Protein–RNA interactions for Protein: F5H4B4

FAM227A, Protein FAM227A, humanhuman

Predictions only

Length 570 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM227AF5H4B4 ADARB2-203ENST00000381312 8421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
FAM227AF5H4B4 PRKCZ-202ENST00000400921 2294 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
FAM227AF5H4B4 ZFAND6-207ENST00000558494 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
FAM227AF5H4B4 NRBP1-201ENST00000233557 2887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
FAM227AF5H4B4 FBLIM1-206ENST00000441801 1543 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
FAM227AF5H4B4 ATG9A-205ENST00000409618 4025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
FAM227AF5H4B4 JTB-201ENST00000271843 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
FAM227AF5H4B4 MRPL13-201ENST00000306185 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
FAM227AF5H4B4 VMA21-202ENST00000370361 693 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
FAM227AF5H4B4 HNRNPA3P1-201ENST00000401429 1139 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
FAM227AF5H4B4 RNASEH1-AS1-202ENST00000438436 1218 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
FAM227AF5H4B4 DNAJB6-209ENST00000443280 1159 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
FAM227AF5H4B4 ELP6-209ENST00000446787 894 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
FAM227AF5H4B4 TMEM176B-205ENST00000450753 1006 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
FAM227AF5H4B4 HNRNPA3P5-201ENST00000455201 833 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
FAM227AF5H4B4 PRICKLE2-AS1-203ENST00000476308 623 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
FAM227AF5H4B4 S100A6-205ENST00000496817 673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
FAM227AF5H4B4 AC106897.1-201ENST00000512874 394 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
FAM227AF5H4B4 TGIF2-C20orf24-201ENST00000558530 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
FAM227AF5H4B4 KCNQ2-204ENST00000359125 3253 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
FAM227AF5H4B4 ACSL1-202ENST00000454703 3636 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
FAM227AF5H4B4 ORAOV1-201ENST00000279147 2478 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
FAM227AF5H4B4 DUSP18-201ENST00000334679 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
FAM227AF5H4B4 FAM192A-201ENST00000309137 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
FAM227AF5H4B4 SRCIN1-215ENST00000621492 4644 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
FAM227AF5H4B4 ACE-202ENST00000290866 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
FAM227AF5H4B4 ARHGAP9-203ENST00000424809 2569 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
FAM227AF5H4B4 SLC22A16-202ENST00000368919 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
FAM227AF5H4B4 WDR45-202ENST00000356463 1688 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
FAM227AF5H4B4 TMEM161A-206ENST00000587583 1654 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
FAM227AF5H4B4 ARHGEF6-202ENST00000370620 4764 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
FAM227AF5H4B4 MRPL49-201ENST00000279242 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
FAM227AF5H4B4 DNM1-201ENST00000341179 3254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
FAM227AF5H4B4 C15orf62-201ENST00000344320 2370 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
FAM227AF5H4B4 PPT1-215ENST00000641471 2368 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
FAM227AF5H4B4 CCNY-202ENST00000339497 4630 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
FAM227AF5H4B4 SIK3-201ENST00000375300 6213 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
FAM227AF5H4B4 ARAP2-201ENST00000303965 7514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
FAM227AF5H4B4 KRT35-201ENST00000246639 1778 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
FAM227AF5H4B4 IL18BP-204ENST00000393703 1788 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0.01
FAM227AF5H4B4 MC1R-202ENST00000555147 3099 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0.01
FAM227AF5H4B4 TAGLN3-202ENST00000393917 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
FAM227AF5H4B4 FBXO22-202ENST00000453211 1486 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
FAM227AF5H4B4 AQP3-201ENST00000297991 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
FAM227AF5H4B4 EPS8L2-223ENST00000533256 3266 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
FAM227AF5H4B4 OCIAD1-202ENST00000381473 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
FAM227AF5H4B4 TLL1-204ENST00000507499 4818 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
FAM227AF5H4B4 ATE1-209ENST00000543447 4826 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
