Protein–RNA interactions for Protein: G5E9R7

KRTAP4-16, HCG2042993, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 235 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRTAP4-16G5E9R7 KCNMA1-219ENST00000480683 2963 ntTSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
KRTAP4-16G5E9R7 KIAA0930-215ENST00000496226 589 ntTSL 5 BASIC9.75□□□□□ -0.85
KRTAP4-16G5E9R7 AGGF1-204ENST00000506806 1142 ntTSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
KRTAP4-16G5E9R7 RARRES2P9-201ENST00000565168 469 ntBASIC9.75□□□□□ -0.85
KRTAP4-16G5E9R7 CMC2-214ENST00000565925 640 ntTSL 5 BASIC9.75□□□□□ -0.85
KRTAP4-16G5E9R7 SPDYE9P-201ENST00000570642 692 ntBASIC9.75□□□□□ -0.85
KRTAP4-16G5E9R7 TYROBP-205ENST00000585901 620 ntTSL 3 BASIC9.75□□□□□ -0.85
KRTAP4-16G5E9R7 TNNT1-211ENST00000588426 683 ntTSL 5 BASIC9.75□□□□□ -0.85
KRTAP4-16G5E9R7 SPIB-207ENST00000597855 564 ntTSL 4 BASIC9.75□□□□□ -0.85
KRTAP4-16G5E9R7 AC140113.2-201ENST00000604370 208 ntBASIC9.75□□□□□ -0.85
KRTAP4-16G5E9R7 AL512343.2-201ENST00000609423 490 ntTSL 2 BASIC9.75□□□□□ -0.85
KRTAP4-16G5E9R7 AC027601.4-201ENST00000611259 610 ntBASIC9.75□□□□□ -0.85
KRTAP4-16G5E9R7 SPDYE10P-202ENST00000612005 668 ntBASIC9.75□□□□□ -0.85
KRTAP4-16G5E9R7 SPDYE8P-202ENST00000612377 668 ntBASIC9.75□□□□□ -0.85
KRTAP4-16G5E9R7 LAMTOR5-208ENST00000614544 846 ntTSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
KRTAP4-16G5E9R7 LINC00623-204ENST00000617702 746 ntTSL 5 BASIC9.75□□□□□ -0.85
KRTAP4-16G5E9R7 HNRNPH1-250ENST00000630639 123 ntTSL 5 BASIC9.75□□□□□ -0.85
KRTAP4-16G5E9R7 COLCA2-206ENST00000638573 1080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
KRTAP4-16G5E9R7 EXOC6B-209ENST00000634650 2583 ntTSL 5 BASIC9.75□□□□□ -0.85
KRTAP4-16G5E9R7 DDX19B-203ENST00000393657 1717 ntTSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
KRTAP4-16G5E9R7 GRK6P1-201ENST00000400595 1711 ntBASIC9.75□□□□□ -0.85
KRTAP4-16G5E9R7 AGAP4-208ENST00000618171 2387 ntTSL 5 BASIC9.75□□□□□ -0.85
KRTAP4-16G5E9R7 PLIN3-202ENST00000585479 1535 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
KRTAP4-16G5E9R7 CARD10-201ENST00000251973 3934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
KRTAP4-16G5E9R7 PHF12-205ENST00000577226 7679 ntTSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
KRTAP4-16G5E9R7 SLC25A37-206ENST00000519973 4823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
KRTAP4-16G5E9R7 ZBTB7C-201ENST00000535628 4818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
KRTAP4-16G5E9R7 C11orf71-202ENST00000623205 1980 ntAPPRIS ALT2 BASIC9.75□□□□□ -0.85
KRTAP4-16G5E9R7 MTDH-201ENST00000336273 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
KRTAP4-16G5E9R7 PNRC1-202ENST00000354922 1345 ntTSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
KRTAP4-16G5E9R7 CLN3-216ENST00000565316 1318 ntTSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
KRTAP4-16G5E9R7 UBAC2-AS1-201ENST00000426037 1771 ntTSL 2 BASIC9.75□□□□□ -0.85
KRTAP4-16G5E9R7 PTBP1-203ENST00000356948 3598 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
KRTAP4-16G5E9R7 GRAMD2B-201ENST00000285689 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
KRTAP4-16G5E9R7 CICP14-201ENST00000629111 2732 ntBASIC9.75□□□□□ -0.85
KRTAP4-16G5E9R7 MCM3AP-AS1-203ENST00000421927 2280 ntTSL 2 BASIC9.75□□□□□ -0.85
KRTAP4-16G5E9R7 TRMT1-203ENST00000437766 2263 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
KRTAP4-16G5E9R7 CTSA-202ENST00000354880 1820 ntTSL 2 BASIC9.75□□□□□ -0.85
KRTAP4-16G5E9R7 CPA5-202ENST00000431780 1803 ntTSL 2 BASIC9.75□□□□□ -0.85
KRTAP4-16G5E9R7 AL355493.2-201ENST00000568270 1395 ntTSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
KRTAP4-16G5E9R7 FAM228B-210ENST00000615575 1357 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.75□□□□□ -0.85
KRTAP4-16G5E9R7 CNOT8-201ENST00000285896 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
KRTAP4-16G5E9R7 SF3B4-201ENST00000271628 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
KRTAP4-16G5E9R7 TRIM62-204ENST00000543586 1638 ntTSL 2 BASIC9.74□□□□□ -0.85
KRTAP4-16G5E9R7 SURF6-201ENST00000372022 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
KRTAP4-16G5E9R7 PWP2-201ENST00000291576 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
KRTAP4-16G5E9R7 PRSS8-201ENST00000317508 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
KRTAP4-16G5E9R7 ESR2-209ENST00000555278 1883 ntTSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
KRTAP4-16G5E9R7 HTR3E-202ENST00000415389 2139 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
KRTAP4-16G5E9R7 GPR152-201ENST00000312457 1429 ntAPPRIS P1 BASIC9.74□□□□□ -0.85
KRTAP4-16G5E9R7 AC087289.2-201ENST00000587267 1419 ntTSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
