Protein–RNA interactions for Protein: O15056

SYNJ2, Synaptojanin-2, humanhuman

Predictions only

Length 1,496 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYNJ2O15056 RAI14-201ENST00000265109 5092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
SYNJ2O15056 CRTC1-201ENST00000321949 2501 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
SYNJ2O15056 DISC1-204ENST00000366633 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
SYNJ2O15056 DISC1-214ENST00000539444 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
SYNJ2O15056 AL627231.1-201ENST00000394467 1125 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
SYNJ2O15056 AL365295.1-203ENST00000435322 566 ntTSL 4 BASIC24.85■■□□□ 1.57
SYNJ2O15056 AL139008.1-201ENST00000437894 228 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
SYNJ2O15056 MEF2C-AS2-201ENST00000510274 463 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
SYNJ2O15056 RPS25-202ENST00000527673 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
SYNJ2O15056 AL132642.1-201ENST00000557646 553 ntTSL 4 BASIC24.85■■□□□ 1.57
SYNJ2O15056 AC009264.1-206ENST00000592183 534 ntTSL 4 BASIC24.85■■□□□ 1.57
SYNJ2O15056 FAM236A-201ENST00000593662 453 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
SYNJ2O15056 FAM236B-201ENST00000596535 465 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
SYNJ2O15056 AC002472.3-201ENST00000640124 621 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
SYNJ2O15056 TTLL12-201ENST00000216129 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
SYNJ2O15056 STRADA-254ENST00000640999 2336 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
SYNJ2O15056 PUDP-202ENST00000412827 1376 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
SYNJ2O15056 AC006449.6-201ENST00000612330 2296 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
SYNJ2O15056 PCDHA8-201ENST00000378123 2616 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
SYNJ2O15056 NEFHP1-201ENST00000412845 2629 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
SYNJ2O15056 ETV3-201ENST00000326786 1539 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
SYNJ2O15056 SLC35A3-217ENST00000639807 2767 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
SYNJ2O15056 CRYZL1-202ENST00000361534 2224 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
SYNJ2O15056 RNASE1-202ENST00000397967 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
SYNJ2O15056 DYDC2-202ENST00000372197 2022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
SYNJ2O15056 C8orf33-201ENST00000331434 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
SYNJ2O15056 TMEM198B-201ENST00000471276 1958 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
SYNJ2O15056 SERPINE3-201ENST00000400389 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
SYNJ2O15056 AL356056.1-201ENST00000437899 369 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
SYNJ2O15056 FAM58BP-201ENST00000439056 645 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
SYNJ2O15056 IMPA1-203ENST00000449740 1180 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
SYNJ2O15056 LINC00322-201ENST00000450205 699 ntTSL 3 BASIC24.84■■□□□ 1.57
SYNJ2O15056 HS3ST3A1-202ENST00000578576 750 ntTSL 3 BASIC24.84■■□□□ 1.57
SYNJ2O15056 ZNF586-204ENST00000598183 603 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
SYNJ2O15056 AC020916.1-201ENST00000587762 1774 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
SYNJ2O15056 SLFNL1-203ENST00000372611 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
SYNJ2O15056 KLHL24-201ENST00000242810 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
SYNJ2O15056 MAGEA9-201ENST00000243314 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
SYNJ2O15056 ADAM6-201ENST00000606026 1843 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
SYNJ2O15056 RCL1-204ENST00000381750 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
SYNJ2O15056 WDR45-224ENST00000485908 1301 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
SYNJ2O15056 CKMT1B-201ENST00000300283 1779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
SYNJ2O15056 CKMT1A-204ENST00000434505 1779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
SYNJ2O15056 AL022326.1-201ENST00000434516 1778 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
SYNJ2O15056 ACSF2-201ENST00000300441 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
SYNJ2O15056 SH2D3C-205ENST00000420366 2682 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
SYNJ2O15056 ZSCAN10-201ENST00000252463 2463 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
SYNJ2O15056 ADAMTSL1-204ENST00000380545 1562 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
SYNJ2O15056 OSBPL1A-203ENST00000399441 1887 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