FAM227AF5H4B4 REXO1L1P-202ENST00000608646 1974 ntBASIC15.08■□□□□ 0
FAM227AF5H4B4 EIF5A-201ENST00000336452 1256 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
FAM227AF5H4B4 IFT20-202ENST00000357896 974 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
FAM227AF5H4B4 RBM3-202ENST00000376755 1130 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
FAM227AF5H4B4 AZGP1P1-201ENST00000411909 902 ntBASIC15.08■□□□□ 0
FAM227AF5H4B4 AC241585.1-201ENST00000433527 519 ntBASIC15.08■□□□□ 0
FAM227AF5H4B4 U52111.1-201ENST00000434284 914 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
FAM227AF5H4B4 HIST3H2BA-201ENST00000436555 524 ntBASIC15.08■□□□□ 0
FAM227AF5H4B4 TSPY16P-201ENST00000449843 468 ntBASIC15.08■□□□□ 0
FAM227AF5H4B4 LINC02437-201ENST00000505053 911 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
FAM227AF5H4B4 FBXO4-206ENST00000509134 1284 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
FAM227AF5H4B4 KLK3-204ENST00000593997 1035 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
FAM227AF5H4B4 AC010336.3-201ENST00000597156 667 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
FAM227AF5H4B4 AC073263.1-201ENST00000616370 494 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
FAM227AF5H4B4 UHRF2-201ENST00000276893 3452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
FAM227AF5H4B4 MYH14-204ENST00000440075 4247 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
FAM227AF5H4B4 CDK16-202ENST00000357227 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
FAM227AF5H4B4 PARD6G-201ENST00000353265 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
FAM227AF5H4B4 CACFD1-207ENST00000542192 2754 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
FAM227AF5H4B4 NPHP3-201ENST00000337331 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
FAM227AF5H4B4 IMPDH1-202ENST00000348127 2479 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
FAM227AF5H4B4 ZNF367-201ENST00000375256 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
FAM227AF5H4B4 OXCT1-AS1-201ENST00000508458 1731 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
FAM227AF5H4B4 HSPB7-204ENST00000411503 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
FAM227AF5H4B4 SYNRG-223ENST00000616179 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
FAM227AF5H4B4 NPBWR2-201ENST00000369768 1352 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
FAM227AF5H4B4 NT5C3A-204ENST00000405342 1759 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
FAM227AF5H4B4 CHRNB2-201ENST00000368476 5867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
FAM227AF5H4B4 NEDD4-202ENST00000435532 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
FAM227AF5H4B4 MAP1LC3B-201ENST00000268607 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
FAM227AF5H4B4 TCTN1-202ENST00000397655 1879 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
FAM227AF5H4B4 SNHG15-202ENST00000577700 3116 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
FAM227AF5H4B4 C16orf58-201ENST00000327237 2793 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
FAM227AF5H4B4 RPS19-206ENST00000598742 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
FAM227AF5H4B4 LOH12CR2-201ENST00000381800 1540 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
FAM227AF5H4B4 ROBO3-201ENST00000397801 4569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
FAM227AF5H4B4 ROBO3-220ENST00000538940 4551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
FAM227AF5H4B4 GDF2-201ENST00000581492 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
FAM227AF5H4B4 PXN-201ENST00000228307 3785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
FAM227AF5H4B4 PITPNM1-202ENST00000436757 4216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
FAM227AF5H4B4 SIK3-205ENST00000446921 3858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
FAM227AF5H4B4 MDGA1-203ENST00000434837 10736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
FAM227AF5H4B4 TRA2B-205ENST00000453386 2952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
FAM227AF5H4B4 TMPRSS4-201ENST00000437212 2074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
FAM227AF5H4B4 HM13-202ENST00000340852 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
FAM227AF5H4B4 ACOT7-204ENST00000377855 1614 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
FAM227AF5H4B4 ABLIM2-201ENST00000341937 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
FAM227AF5H4B4 DYNLL2-201ENST00000579991 6805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
FAM227AF5H4B4 MOXD1-202ENST00000367963 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
FAM227AF5H4B4 TRPM2-208ENST00000621064 1669 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
FAM227AF5H4B4 DCBLD1-202ENST00000338728 3626 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
FAM227AF5H4B4 TANK-202ENST00000392749 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.8 ms