Protein–RNA interactions for Protein: P0DO97

CCDC192, Coiled-coil domain-containing protein 192, humanhuman

Predictions only

Length 292 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC192P0DO97 PHLDA1-203ENST00000619060 5913 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CCDC192P0DO97 ABCG4-205ENST00000619701 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CCDC192P0DO97 BCAR1-204ENST00000418647 3387 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CCDC192P0DO97 AC007191.1-201ENST00000623179 2995 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
CCDC192P0DO97 LINC00552-201ENST00000625151 2579 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
CCDC192P0DO97 ADRA1A-202ENST00000354550 1765 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CCDC192P0DO97 ZNF561-AS1-204ENST00000587536 1799 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CCDC192P0DO97 FADS1-201ENST00000350997 4525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CCDC192P0DO97 VGLL4-211ENST00000430365 1377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CCDC192P0DO97 COG3-201ENST00000349995 4498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CCDC192P0DO97 ZEB1-AS1-208ENST00000607166 2503 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
CCDC192P0DO97 IL11RA-202ENST00000441545 1700 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CCDC192P0DO97 LPAR1-203ENST00000374431 3637 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CCDC192P0DO97 SLC4A9-203ENST00000506545 2838 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CCDC192P0DO97 SHISA5-219ENST00000612611 1677 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CCDC192P0DO97 YBX2P1-201ENST00000394192 760 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
CCDC192P0DO97 ANKRD54-202ENST00000406423 954 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CCDC192P0DO97 MRPS12-203ENST00000407800 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CCDC192P0DO97 AC009947.1-201ENST00000444350 727 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
CCDC192P0DO97 SUMO2P17-202ENST00000508743 738 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CCDC192P0DO97 RNA5SP416-201ENST00000516838 111 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
CCDC192P0DO97 CD63-210ENST00000550776 870 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CCDC192P0DO97 QPRT-203ENST00000562473 579 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CCDC192P0DO97 NUTF2-206ENST00000569436 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CCDC192P0DO97 AC005256.1-202ENST00000592934 415 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CCDC192P0DO97 SIRT6-202ENST00000337491 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CCDC192P0DO97 MTRF1L-201ENST00000367230 3431 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CCDC192P0DO97 CCDC68-204ENST00000591504 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CCDC192P0DO97 CYP4F3-203ENST00000586182 2338 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CCDC192P0DO97 POU2F2-207ENST00000529067 2657 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CCDC192P0DO97 UBE3A-227ENST00000638011 8742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CCDC192P0DO97 USH1C-207ENST00000527720 2278 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CCDC192P0DO97 SALL3-205ENST00000575389 3996 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CCDC192P0DO97 AL589702.1-201ENST00000641229 1509 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
CCDC192P0DO97 PBX1-215ENST00000559240 2866 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CCDC192P0DO97 SIN3B-202ENST00000379803 5129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CCDC192P0DO97 TOMM70-201ENST00000284320 4409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CCDC192P0DO97 TSG101-204ENST00000536719 2101 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CCDC192P0DO97 TGFB1-201ENST00000221930 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CCDC192P0DO97 ZNF18-201ENST00000322748 2767 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CCDC192P0DO97 KRBOX4-202ENST00000344302 2774 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CCDC192P0DO97 ALOX15-202ENST00000570836 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CCDC192P0DO97 PATZ1-204ENST00000405309 3711 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CCDC192P0DO97 CBWD2-204ENST00000433343 1411 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CCDC192P0DO97 TONSL-203ENST00000613741 1713 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CCDC192P0DO97 NFATC4-204ENST00000424781 5488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CCDC192P0DO97 GGT1-201ENST00000248923 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CCDC192P0DO97 AC093627.6-201ENST00000478759 1365 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CCDC192P0DO97 LRRTM1-201ENST00000295057 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CCDC192P0DO97 PTBP1-201ENST00000349038 3155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CCDC192P0DO97 TRAF7-201ENST00000326181 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CCDC192P0DO97 ETV2-204ENST00000403402 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CCDC192P0DO97 PDZD4-201ENST00000164640 3689 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CCDC192P0DO97 ARHGEF16-203ENST00000378378 3061 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CCDC192P0DO97 GSK3B-201ENST00000264235 7711 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CCDC192P0DO97 TCP10-210ENST00000617120 2182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CCDC192P0DO97 FCN1-201ENST00000371806 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CCDC192P0DO97 TEX30-206ENST00000376032 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CCDC192P0DO97 THAP7-202ENST00000399133 1144 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CCDC192P0DO97 LINC01705-201ENST00000438158 562 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CCDC192P0DO97 AL049569.1-201ENST00000446261 636 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CCDC192P0DO97 URGCP-206ENST00000446958 365 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CCDC192P0DO97 AC004967.1-201ENST00000453589 447 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
CCDC192P0DO97 KRT18P34-201ENST00000488218 1270 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
CCDC192P0DO97 PKD2-202ENST00000502363 1222 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CCDC192P0DO97 AC019257.1-202ENST00000521498 445 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CCDC192P0DO97 FLJ20021-201ENST00000527564 790 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CCDC192P0DO97 CYB561D1-208ENST00000528785 1271 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CCDC192P0DO97 AC027796.2-201ENST00000575326 344 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
CCDC192P0DO97 HEXIM2-207ENST00000592695 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CCDC192P0DO97 AC097376.2-204ENST00000609359 627 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CCDC192P0DO97 SELENOM-210ENST00000611680 689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CCDC192P0DO97 SLCO6A1-205ENST00000506729 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CCDC192P0DO97 NEURL1-201ENST00000369780 4314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CCDC192P0DO97 JPH4-205ENST00000622501 3489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CCDC192P0DO97 NR6A1-205ENST00000487099 7031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CCDC192P0DO97 ADAMTSL1-207ENST00000380566 2321 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CCDC192P0DO97 RSPO1-204ENST00000615459 2331 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CCDC192P0DO97 NPM2-209ENST00000521157 1484 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CCDC192P0DO97 AGT-201ENST00000366667 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CCDC192P0DO97 CALN1-201ENST00000329008 9243 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CCDC192P0DO97 TNIP1-219ENST00000524280 1716 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CCDC192P0DO97 DUOXA1-210ENST00000559014 1965 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CCDC192P0DO97 TAF6-201ENST00000344095 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CCDC192P0DO97 FAM149A-202ENST00000356371 2997 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CCDC192P0DO97 PXN-221ENST00000637617 3246 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CCDC192P0DO97 FAM210A-202ENST00000402563 4240 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CCDC192P0DO97 COCH-203ENST00000460581 2688 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CCDC192P0DO97 CGREF1-205ENST00000404694 1376 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CCDC192P0DO97 MARVELD3-204ENST00000565261 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CCDC192P0DO97 AC073082.1-201ENST00000602369 2103 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CCDC192P0DO97 PVR-203ENST00000403059 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CCDC192P0DO97 HPSE-206ENST00000512196 1571 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CCDC192P0DO97 FAM131A-207ENST00000450976 1335 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CCDC192P0DO97 CAMKK2-211ENST00000538733 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CCDC192P0DO97 MCL1-202ENST00000369026 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CCDC192P0DO97 NDUFA3-201ENST00000303553 379 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CCDC192P0DO97 PCAT6-201ENST00000417262 748 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CCDC192P0DO97 CFL1-202ENST00000524553 860 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CCDC192P0DO97 AC025162.1-201ENST00000554022 565 ntTSL 4 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 64.1 ms