SYNJ2O15056 RPL18AP3-201ENST00000462885 528 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
SYNJ2O15056 AC138230.1-201ENST00000525893 664 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
SYNJ2O15056 AC005726.2-204ENST00000577790 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC24.83■■□□□ 1.57
SYNJ2O15056 AC004637.1-201ENST00000586675 482 ntTSL 3 BASIC24.83■■□□□ 1.57
SYNJ2O15056 AC005632.3-201ENST00000605544 308 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
SYNJ2O15056 AP000229.1-202ENST00000609365 559 ntTSL 4 BASIC24.83■■□□□ 1.57
SYNJ2O15056 ALKBH2-208ENST00000619381 895 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
SYNJ2O15056 ARFRP1-213ENST00000619493 2456 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.83■■□□□ 1.57
SYNJ2O15056 ZNF503-201ENST00000372524 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
SYNJ2O15056 SNX18-203ENST00000381410 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
SYNJ2O15056 LGMN-202ENST00000393218 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
SYNJ2O15056 CTSA-202ENST00000354880 1820 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
SYNJ2O15056 GFRA2-204ENST00000518077 1503 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
SYNJ2O15056 FOXO4-201ENST00000341558 1353 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
SYNJ2O15056 MTHFD2L-203ENST00000395759 2354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
SYNJ2O15056 ODF2-204ENST00000372814 2249 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
SYNJ2O15056 MMP9-201ENST00000372330 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
SYNJ2O15056 MGAT5B-201ENST00000301618 4486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
SYNJ2O15056 CDKN1A-204ENST00000448526 2104 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.83■■□□□ 1.57
SYNJ2O15056 DDOST-206ENST00000602624 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
SYNJ2O15056 FKBP6-204ENST00000431982 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.56
SYNJ2O15056 ARHGEF7-214ENST00000478679 1833 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.56
SYNJ2O15056 SUSD2-201ENST00000358321 3404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
SYNJ2O15056 IL23A-201ENST00000228534 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
SYNJ2O15056 MAP2K3-201ENST00000316920 1246 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.56
SYNJ2O15056 AC239868.1-201ENST00000369385 493 ntBASIC24.83■■□□□ 1.56
SYNJ2O15056 PIN4P1-201ENST00000451079 396 ntBASIC24.83■■□□□ 1.56
SYNJ2O15056 AC130709.1-201ENST00000484779 1212 ntBASIC24.83■■□□□ 1.56
SYNJ2O15056 DUX4L46-201ENST00000566845 751 ntBASIC24.83■■□□□ 1.56
SYNJ2O15056 SMIM24-203ENST00000587847 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
SYNJ2O15056 UBA52-208ENST00000596304 554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.56
SYNJ2O15056 HIST2H2BB-202ENST00000609585 563 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.56
SYNJ2O15056 CERS5-203ENST00000422340 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.56
SYNJ2O15056 METTL17-221ENST00000556670 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
SYNJ2O15056 EXT2-202ENST00000358681 2997 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
SYNJ2O15056 PKN1-201ENST00000242783 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
SYNJ2O15056 CREB3L1-206ENST00000621158 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
SYNJ2O15056 LARGE2-201ENST00000325468 2522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
SYNJ2O15056 CACTIN-201ENST00000221899 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
SYNJ2O15056 CTSW-204ENST00000528419 1341 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
SYNJ2O15056 SBK1-201ENST00000341901 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
SYNJ2O15056 GBGT1-204ENST00000372043 1935 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
SYNJ2O15056 PPP1R15A-201ENST00000200453 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
SYNJ2O15056 ZNF131-206ENST00000505606 3209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
SYNJ2O15056 CRYBB1-201ENST00000215939 1102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
SYNJ2O15056 PPIE-202ENST00000356511 1079 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
SYNJ2O15056 SERF2-206ENST00000409291 807 ntTSL 3 BASIC24.82■■□□□ 1.56
SYNJ2O15056 LINC01388-201ENST00000416242 416 ntTSL 3 BASIC24.82■■□□□ 1.56
SYNJ2O15056 IDS-203ENST00000428056 1213 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
SYNJ2O15056 AC078875.1-201ENST00000431907 724 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
SYNJ2O15056 AL139412.1-202ENST00000452465 675 ntTSL 3 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 70 ms