRF1P10914 SYBU-231ENST00000533065 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
IRF1P10914 PLEKHA8-205ENST00000449726 7835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
IRF1P10914 ATP6V1C2-201ENST00000272238 1565 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
IRF1P10914 FAM104B-202ENST00000358460 1179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
IRF1P10914 MRPL55-215ENST00000366742 630 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
IRF1P10914 SPAG6-203ENST00000376624 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.6 ms