Protein–RNA interactions for Protein: O43189

PHF1, PHD finger protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 567 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHF1O43189 CCHCR1-202ENST00000396263 2490 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
PHF1O43189 GFOD1-206ENST00000612338 2481 ntTSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
PHF1O43189 GUCD1-203ENST00000404664 1606 ntTSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
PHF1O43189 HAUS3-204ENST00000506763 3166 ntTSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
PHF1O43189 AC008677.1-201ENST00000519230 1561 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
PHF1O43189 SNHG15-202ENST00000577700 3116 ntTSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
PHF1O43189 PTBP1-202ENST00000350092 3069 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
PHF1O43189 NQO2-201ENST00000338130 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
PHF1O43189 HLA-B-249ENST00000412585 1547 ntAPPRIS P1 BASIC13.75□□□□□ -0.21
PHF1O43189 MRI1-202ENST00000319545 3027 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
PHF1O43189 AC239800.3-201ENST00000424684 5243 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
PHF1O43189 PDXDC1-204ENST00000455313 2183 ntTSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
PHF1O43189 ARHGEF7-204ENST00000375736 5032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
PHF1O43189 KRT8P39-201ENST00000396270 1433 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
PHF1O43189 SGSH-201ENST00000326317 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
PHF1O43189 MARVELD3-204ENST00000565261 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
PHF1O43189 AC092198.1-201ENST00000447651 2691 ntTSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
PHF1O43189 AC073347.1-201ENST00000421633 2643 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
PHF1O43189 SLC12A9-201ENST00000354161 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
PHF1O43189 DHFR-201ENST00000439211 3917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
PHF1O43189 TTC28-AS1-207ENST00000428584 5859 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
PHF1O43189 ARL15-201ENST00000502271 3248 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
PHF1O43189 CABP2-201ENST00000294288 925 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
PHF1O43189 ITGA9-AS1-201ENST00000366441 895 ntTSL 3 BASIC13.75□□□□□ -0.21
PHF1O43189 C9orf24-204ENST00000379127 596 ntTSL 3 BASIC13.75□□□□□ -0.21
PHF1O43189 AC108047.1-201ENST00000457407 404 ntTSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
PHF1O43189 CCDC25-209ENST00000522915 785 ntTSL 3 BASIC13.75□□□□□ -0.21
PHF1O43189 EEF1D-207ENST00000524624 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
PHF1O43189 ZNF606-202ENST00000546715 636 ntTSL 4 BASIC13.75□□□□□ -0.21
PHF1O43189 LINC01225-203ENST00000563550 1244 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
PHF1O43189 AC138474.1-201ENST00000586630 523 ntTSL 3 BASIC13.75□□□□□ -0.21
PHF1O43189 MZF1-202ENST00000594108 1110 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
PHF1O43189 AC090241.2-202ENST00000602333 633 ntTSL 3 BASIC13.75□□□□□ -0.21
PHF1O43189 SBK3-202ENST00000612221 1270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
PHF1O43189 LINGO1-201ENST00000355300 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
PHF1O43189 MARCO-201ENST00000327097 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
PHF1O43189 PIPOX-201ENST00000323372 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
PHF1O43189 RFPL2-203ENST00000400237 2407 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
PHF1O43189 NPHP4-211ENST00000622020 3004 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
PHF1O43189 ZNF367-201ENST00000375256 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
PHF1O43189 SCNN1A-221ENST00000543768 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
PHF1O43189 AC097376.2-205ENST00000610159 5334 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
PHF1O43189 FUNDC2-201ENST00000369498 6455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
PHF1O43189 PYCR2-201ENST00000343818 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
PHF1O43189 MANSC1-201ENST00000396349 2220 ntTSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
PHF1O43189 PPHLN1-204ENST00000358314 1643 ntTSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
PHF1O43189 AMT-233ENST00000636522 1620 ntTSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
PHF1O43189 R3HDM2-201ENST00000347140 4331 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
PHF1O43189 GAS2L2-201ENST00000604063 2661 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
PHF1O43189 KDM2B-201ENST00000377069 5224 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
