Protein–RNA interactions for Protein: O95754

SEMA4F, Semaphorin-4F, humanhuman

Predictions only

Length 770 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEMA4FO95754 DZIP1-203ENST00000361396 7418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SEMA4FO95754 IKBKE-204ENST00000584998 2487 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SEMA4FO95754 TVP23B-201ENST00000307767 2064 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SEMA4FO95754 TPBG-201ENST00000369750 6484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SEMA4FO95754 SMIM25-203ENST00000425497 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SEMA4FO95754 EPM2A-201ENST00000367519 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SEMA4FO95754 PPP1R3G-201ENST00000405617 4907 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SEMA4FO95754 AGRP-201ENST00000290953 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SEMA4FO95754 PEMT-203ENST00000395782 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SEMA4FO95754 KRT18P25-201ENST00000508931 1278 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
SEMA4FO95754 AC090099.4-201ENST00000527671 1027 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SEMA4FO95754 AC090502.1-201ENST00000549905 748 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SEMA4FO95754 AC090502.1-204ENST00000551210 469 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SEMA4FO95754 AL354740.1-203ENST00000593917 424 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SEMA4FO95754 AP005019.2-201ENST00000615104 511 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
SEMA4FO95754 MIR6869-201ENST00000619434 62 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
SEMA4FO95754 AC233723.1-201ENST00000635921 386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SEMA4FO95754 CLMAT3-201ENST00000510576 1973 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
SEMA4FO95754 RASGRF1-202ENST00000419573 6294 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
SEMA4FO95754 PTPN18-201ENST00000175756 3669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
SEMA4FO95754 TSNARE1-201ENST00000307180 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
SEMA4FO95754 CAMK2B-204ENST00000350811 2292 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
SEMA4FO95754 FMNL3-202ENST00000352151 4006 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
SEMA4FO95754 AP2A2-201ENST00000332231 4656 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
SEMA4FO95754 BRD3-201ENST00000303407 5652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
SEMA4FO95754 BX088651.4-201ENST00000435586 2579 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
SEMA4FO95754 NKILA-202ENST00000614771 2598 ntBASIC15.52■□□□□ 0.07
SEMA4FO95754 JADE2-202ENST00000361895 3212 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
SEMA4FO95754 TP73-208ENST00000378295 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
SEMA4FO95754 CDC42BPG-201ENST00000342711 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
SEMA4FO95754 SPAG6-202ENST00000376603 2770 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
SEMA4FO95754 RAB31-207ENST00000578921 4055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
SEMA4FO95754 ACE-202ENST00000290866 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
SEMA4FO95754 AC004233.2-201ENST00000573315 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
SEMA4FO95754 ALOX12-AS1-201ENST00000399540 1730 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SEMA4FO95754 TCOF1-206ENST00000445265 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SEMA4FO95754 SLC9A2-201ENST00000233969 5410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SEMA4FO95754 NR2E1-202ENST00000368986 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SEMA4FO95754 CACNA1A-240ENST00000637432 7809 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SEMA4FO95754 CACNA1A-258ENST00000638029 7814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SEMA4FO95754 AHRR-201ENST00000316418 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SEMA4FO95754 RTN4IP1-201ENST00000369063 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SEMA4FO95754 POLL-217ENST00000628479 1953 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SEMA4FO95754 PCDHA12-202ENST00000613593 2588 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
SEMA4FO95754 EPB41L5-203ENST00000443124 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SEMA4FO95754 SLC9A5-201ENST00000299798 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SEMA4FO95754 TOM1L1-221ENST00000575882 2507 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SEMA4FO95754 HIBCH-201ENST00000359678 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SEMA4FO95754 LOX-206ENST00000639739 1626 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SEMA4FO95754 ZNF623-201ENST00000458270 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SEMA4FO95754 C1orf43-202ENST00000362076 1551 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SEMA4FO95754 MTHFR-217ENST00000641820 1569 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
SEMA4FO95754 STX3-201ENST00000337979 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SEMA4FO95754 POLR2I-201ENST00000221859 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SEMA4FO95754 TMEM239-202ENST00000380585 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SEMA4FO95754 PGGT1BP2-201ENST00000398621 1028 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
SEMA4FO95754 HSPB7-204ENST00000411503 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SEMA4FO95754 AC026954.1-201ENST00000429771 1293 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
SEMA4FO95754 PRAP1-201ENST00000433452 971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SEMA4FO95754 RFPL4A-201ENST00000434937 1035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SEMA4FO95754 GAPDHP40-201ENST00000505218 1006 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
SEMA4FO95754 AP002992.1-201ENST00000527519 491 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SEMA4FO95754 AP006621.2-201ENST00000533938 284 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SEMA4FO95754 FOXN1-203ENST00000579795 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SEMA4FO95754 C19orf70-204ENST00000587950 655 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SEMA4FO95754 UBL5-208ENST00000593087 320 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SEMA4FO95754 AC006453.2-202ENST00000635968 827 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SEMA4FO95754 AC008969.1-201ENST00000550135 6438 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SEMA4FO95754 SLC30A4-201ENST00000261867 7157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SEMA4FO95754 PRKAG1-217ENST00000552212 1497 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SEMA4FO95754 AADAT-201ENST00000337664 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SEMA4FO95754 MAN1C1-203ENST00000374332 4641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SEMA4FO95754 MAN1C1-208ENST00000611903 4647 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SEMA4FO95754 HCN1-201ENST00000303230 9885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SEMA4FO95754 DIP2A-204ENST00000457905 3044 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SEMA4FO95754 LIFR-202ENST00000453190 4253 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SEMA4FO95754 MAGEA2B-201ENST00000331220 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SEMA4FO95754 CACNA1H-206ENST00000565831 7815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SEMA4FO95754 SEPT9-202ENST00000423034 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SEMA4FO95754 KCNJ12-201ENST00000331718 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SEMA4FO95754 CHTOP-203ENST00000368690 2165 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SEMA4FO95754 SYNDIG1L-202ENST00000554823 2420 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SEMA4FO95754 CRK-202ENST00000398970 3675 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SEMA4FO95754 SLC27A5-201ENST00000263093 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SEMA4FO95754 BATF2-201ENST00000301887 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SEMA4FO95754 TOM1L1-201ENST00000348161 1895 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SEMA4FO95754 CCDC110-209ENST00000510617 2592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SEMA4FO95754 CLIP4-201ENST00000320081 4293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SEMA4FO95754 SRRM2-201ENST00000301740 9353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SEMA4FO95754 LMBR1-202ENST00000359422 4727 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SEMA4FO95754 P2RY4-201ENST00000374519 1595 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SEMA4FO95754 ESYT2-206ENST00000613624 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SEMA4FO95754 TMED1-201ENST00000214869 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SEMA4FO95754 CHTOP-201ENST00000368686 2250 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SEMA4FO95754 AC007381.1-201ENST00000457668 2005 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SEMA4FO95754 MLKL-201ENST00000306247 1781 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SEMA4FO95754 EMC4-201ENST00000249209 852 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SEMA4FO95754 AF274855.1-203ENST00000424126 800 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SEMA4FO95754 TMEM107-204ENST00000437139 747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SEMA4FO95754 MIR22HG-212ENST00000577164 931 ntTSL 4 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.6 ms