Protein–RNA interactions for Protein: O75563

SKAP2, Src kinase-associated phosphoprotein 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 359 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SKAP2O75563 PTPA-205ENST00000357197 2653 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
SKAP2O75563 THEMIS2-202ENST00000373921 2687 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
SKAP2O75563 LINC00926-201ENST00000501726 2530 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
SKAP2O75563 MLLT10-201ENST00000307729 5032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SKAP2O75563 EDIL3-201ENST00000296591 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SKAP2O75563 OR2I1P-210ENST00000642037 4691 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
SKAP2O75563 PAX3-206ENST00000392070 2258 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SKAP2O75563 DHX40-202ENST00000425628 2255 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
SKAP2O75563 ARIH2-205ENST00000449376 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SKAP2O75563 FLAD1-201ENST00000292180 2160 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SKAP2O75563 ZNF135-202ENST00000359978 2120 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
SKAP2O75563 SLC4A3-202ENST00000317151 4069 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
SKAP2O75563 FBXO44-204ENST00000376762 1734 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SKAP2O75563 FAM198B-203ENST00000585682 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SKAP2O75563 PDE9A-205ENST00000349112 1616 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SKAP2O75563 SLC4A11-202ENST00000380059 3229 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
SKAP2O75563 SLC25A35-205ENST00000580340 1541 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SKAP2O75563 SPECC1-202ENST00000395522 2982 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SKAP2O75563 PHLDA1-203ENST00000619060 5913 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SKAP2O75563 AC099521.3-201ENST00000624251 2938 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
SKAP2O75563 URAHP-203ENST00000517889 1381 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SKAP2O75563 UBE2D1-204ENST00000615793 2621 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
SKAP2O75563 SFTPC-201ENST00000318561 997 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SKAP2O75563 YIF1B-203ENST00000339413 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SKAP2O75563 MRPL9-202ENST00000368830 1296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SKAP2O75563 FNDC11-202ENST00000370098 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SKAP2O75563 HUS1B-201ENST00000380907 1025 ntAPPRIS P1 BASIC15.8■□□□□ 0.12
SKAP2O75563 IGKV4-1-201ENST00000390243 538 ntAPPRIS P1 BASIC15.8■□□□□ 0.12
SKAP2O75563 HAUS4P1-201ENST00000406739 1145 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
SKAP2O75563 LINC02247-201ENST00000417135 743 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
SKAP2O75563 TSPAN32-207ENST00000451520 1236 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
SKAP2O75563 CXCL1P1-201ENST00000502804 216 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
SKAP2O75563 BAX-213ENST00000539787 458 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SKAP2O75563 BMF-207ENST00000559701 630 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
SKAP2O75563 ZFPM1-203ENST00000562437 502 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
SKAP2O75563 SLC9A3-AS1-204ENST00000606288 791 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
SKAP2O75563 PTPRN-201ENST00000295718 3784 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SKAP2O75563 PELP1-212ENST00000574876 3465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SKAP2O75563 KRAS-202ENST00000311936 5765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SKAP2O75563 TMPRSS6-201ENST00000346753 3197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SKAP2O75563 MAP7-204ENST00000454590 3119 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
SKAP2O75563 UBXN2B-201ENST00000399598 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SKAP2O75563 PSMF1-201ENST00000246015 2042 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
SKAP2O75563 DEPDC7-202ENST00000311388 2012 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SKAP2O75563 ARHGAP11B-210ENST00000622744 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SKAP2O75563 SLC25A21-AS1-201ENST00000556667 1924 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
SKAP2O75563 ZBTB20-215ENST00000481632 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SKAP2O75563 WDR24-201ENST00000248142 2763 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
SKAP2O75563 NRDC-201ENST00000352171 3691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SKAP2O75563 LINC00391-201ENST00000433569 1844 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
SKAP2O75563 PLA2G3-201ENST00000215885 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SKAP2O75563 WDR97-201ENST00000323662 6916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
SKAP2O75563 MMADHC-203ENST00000428879 1726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
SKAP2O75563 MIR600HG-201ENST00000449175 5984 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
SKAP2O75563 OPRL1-201ENST00000336866 3321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SKAP2O75563 FDFT1-223ENST00000615631 2462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SKAP2O75563 MSI2-204ENST00000442934 1624 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SKAP2O75563 LIMD2-201ENST00000259006 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SKAP2O75563 AP1M1-202ENST00000429941 1578 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SKAP2O75563 FUT3-209ENST00000589918 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SKAP2O75563 GPR68-203ENST00000531499 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SKAP2O75563 MPP2-208ENST00000520305 2111 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SKAP2O75563 ENDOV-204ENST00000518137 2815 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SKAP2O75563 ABHD3-201ENST00000289119 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SKAP2O75563 AC100861.1-202ENST00000500853 1970 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SKAP2O75563 WDR77-201ENST00000235090 2576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SKAP2O75563 SMARCD2-202ENST00000323347 1935 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SKAP2O75563 PIH1D1-201ENST00000262265 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SKAP2O75563 TBC1D7-201ENST00000343141 1027 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SKAP2O75563 ODF3B-204ENST00000405135 917 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SKAP2O75563 RFXANK-203ENST00000407360 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SKAP2O75563 FAM197Y8-203ENST00000450145 560 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
SKAP2O75563 AL513480.1-201ENST00000451731 511 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
SKAP2O75563 LINC01293-201ENST00000453951 1266 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SKAP2O75563 NAA60-217ENST00000572942 1089 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SKAP2O75563 AC008878.2-201ENST00000601870 942 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SKAP2O75563 LINC01128-210ENST00000609139 455 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SKAP2O75563 SSBP1-215ENST00000612337 884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SKAP2O75563 AC117500.6-201ENST00000624871 588 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
SKAP2O75563 MAP2K3-215ENST00000627447 351 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SKAP2O75563 GLMP-214ENST00000614643 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SKAP2O75563 PLAGL1-201ENST00000354765 3663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SKAP2O75563 ABCG1-205ENST00000398449 2998 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SKAP2O75563 GLIDR-204ENST00000638724 1765 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SKAP2O75563 CCDC22-201ENST00000376227 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SKAP2O75563 CYP4F3-203ENST00000586182 2338 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SKAP2O75563 TAPBPL-201ENST00000266556 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SKAP2O75563 PCSK2-205ENST00000536609 2275 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SKAP2O75563 LAPTM5-201ENST00000294507 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SKAP2O75563 FAM156A-206ENST00000612915 2233 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SKAP2O75563 GALNT3-201ENST00000392701 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SKAP2O75563 ABCC1-201ENST00000399408 6594 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SKAP2O75563 ABCC1-202ENST00000399410 6552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SKAP2O75563 ARHGAP10-201ENST00000336498 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SKAP2O75563 APLP2-203ENST00000338167 3270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SKAP2O75563 SCYL1-205ENST00000524944 2715 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SKAP2O75563 CCNF-202ENST00000397066 4283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SKAP2O75563 SLCO2B1-205ENST00000525650 2121 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SKAP2O75563 ZNF782-205ENST00000481138 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SKAP2O75563 RCOR1-201ENST00000262241 5754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59.1 ms