Protein–RNA interactions for Protein: P08F94

PKHD1, Fibrocystin, humanhuman

Predictions only

Length 4,074 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKHD1P08F94 AC135983.1-201ENST00000562108 1097 ntTSL 2 BASIC9.84□□□□□ -0.83
PKHD1P08F94 AC008133.1-201ENST00000584688 557 ntTSL 4 BASIC9.84□□□□□ -0.83
PKHD1P08F94 AC138466.4-201ENST00000623965 852 ntBASIC9.84□□□□□ -0.83
PKHD1P08F94 AC073911.3-201ENST00000624401 631 ntBASIC9.84□□□□□ -0.83
PKHD1P08F94 FP236240.1-204ENST00000624932 712 ntTSL 2 BASIC9.84□□□□□ -0.83
PKHD1P08F94 PKN3-201ENST00000291906 3375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
PKHD1P08F94 ETFA-203ENST00000557943 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
PKHD1P08F94 RPA3-201ENST00000223129 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
PKHD1P08F94 GABRA5-202ENST00000355395 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.84□□□□□ -0.83
PKHD1P08F94 RBCK1-202ENST00000356286 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
PKHD1P08F94 C11orf16-201ENST00000326053 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
PKHD1P08F94 COL9A1-201ENST00000320755 3059 ntTSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
PKHD1P08F94 KSR1-216ENST00000582410 2392 ntTSL 2 BASIC9.84□□□□□ -0.83
PKHD1P08F94 OSCP1-204ENST00000433045 1381 ntTSL 5 BASIC9.84□□□□□ -0.83
PKHD1P08F94 AC144522.1-201ENST00000625111 1658 ntBASIC9.84□□□□□ -0.83
PKHD1P08F94 LGMN-202ENST00000393218 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
PKHD1P08F94 SLC39A13-201ENST00000354884 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
PKHD1P08F94 AQP10-203ENST00000484864 2262 ntTSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
PKHD1P08F94 AC009090.5-201ENST00000624886 2285 ntBASIC9.84□□□□□ -0.83
PKHD1P08F94 RPS9-201ENST00000302907 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
PKHD1P08F94 XXYLT1-AS1-201ENST00000458531 431 ntTSL 3 BASIC9.84□□□□□ -0.83
PKHD1P08F94 RPL18AP3-201ENST00000462885 528 ntBASIC9.84□□□□□ -0.83
PKHD1P08F94 ANXA5-210ENST00000515017 1190 ntTSL 5 BASIC9.84□□□□□ -0.83
PKHD1P08F94 CLNS1A-211ENST00000532069 898 ntTSL 3 BASIC9.84□□□□□ -0.83
PKHD1P08F94 C12orf10-207ENST00000549488 840 ntTSL 5 BASIC9.84□□□□□ -0.83
PKHD1P08F94 UBA52-208ENST00000596304 554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.84□□□□□ -0.83
PKHD1P08F94 NAP1L6-202ENST00000641404 1222 ntBASIC9.84□□□□□ -0.83
PKHD1P08F94 PGR-209ENST00000617858 2816 ntTSL 5 BASIC9.84□□□□□ -0.83
PKHD1P08F94 CDKN1B-201ENST00000228872 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
PKHD1P08F94 TDRKH-204ENST00000368825 2651 ntTSL 2 BASIC9.84□□□□□ -0.83
PKHD1P08F94 AVPR1B-201ENST00000367126 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
PKHD1P08F94 C1orf43-201ENST00000350592 1610 ntTSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
PKHD1P08F94 CLUHP2-201ENST00000426660 1303 ntBASIC9.84□□□□□ -0.83
PKHD1P08F94 C5orf24-204ENST00000504727 2923 ntTSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
PKHD1P08F94 MAP4K1-201ENST00000396857 2653 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.84□□□□□ -0.83
PKHD1P08F94 KNSTRN-201ENST00000249776 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
PKHD1P08F94 HLA-DQB1-204ENST00000399084 1734 ntAPPRIS P1 BASIC9.84□□□□□ -0.83
PKHD1P08F94 IL11RA-202ENST00000441545 1700 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.84□□□□□ -0.83
PKHD1P08F94 SEPT11-206ENST00000505788 2079 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.84□□□□□ -0.83
PKHD1P08F94 DARS-AS1-209ENST00000594219 1420 ntTSL 5 BASIC9.84□□□□□ -0.83
PKHD1P08F94 ARHGAP22-201ENST00000249601 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
PKHD1P08F94 MAGOH-202ENST00000371470 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
PKHD1P08F94 CITED1-202ENST00000373619 886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
PKHD1P08F94 POM121L8P-201ENST00000417732 1281 ntBASIC9.84□□□□□ -0.83
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PKHD1P08F94 POM121L9P-203ENST00000441984 1285 ntBASIC9.84□□□□□ -0.83
PKHD1P08F94 AC113383.1-201ENST00000514696 582 ntTSL 4 BASIC9.84□□□□□ -0.83
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PKHD1P08F94 AC093567.1-201ENST00000590649 877 ntTSL 3 BASIC9.84□□□□□ -0.83
PKHD1P08F94 LINC01002-214ENST00000632102 561 ntTSL 4 BASIC9.84□□□□□ -0.83
PKHD1P08F94 AC104333.4-201ENST00000632866 554 ntTSL 3 BASIC9.84□□□□□ -0.83
PKHD1P08F94 TRPV4-207ENST00000541794 2475 ntTSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
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PKHD1P08F94 CMTM5-202ENST00000342473 725 ntTSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
PKHD1P08F94 CXorf40A-201ENST00000359293 974 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC9.83□□□□□ -0.84
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PKHD1P08F94 NIPAL3-204ENST00000374399 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
PKHD1P08F94 TMEM198B-201ENST00000471276 1958 ntTSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
PKHD1P08F94 GUCA1A-203ENST00000394237 2233 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.83□□□□□ -0.84
PKHD1P08F94 AP1AR-201ENST00000274000 2902 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
PKHD1P08F94 ANKRD30BP2-201ENST00000435744 1610 ntBASIC9.83□□□□□ -0.84
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PKHD1P08F94 TBC1D3J-201ENST00000620719 1426 ntBASIC9.83□□□□□ -0.84
PKHD1P08F94 RWDD4-202ENST00000327570 2590 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC9.83□□□□□ -0.84
PKHD1P08F94 CCDC116-203ENST00000607942 1913 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.83□□□□□ -0.84
PKHD1P08F94 CLPTM1L-209ENST00000507807 1740 ntTSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
PKHD1P08F94 TRPV4-205ENST00000537083 2436 ntTSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
PKHD1P08F94 GAL-201ENST00000265643 818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
PKHD1P08F94 RPAIN-201ENST00000327154 815 ntTSL 2 BASIC9.83□□□□□ -0.84
PKHD1P08F94 OR2K2-202ENST00000374428 1038 ntBASIC9.83□□□□□ -0.84
PKHD1P08F94 RPL3-202ENST00000401609 1289 ntTSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
PKHD1P08F94 ZNF226-203ENST00000413984 716 ntTSL 3 BASIC9.83□□□□□ -0.84
PKHD1P08F94 AP1B1P1-201ENST00000432373 827 ntTSL 3 BASIC9.83□□□□□ -0.84
PKHD1P08F94 IL1R2-203ENST00000441002 1106 ntTSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
PKHD1P08F94 PRSS30P-205ENST00000506153 699 ntTSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
PKHD1P08F94 FAM86B1-218ENST00000534520 808 ntTSL 2 BASIC9.83□□□□□ -0.84
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