Protein–RNA interactions for Protein: O94888

UBXN7, UBX domain-containing protein 7, humanhuman

Predictions only

Length 489 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBXN7O94888 PDCD6-212ENST00000614778 1050 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
UBXN7O94888 NEUROD1-201ENST00000295108 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
UBXN7O94888 PRRT4-201ENST00000446477 3544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
UBXN7O94888 AL596087.1-201ENST00000400979 1969 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
UBXN7O94888 ATP6AP2-215ENST00000636409 1962 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
UBXN7O94888 PPP2CA-203ENST00000481195 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
UBXN7O94888 DACH1-203ENST00000619232 2986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
UBXN7O94888 VPS16-203ENST00000380469 2318 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
UBXN7O94888 SLCO5A1-201ENST00000260126 9076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
UBXN7O94888 DISC1-209ENST00000439617 7059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
UBXN7O94888 OXA1L-203ENST00000412791 1440 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
UBXN7O94888 MYH14-210ENST00000601313 6896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
UBXN7O94888 BACE1-211ENST00000528053 4083 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
UBXN7O94888 GPER1-202ENST00000397088 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
UBXN7O94888 PTPN21-201ENST00000328736 6089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
UBXN7O94888 CRH-201ENST00000276571 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
UBXN7O94888 HNF1A-215ENST00000615446 2344 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
UBXN7O94888 POLG2-201ENST00000539111 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
UBXN7O94888 PSMD13-212ENST00000532097 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
UBXN7O94888 GDF2-201ENST00000581492 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
UBXN7O94888 BTC-201ENST00000395743 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
UBXN7O94888 FAM109A-203ENST00000547838 2846 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC15.33■□□□□ 0.04
UBXN7O94888 COQ8B-202ENST00000324464 2443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
UBXN7O94888 CCDC187-205ENST00000638797 10126 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
UBXN7O94888 CTD-2194D22.4-201ENST00000514569 1635 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
UBXN7O94888 C11orf24-201ENST00000304271 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
UBXN7O94888 SYBU-209ENST00000446070 2919 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
UBXN7O94888 KCNQ2-209ENST00000625514 2925 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
UBXN7O94888 DMAC2-201ENST00000221943 1692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
UBXN7O94888 G6PD-203ENST00000393564 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
UBXN7O94888 SS18L2-201ENST00000011691 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
UBXN7O94888 CLCNKB-201ENST00000375667 2129 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
UBXN7O94888 TMEM26-AS1-201ENST00000389640 863 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
UBXN7O94888 MAGEC1-202ENST00000406005 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
UBXN7O94888 AL807752.4-201ENST00000439076 580 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
UBXN7O94888 NME4-207ENST00000450036 985 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
UBXN7O94888 AL391069.3-201ENST00000455503 618 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
UBXN7O94888 RN7SL752P-201ENST00000463779 287 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
UBXN7O94888 HHEX-203ENST00000492654 808 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
UBXN7O94888 RAB26-202ENST00000541451 944 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
UBXN7O94888 CD4-210ENST00000541982 1187 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
UBXN7O94888 WASH4P-201ENST00000564273 1246 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
UBXN7O94888 MALAT1-213ENST00000618227 593 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
UBXN7O94888 NOVA2-201ENST00000263257 7803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
UBXN7O94888 SLC6A9-204ENST00000372307 2162 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
UBXN7O94888 EPN1-203ENST00000411543 2621 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
UBXN7O94888 CRYZL1-202ENST00000361534 2224 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
UBXN7O94888 TOR4A-201ENST00000357503 4148 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
UBXN7O94888 FDX1-201ENST00000260270 3206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
UBXN7O94888 KIAA0368-201ENST00000259335 7391 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
UBXN7O94888 DYRK3-201ENST00000367106 2329 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
UBXN7O94888 ST6GALNAC6-216ENST00000622357 2396 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
UBXN7O94888 MAGEA2B-201ENST00000331220 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
UBXN7O94888 TNIP1-202ENST00000389378 2935 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
UBXN7O94888 AKAP12-201ENST00000253332 6597 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
UBXN7O94888 PARVB-210ENST00000619710 1530 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
UBXN7O94888 AC004233.2-201ENST00000573315 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
UBXN7O94888 LENG8-208ENST00000610347 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
UBXN7O94888 TBC1D3D-201ENST00000616101 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
UBXN7O94888 TBC1D3K-201ENST00000620247 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
UBXN7O94888 PHTF1-205ENST00000393357 3244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
UBXN7O94888 AC132872.4-202ENST00000622924 2756 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
UBXN7O94888 EWSR1-201ENST00000331029 2267 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
UBXN7O94888 TRMT1-203ENST00000437766 2263 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
UBXN7O94888 ZFP28-201ENST00000301318 4096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
UBXN7O94888 NAGK-208ENST00000455662 1778 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
UBXN7O94888 TMC7-201ENST00000304381 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
UBXN7O94888 DCLK2-201ENST00000296550 4265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
UBXN7O94888 BTN3A1-204ENST00000425234 1882 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
UBXN7O94888 VILL-207ENST00000465644 1857 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
UBXN7O94888 PTPRO-202ENST00000348962 5061 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
UBXN7O94888 EEF1B2-201ENST00000236957 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
UBXN7O94888 AC074338.1-201ENST00000416825 156 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
UBXN7O94888 AL161638.1-201ENST00000420354 481 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
UBXN7O94888 ZMYND10-AS1-201ENST00000440013 250 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
UBXN7O94888 AC011495.1-201ENST00000498085 584 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
UBXN7O94888 AC095060.1-201ENST00000502455 549 ntTSL 4 BASIC15.32■□□□□ 0.04
UBXN7O94888 LINC00824-206ENST00000523173 920 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
UBXN7O94888 COMMD4-217ENST00000567195 677 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
UBXN7O94888 NOP16-209ENST00000618911 1087 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
UBXN7O94888 PCSK6-221ENST00000632686 1210 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
UBXN7O94888 LZTR1-201ENST00000215739 4572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
UBXN7O94888 FOLH1-201ENST00000256999 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
UBXN7O94888 DZANK1-202ENST00000329494 1389 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
UBXN7O94888 CALM3-212ENST00000599839 1355 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
UBXN7O94888 AL365203.3-201ENST00000609742 2057 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
UBXN7O94888 SYVN1-202ENST00000307289 2841 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
UBXN7O94888 CHST14-201ENST00000306243 3574 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
UBXN7O94888 SERPINF2-203ENST00000450523 1462 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
UBXN7O94888 ARHGEF25-202ENST00000333972 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
UBXN7O94888 KRT73-201ENST00000305748 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
UBXN7O94888 EIF4E1B-203ENST00000504597 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
UBXN7O94888 FUS-201ENST00000254108 5119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
UBXN7O94888 SIKE1-203ENST00000369528 5506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
UBXN7O94888 CACFD1-202ENST00000316948 2794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
UBXN7O94888 UBR5-207ENST00000520539 10297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
UBXN7O94888 ELAVL3-201ENST00000359227 4729 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
UBXN7O94888 INTS4P1-202ENST00000587624 2985 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
UBXN7O94888 FRMD5-202ENST00000417257 5011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
UBXN7O94888 SOX14-201ENST00000306087 2055 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.5 ms