PHF1O43189 CDK16-202ENST00000357227 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
PHF1O43189 CDK18-201ENST00000360066 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
PHF1O43189 TMPRSS4-201ENST00000437212 2074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
PHF1O43189 GPSM1-205ENST00000440944 3633 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
PHF1O43189 NDUFV1-216ENST00000529927 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
PHF1O43189 LINC01529-205ENST00000637365 2000 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
PHF1O43189 C9orf139-202ENST00000623196 4990 ntTSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
PHF1O43189 TMPO-203ENST00000343315 2465 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
PHF1O43189 ZNF114-204ENST00000595607 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
PHF1O43189 AC019205.2-202ENST00000441363 2403 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
PHF1O43189 ARF6-201ENST00000298316 3865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
PHF1O43189 ULK4-203ENST00000420927 1904 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
PHF1O43189 SBSN-201ENST00000452271 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
PHF1O43189 UBE3B-202ENST00000342494 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
PHF1O43189 H2BFM-201ENST00000355016 1882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
PHF1O43189 TDG-209ENST00000544861 1387 ntTSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
PHF1O43189 MTA3-203ENST00000406652 5484 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
PHF1O43189 TRIM46-203ENST00000368383 2666 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
PHF1O43189 FP565260.3-204ENST00000623795 2238 ntTSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
PHF1O43189 SNHG18-201ENST00000508179 1799 ntTSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
PHF1O43189 CDSN-202ENST00000376288 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
PHF1O43189 ERCC1-201ENST00000013807 1278 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
PHF1O43189 ATP6V0B-201ENST00000236067 944 ntTSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
PHF1O43189 SYCE1-202ENST00000343131 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
PHF1O43189 CYP4B1-203ENST00000371923 2110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
PHF1O43189 TNNT3-204ENST00000381558 1258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
PHF1O43189 MAPK15-202ENST00000395107 834 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
PHF1O43189 AC124057.1-201ENST00000433035 404 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
PHF1O43189 TTC28-AS1-213ENST00000434221 972 ntTSL 3 BASIC13.74□□□□□ -0.21
PHF1O43189 RPSAP31-202ENST00000445165 716 ntTSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
PHF1O43189 ATP6V0B-211ENST00000498664 825 ntTSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
PHF1O43189 LINC01089-211ENST00000543334 1282 ntTSL 4 BASIC13.74□□□□□ -0.21
PHF1O43189 SLC8B1-206ENST00000549069 1058 ntTSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
PHF1O43189 TUBB3-203ENST00000553967 736 ntTSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
PHF1O43189 EMC4-203ENST00000557879 1009 ntTSL 3 BASIC13.74□□□□□ -0.21
PHF1O43189 AC004233.3-201ENST00000607794 1269 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
PHF1O43189 AC009118.2-201ENST00000613275 655 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
PHF1O43189 AC008267.7-201ENST00000624570 1194 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
PHF1O43189 NR3C1-203ENST00000394464 6795 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
PHF1O43189 MBD1-222ENST00000590208 2913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
PHF1O43189 NECAP2-201ENST00000337132 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
PHF1O43189 AL031731.1-201ENST00000642131 2094 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
PHF1O43189 ABLIM2-202ENST00000361581 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
PHF1O43189 SPATC1-201ENST00000377470 2007 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
PHF1O43189 AC091100.1-201ENST00000558424 2354 ntTSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
PHF1O43189 NF2-205ENST00000361452 5884 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
PHF1O43189 NIM1K-201ENST00000326035 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
PHF1O43189 GINS2-201ENST00000253462 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
PHF1O43189 RFK-201ENST00000376736 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
PHF1O43189 SDCBP2-202ENST00000360779 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
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