KRTAP4-16G5E9R7 COX6B2-201ENST00000326529 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
KRTAP4-16G5E9R7 PITX2-204ENST00000394595 1693 ntTSL 5 BASIC9.74□□□□□ -0.85
KRTAP4-16G5E9R7 KCNMA1-261ENST00000639486 8850 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.74□□□□□ -0.85
KRTAP4-16G5E9R7 AGFG1-201ENST00000310078 8668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
KRTAP4-16G5E9R7 GPD2-201ENST00000310454 6041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
KRTAP4-16G5E9R7 KCNH3-201ENST00000257981 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
KRTAP4-16G5E9R7 CCNY-202ENST00000339497 4630 ntTSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
KRTAP4-16G5E9R7 PITPNB-202ENST00000335272 2926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
KRTAP4-16G5E9R7 FDPS-201ENST00000356657 1478 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
KRTAP4-16G5E9R7 ZCCHC17-202ENST00000373714 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
KRTAP4-16G5E9R7 RIOX2-202ENST00000360258 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
KRTAP4-16G5E9R7 ST3GAL3-208ENST00000361392 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
KRTAP4-16G5E9R7 TIGD4-201ENST00000304337 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
KRTAP4-16G5E9R7 AC068946.1-202ENST00000318673 2745 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.74□□□□□ -0.85
KRTAP4-16G5E9R7 CCDC85A-201ENST00000407595 3982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
KRTAP4-16G5E9R7 CBARP-204ENST00000590083 4261 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
KRTAP4-16G5E9R7 LIMK2-203ENST00000340552 2789 ntTSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
KRTAP4-16G5E9R7 ZBTB17-201ENST00000375733 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
KRTAP4-16G5E9R7 GATB-209ENST00000512306 1519 ntTSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
KRTAP4-16G5E9R7 HSPB1-201ENST00000248553 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
KRTAP4-16G5E9R7 ELOF1-201ENST00000252445 1019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.74□□□□□ -0.85
KRTAP4-16G5E9R7 EIF4E-201ENST00000280892 1097 ntTSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
KRTAP4-16G5E9R7 OR52W1-201ENST00000311352 1114 ntAPPRIS P1 BASIC9.74□□□□□ -0.85
KRTAP4-16G5E9R7 GPHB5-201ENST00000314140 393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
KRTAP4-16G5E9R7 TMEM270-201ENST00000320531 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
KRTAP4-16G5E9R7 C11orf88-201ENST00000332814 795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC9.74□□□□□ -0.85
KRTAP4-16G5E9R7 DDT-201ENST00000350608 671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
KRTAP4-16G5E9R7 CCDC107-204ENST00000378409 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
KRTAP4-16G5E9R7 MAPK15-202ENST00000395107 834 ntTSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
KRTAP4-16G5E9R7 UFD1-202ENST00000399523 1007 ntTSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
KRTAP4-16G5E9R7 LINC00029-202ENST00000414668 1117 ntTSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
KRTAP4-16G5E9R7 HRAS-204ENST00000417302 1233 ntTSL 5 BASIC9.74□□□□□ -0.85
KRTAP4-16G5E9R7 MED15P5-201ENST00000423150 992 ntBASIC9.74□□□□□ -0.85
KRTAP4-16G5E9R7 HIST3H2BA-201ENST00000436555 524 ntBASIC9.74□□□□□ -0.85
KRTAP4-16G5E9R7 NME4-207ENST00000450036 985 ntTSL 3 BASIC9.74□□□□□ -0.85
KRTAP4-16G5E9R7 HRAS-205ENST00000451590 1151 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.74□□□□□ -0.85
KRTAP4-16G5E9R7 LINC01640-201ENST00000452505 550 ntTSL 4 BASIC9.74□□□□□ -0.85
KRTAP4-16G5E9R7 AL160313.1-201ENST00000502101 1039 ntTSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
KRTAP4-16G5E9R7 PP7080-204ENST00000510714 601 ntTSL 3 BASIC9.74□□□□□ -0.85
KRTAP4-16G5E9R7 FAM86HP-203ENST00000511564 521 ntTSL 2 BASIC9.74□□□□□ -0.85
KRTAP4-16G5E9R7 LINC02123-201ENST00000514869 885 ntTSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
KRTAP4-16G5E9R7 IGHV3-62-201ENST00000520057 340 ntBASIC9.74□□□□□ -0.85
KRTAP4-16G5E9R7 TMEM41B-203ENST00000527813 803 ntTSL 5 BASIC9.74□□□□□ -0.85
KRTAP4-16G5E9R7 BANF1P1-201ENST00000553684 263 ntBASIC9.74□□□□□ -0.85
KRTAP4-16G5E9R7 AL133352.1-203ENST00000557395 1234 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC9.74□□□□□ -0.85
KRTAP4-16G5E9R7 AP3S2-204ENST00000558011 738 ntTSL 3 BASIC9.74□□□□□ -0.85
KRTAP4-16G5E9R7 AC106730.1-201ENST00000566722 1090 ntBASIC9.74□□□□□ -0.85
KRTAP4-16G5E9R7 IL11-202ENST00000585513 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
KRTAP4-16G5E9R7 DM1-AS-201ENST00000586251 483 ntTSL 2 BASIC9.74□□□□□ -0.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.1 ms